tokens
sequence | tags
sequence |
---|---|
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"further",
"comprises",
"a",
"nucleotide",
"sequence",
"encoding",
"a",
"dendritic",
"cell",
"maturation",
"/",
"stimulatory",
"factor",
".",
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"dendritic",
"cell",
"maturation",
"/",
"stimulatory",
"factor",
"is",
"selected",
"from",
"the",
"group",
"consisting",
"of",
"GM",
"-",
"CSF",
",",
"IL-2",
",",
"IL-4",
",",
"IL-6",
",",
"IL-7",
",",
"IL-15",
",",
"IL-21",
",",
"IL-23",
",",
"TNFα",
",",
"B7.1",
",",
"B7.2",
",",
"4",
"-",
"1BB",
",",
"CD40",
"ligand",
",",
"and",
"drug",
"-",
"mducible",
"CD40",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"nucleotide",
"sequence",
"encoding",
"an",
"antigen",
"is",
"operably",
"linked",
"to",
"a",
"promoter",
"selected",
"from",
"the",
"group",
"consisting",
"of",
"the",
"human",
"Ubiquitin",
"-",
"C",
"promoter",
"(",
"UbiC",
")",
",",
"the",
"cytomegalovirus",
"immediate",
"early",
"promoter",
"(",
"CMV",
")",
",",
"the",
"Rous",
"sarcoma",
"virus",
"promoter",
"(",
"RSV",
")",
",",
"and",
"the",
"tetracycline",
"-",
"responsive",
"promoter",
".",
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"promoter",
"is",
"an",
"intron",
"-",
"deficient",
"promoter",
".",
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"intron",
"-",
"deficient",
"promoter",
"is",
"a",
"human",
"Ubiquitin",
"-",
"C",
"(",
"UbiC",
")",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"her",
"embodiment",
"all",
"of",
"those",
"carbon",
"atoms",
"are",
"in",
"the",
"S",
"stereochemistry",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"g",
"with",
"antibody",
"against",
"the",
"Sindbis",
"viral",
"envelope",
".",
"Figure",
"4A",
"illustrates",
"the",
"ability",
"of",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles",
"produced",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"400",
"µg",
"/",
"ml",
"DMNJ",
"or",
"various",
"concentrations",
"of",
"kifunensine",
"to",
"infect",
"HT1080",
"cells",
"stably",
"expressing",
"the",
"DC",
"-",
"SIGN",
"receptor",
".",
"Efficiency",
"of",
"infection",
"was",
"assessed",
"as",
"in",
"Figure",
"1",
".",
"Figure",
"4B",
"illustrates",
"the",
"results",
"of",
"an",
"experiment",
"to",
"determine",
"the",
"glycosylation",
"status",
"of",
"the",
"E2",
"glycoprotein",
"on",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles",
"produced",
"in",
"Figure",
"4A.Figure",
"5A",
"is",
"a",
"Western",
"blot",
"(",
"anti",
"-",
"HA",
")",
"of",
"HA",
"-",
"tagged",
"SIVmacVpx",
"expressed",
"in",
"293",
"T",
"cells",
".",
"was",
"cloned",
"into",
"a",
"mammalian",
"expression",
"vector",
"driven",
"by",
"a",
"CMV",
"promoter",
"(",
"construct",
"named",
"pENV",
"-",
"SIVmacVpx",
")",
".",
"Figure",
"5B",
"is",
"a",
"Western",
"blot",
"(",
"anti",
"-",
"HA",
")",
"of",
"viral",
"protein",
"extracts",
"from",
"viral",
"particles",
"comprising",
"HA",
"-",
"tagged",
"SIVmacVpx",
".",
"100ng",
"of",
"p24",
"was",
"loaded",
"per",
"well",
"onto",
"a",
"gel",
"for",
"immunoblotting",
"with",
"anti",
"-",
"HA",
"antibody",
".",
"Anti",
"-",
"p24",
"antibody",
"was",
"used",
"as",
"a",
"loading",
"control",
".",
"Figure",
"6",
"is",
"a",
"scatter",
"plot",
"of",
"transduction",
"events",
"measured",
"by",
"gating",
"on",
"dendritic",
"cells",
"that",
"were",
"positive",
"for",
"CD11c",
"and",
"assessing",
"the",
"percentage",
"of",
"cells",
"positive",
"for",
"GFP",
"(",
"x",
"-",
"axis",
";",
"as",
"a",
"result",
"of",
"infection",
"by",
"the",
"VSV",
"-",
"G",
"pseudotyped",
",",
"integration",
"-",
"defective",
"lentivirus",
"with",
"or",
"without",
"Vpx",
")",
"with",
"DC",
"-",
"SIGN",
"on",
"the",
"y",
"-",
"axis",
".",
"Figure",
"7",
"is",
"a",
"scatter",
"plot",
"of",
"transduction",
