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title: Jie Test4 |
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emoji: 🏃 |
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colorFrom: indigo |
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colorTo: purple |
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sdk: gradio |
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sdk_version: 3.4 |
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app_file: app.py |
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pinned: false |
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1. Sort 模块里，可以进行dlkcat，scores值的排序，选择相关文件，点击对应按钮，即可进行排序 |
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2. Pre Merge 模块里，进行smile 与 seq序列文件的合并， |
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如若序列文件中的单条序列不是在一行而是分为多行的，需处理换行符，在strip_file上传文件，点击strip按钮，会生成新的序列文件，并且注意文件除了末尾可以有一行空行，其余地方不能有多余的空行 |
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合并smile 与 seq 文件时，有两种情况： |
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一种是序列格式文件如下所示的： |
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>1J3U_A/1-468 Crystal structure of aspartase from Bacillus sp. YM55-1 [Bacillus sp. YM55-1] |
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MNTDVRIEKDFLGEKEIPKDAYYGVQTIRATENFPITGYRIHPELIKSLGIVKKSAALANMEVGLLDKEVGQ |
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YIVKAADEVIEGKWNDQFIVDPIQGGAGTSINMNANEVIANRALELMGEEKGNYSKISPNSHVNMSQSTNDA |
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FPTATHIAVLSLLNQLIETTKYMQQEFMKKADEFAGVIKMGRTHLQDAVPILLGQEFEAYARVIARDIERIA |
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NTRNNLYDINMGATAVGTGLNADPEYISIVTEHLAKFSGHPLRSAQHLVDATQNTDCYTEVSSALKVCMINM |
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SKIANDLRLMASGPRAGLSEIVLPARQPGSSIMPGKVNPVMPEVMNQVAFQVFGNDLTITSASEAGQFELNV |
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MEPVLFFNLIQSISIMTNVFKSFTENCLKGIKANEERMKEYVEKSIGIITAINPHVGYETAAKLAREAYLTG |
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ESIRELCIKYGVLTEEQLNEILNPYEMIHPGIAGRK |
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>WP_016839137.1/1-468 aspartate ammonia-lyase [Ureibacillus thermosphaericus] |
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MNTDVRIEKDFLGEKEIPKDAYYGVQTIRATENFPITGYRIHPELIKSLGIVKKSAALANMEVGLLDKEVGQ |
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YIVKAADEVIEGKWNDQFIVDPIQGGAGTSINMNANEVIANRALELMGEEKGNYSKISPNSHVNMSQSTNDA |
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合并时需要保存序列的来源这些相关信息，点击Merge All 按钮 |
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另一种点击Merge按钮 |
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3. Merge Dlsc 模块里，进行scores 与 Dlkcat文件的合并，合并时注意两个文件的序列相对应 |
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Check out the configuration reference at https://huggingface.co./docs/hub/spaces-config-reference |
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