"events",
"measured",
"by",
"gating",
"on",
"dendritic",
"cells",
"that",
"were",
"positive",
"for",
"CD11c",
"and",
"assessing",
"the",
"percentage",
"of",
"cells",
"positive",
"for",
"GFP",
"(",
"x",
"-",
"axis",
";",
"as",
"a",
"result",
"of",
"infection",
"by",
"the",
"VSV",
"-",
"G",
"pseudotyped",
",",
"integrat"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"12",
":",
"A",
"portion",
"of",
"the",
"vector",
"genome",
"(",
"top",
")",
"is",
"represented",
"containing",
"long",
"terminal",
"repeats",
"(",
"LTR",
")",
"at",
"each",
"end",
".",
"The",
"splice",
"donor",
"(",
"SD",
")",
"and",
"splice",
"acceptor",
"(",
"SA",
")",
"sites",
"flank",
"the",
"psi",
"packaging",
"signal",
"(",
"Ψ",
")",
",",
"the",
"partial",
"gag",
"sequence",
"and",
"the",
"Rev",
"-",
"responsive",
"element",
"(",
"RRE",
")",
".",
"Components",
"between",
"the",
"antigen",
"promoter",
"(",
"Promoter",
")",
"and",
"the",
"3",
"'",
"LTR",
"are",
"not",
"highlighted",
"and",
"therefore",
"forward",
"slash",
"marks",
"(",
"//",
")",
"are",
"used",
".",
"A",
"portion",
"of",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"(",
"middle",
")",
"is",
"represented",
"showing",
"the",
"gag",
"(",
"black",
"box",
")",
"and",
"pol",
"(",
"grey",
"box",
")",
"genes",
"followed",
"by",
"the",
"RRE",
".",
"The",
"two",
"components",
"that",
"are",
"homologous",
"between",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"and",
"the",
"vector",
"genome",
"(",
"the",
"RRE",
"and",
"the",
"first",
"354",
"bp",
"of",
"gag",
")",
"are",
"represented",
"in",
"brackets",
"(",
"not",
"drawn",
"to",
"scale",
")",
".",
"The",
"hypothesized",
"region",
"of",
"recombination",
"between",
"the",
"vector",
"genome",
"and",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"are",
"shown",
"with",
"connecting",
"lines",
".",
"A",
"portion",
"of",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"(",
"bottom",
")",
"is",
"represented",
"showing",
"the",
"codon",
"-",
"optimized",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
"(",
"white",
"boxes",
"to",
"distinguish",
"from",
"wild",
"-",
"type",
")",
".",
"The",
"non",
"-",
"codon",
"-",
"optimized",
"frameshift",
"between",
"the",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
"is",
"represented",
"in",
"its",
"native",
"codon",
"sequence",
"(",
"overlapping",
"black",
"and",
"grey",
"boxes",
")",
".",
"Primers",
"used",
"for",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombination",
"assay",
"are",
"shown",
"with",
"their",
"approximate",
"locations",
"on",
"the",
"constructs",
".",
"First",
"round",
"PCR",
"primers",
"are",
"represented",
"with",
"closed",
"arrows",
"and",
"are",
"the",
"pairs",
"709",
"and",
"710",
"(",
"to",
"detect",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
")",
"or",
"709",
"and",
"378",
"(",
"to",
"detect",
"integrated",
"vector",
"genome",
")",
".",
"The",
"expected",
"amplicon",
"for",
"integrated",
"vector",
"with",
"primer",
"pairs",
"709",
"and",
"378",
"is",
"1697",
"bp",
".",
"The",
"nested",
"PCR",
"primers",
"ar"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"e",
"represented",
"with",
"open",
"arrows",
"and",
"are",
"the",
"pairs",
"863",
"and",
"835",
"(",
"to",
"detect",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"with",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
")",
"or",
"863",
"and",
"864",
"(",
"to",
"detect",
"psi",
"-",
"gag",
"recombination",
"with",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
")",
".",
"The",
"expected",
"amplicon",
"with",
"either",
"of",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"primer",
"pairs",
"is",
"937",
"bp",
".",
"Figure",
"13",
":",
"293",
"T",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"either",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"or",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"plasmids",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"either",
"Rev",
"plasmid",
"(",
"+",
")",
"or",
"empty",
"backbone",
"plasmid",
"(",
"-",
")",
".",
"Twenty",
"-",
"four",
"hours",
"later",
"cells",
"were",
"lysed",
"and",
"analyzed",
"for",
"expression",
"of",
"Gag",
"proteins",
"using",
"anti",
"-",
"p24",
"antibody",
".",
"Unprocessed",
"Gag",
"protein",
"(",
"p55",
")",
"and",
"p24",
"are",
"indicated",
"with",
"arrows",
".",
"Lysate",
"from",
"untransfected",
"cells",
"was",
"included",
"as",
"a",
"control",
".",
"Equal",
"loading",
"of",
"wells",
"was",
"confirmed",
"with",
"anti",
"-",
"actin",
"antibody",
".",
"Figure",
"14A",
":",
"GFP",
"-",
"encoding",
"vector",
"was",
"produced",
"with",
"two",
"plasmid",
"amounts",
"(",
"6",
"µg",
"or",
"3",
"µg",
")",
"of",
"either",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"or",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"Resulting",
"p24",
"levels",
"in",
"vector",
"supernatant",
"is",
"shown",
"in",
"the",
"table",
".",
"Figure",
"14B",
":",
"293",
"T",
"cells",
"were",
"transduced",
"with",
"2",
"-",
"fold",
"dilutions",
"of",
"vectors",
"produced",
"in",
"14A",
"and",
"analyzed",
"for",
"GFP",
"expression",
"after",
"2",
"days",
".",
"GFU",
"/",
"mL",
"were",
"calculated",
"and",
"plotted",
"on",
"the",
"y",
"-",
"axis",
".",
"The",
"µg",
"amount",
"of",
"gag",
"/",
"pol",
"plasmid",
"used",
"to",
"make",
"vector",
"(",
"6",
"µg",
"or",
"3",
"µg",
")",
"are",
"plotted",
"on",
"the",
"x",
"-",
"axis",
".",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"and",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"are",
"shown",
"in",
"black",
"or",
"white",
"columns",
"respectively",
".",
"Figure",
"15",
":",
"C57BL/6",
"mice",
"were",
"immunized",
"with",
"the",
"indicated",
"doses",
"(",
"2",
"×",
"107",
",",
"1",
"×",
"108",
",",
"or",
"5",
"×",
"108",
"TU",
")",
"of",
"LV",
"encoding",
"full",
"-",
"length",
"OVA",
"or",
"HBSS",
"vehicle",
"alone",
".",
"LVs",
"were",
"either",
"integration",
"-",
"competent",
"(",
"INT+",
")",
"or",
"integration",
"-",
"deficient",
"(",
"INT-",
")",
"and",
"gener"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term"
] |
[
"ed",
"(",
"1:1",
")",
",",
"or",
"with",
"1:100",
",",
"or",
"1:1000",
"dilutions",
"in",
"a",
"nested",
"PCR",
".",
"Primer",
"pairs",
"for",
"nested",
"PCR",
"were",
"either",
"863",
"and",
"835",
",",
"or",
"863",
"and",
"864",
".",
"The",
"former",
"pair",
"(",
"863",
",",
"835",
")",
"binds",
"in",
"the",
"vector",
"genome",
"and",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"respectively",
".",
"The",
"latter",
"pair",
"(",
"863",
",",
"864",
")",
"binds",
"in",
"the",
"vector",
"genome",
"and",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"All",
"primers",
"and",
"their",
"binding",
"sites",
"are",
"schematized",
"in",
"Figure",
"12",
".",
"Template",
"only",
"controls",
"were",
"included",
".",
"Resulting",
"nested",
"PCR",
"products",
"were",
"visualized",
"on",
"a",
"1",
"%",
"agarose",
"gel",
".",
"The",
"amplicon",
"size",
"of",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"is",
"shown",
"with",
"an",
"arrow",
".",
"Figure",
"17C",
":",
"The",
"band",
"from",
"the",
"nested",
"PCR",
"for",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"(",
"the",
"bright",
"band",
"below",
"1",
"kb",
")",
"was",
"cloned",
"into",
"a",
"TOPO",
"-",
"TA",
"vector",
"and",
"sequenced",
".",
"Sequence",
"of",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"band",
"is",
"shown",
"with",
"regions",
"marked",
"for",
"aligning",
"with",
"the",
"vector",
"genome",
",",
"partial",
"gag",
"or",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"Double",
"slashes",
"(",
"//",
")",
"and",
"dots",
"indicate",
"sequences",
"not",
"shown",
"for",
"simplicity",
".",
"Numbers",
"on",
"sequence",
"indicate",
"nucleotide",
"position",
"on",
"the",
"amplicon",
".",
"Base",
"pairs",
"1",
"-",
"414",
"of",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"aligns",
"with",
"the",
"vector",
"genome",
",",
"while",
"bp",
"120",
"-",
"937",
"aligns",
"with",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"For",
"reference",
",",
"the",
"partial",
"gag",
"sequence",
"is",
"bp",
"76",
"-",
"439",
"of",
"the",
"recombinant",
".",
"Figure",
"17D",
":",
"The",
"band",
"from",
"nested",
"PCR",
"for",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"(",
"faint",
"band",
"between",
"1",
"kb",
"and",
"3",
"kb",
")",
"was",
"cloned",
"into",
"a",
"TOPO",
"-",
"TA",
"vector",
"and",
"sequenced",
".",
"Sequence",
"of",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"recombinant",
"band",
"is",
"shown",
"with",
"regions",
"marked",
"for",
"aligning",
"with",
"the",
"vector",
"genome",
"or",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"Dots",
"indicate",
"sequences",
"not",
"shown",
"for",
"simplicity",
".",
"Numbers",
"on",
"sequence",
"indicate",
"nucleotide"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
" ",
"per",
"group",
")",
"were",
"injected",
"subcutaneously",
"in",
"the",
"footpad",
"with",
"3",
"×",
"1010",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"GFP",
",",
"control",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"a",
"non",
"-",
"fluorescent",
"protein",
",",
"or",
"left",
"untreated",
".",
"Four",
"days",
"later",
",",
"the",
"popliteal",
"and",
"cervical",
"lymph",
"nodes",
"were",
"separately",
"pooled",
"from",
"5",
"mice",
"(",
"3",
"pools",
"per",
"treatment",
"group",
")",
"and",
"analyzed",
"for",
"the",
"presence",
"of",
"GFP",
"-",
"expressing",
"cells",
".",
"(",
"A",
")",
"Live",
",",
"singlet",
"events",
"from",
"the",
"popliteal",
"(",
"draining",
")",
"or",
"cervical",
"(",
"non",
"-",
"draining",
")",
"lymph",
"nodes",
"were",
"analyzed",
"for",
"GFP",
"expression",
".",
"Popliteal",
"lymph",
"node",
"cells",
"from",
"naive",
"or",
"negative",
"control",
"ID",
"-",
"VP02",
"served",
"as",
"negative",
"controls",
".",
"(",
"B",
")",
"Frequency",
"of",
"CD11c",
"and",
"MHC",
"-",
"II",
"on",
"GFP+",
"events",
"from",
"the",
"popliteal",
"lymph",
"nodes",
"of",
"mice",
"injected",
"with",
"GFP",
"-",
"encoding",
"ID",
"-",
"VP02",
"are",
"shown",
"as",
"black",
"dots",
"overlayed",
"on",
"total",
"B220-",
"TCRβ-",
"events",
",",
"shown",
"in",
"gray",
",",
"as",
"a",
"reference",
".",
"(",
"C",
")",
"Expression",
"of",
"SIGNR1",
"on",
"GFP+",
"CD11c+",
"MHC",
"-",
"II+",
"events",
",",
"shown",
"with",
"(",
"left",
"panel",
")",
"and",
"without",
"(",
"right",
"panel",
")",
"inclusion",
"of",
"SIGNR1",
"-",
"specific",
"antibody",
".",
"Gate",
"statistics",
"are",
"the",
"mean",
"value",
"of",
"three",
"biological",
"replicates",
".",
"Values",
"in",
"panel",
"(",
"A",
")",
"are",
"number",
"of",
"positive",
"events",
"per",
"1",
"×",
"106",
"cells",
",",
"whereas",
"all",
"other",
"gate",
"values",
"are",
"percentages",
".",
"Figure",
"21",
":",
"C57BL/6",
"mice",
"(",
"3",
"per",
"group",
")",
"received",
"a",
"single",
"subcutaneous",
"injection",
"of",
"3",
"×",
"1010",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"at",
"the",
"base",
"of",
"the",
"tail",
".",
"Biodistribution",
",",
"as",
"determined",
"by",
"the",
"presence",
"of",
"reverse",
"-",
"transcribed",
"vector",
"DNA",
",",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"in",
"the",
"indicated",
"tissues",
"was",
"evaluated",
"by",
"quantitative",
"PCR",
"at",
"1",
",",
"4",
",",
"8",
",",
"21",
",",
"or",
"42",
"days",
"post",
"-",
"injection",
".",
"Inguinal",
"and",
"cervical",
"lymph",
"nodes",
"are",
"indicated",
"as",
"dr"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ry",
"of",
"each",
"population",
"was",
"compared",
"between",
"naïve",
"and",
"immunized",
"mice",
"to",
"calculate",
"specific",
"killing",
".",
"(",
"C",
")",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"10",
"per",
"group",
")",
"were",
"immunized",
"with",
"4",
"×",
"109",
"vector",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"OVA",
"-",
"AH1A5",
".",
"Four",
"weeks",
"later",
",",
"mice",
"were",
"injected",
"subcutaneously",
"with",
"8x104",
"CT26",
"tumor",
"cells",
"on",
"the",
"right",
"flank",
"and",
"mice",
"were",
"euthanized",
"when",
"tumors",
"exceeded",
"100",
"mm2",
".",
"(",
"D",
")",
"Therapeutic",
"immunization",
":",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"10",
"per",
"group",
")",
"were",
"injected",
"subcutaneously",
"with",
"8",
"×",
"104",
"CT26",
"tumor",
"cells",
".",
"Four",
"days",
"later",
",",
"mice",
"were",
"either",
"immunized",
"with",
"4x109",
"vector",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"OVA",
"-",
"AH1A5",
"or",
"left",
"untreated",
"and",
"mice",
"were",
"euthanized",
"when",
"tumors",
"exceeded",
"100",
"mm2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O"
] |
[
"Definitions"
] | [
"B-Term"
] |
[
"As",
"used",
"herein",
",",
"the",
"terms",
"\"",
"integration",
"deficient",
"\"",
"and",
"\"",
"integration",
"defective",
"\"",
"are",
"used",
"interchangeably",
".",
"An",
"integration",
"deficient",
"viral",
"vector",
"is",
"one",
"that",
"is",
"at",
"least",
"10",
"-",
"fold",
"(",
"preferably",
",",
"at",
"least",
"20",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"30",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"40",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"50",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"60",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"70",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"80",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"90",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"100",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"150",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"200",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"250",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"300",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"350",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"400",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"450",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"500",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"550",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"600",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"650",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"700",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"750",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"800",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"850",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"900",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"950",
"-",
"fold",
",",
"or",
"at",
"least",
"1000",
"-",
"fold",
")",
"less",
"efficient",
"at",
"integrating",
"than",
"an",
"integration",
"-",
"competent",
"viral",
"vector",
".",
"For",
"example",
",",
"integration",
"-",
"deficient",
"may",
"mean",
"at",
"least",
"about",
"20",
"-",
"fold",
"to",
"about",
"100",
"-",
"fold",
"less",
"efficient",
"at",
"integrating",
"than",
"a",
"viral",
"vector",
"which",
"has",
"not",
"been",
"modified",
"to",
"be",
"integration",
"defective",
".",
"Integration",
"can",
"be",
"measured",
"by",
"any",
"method",
"known",
"in",
"the",
"art",
",",
"e.g.",
",",
"by",
"PCR",
"detection",
"of",
"integration",
"events",
"near",
"an",
"Alu",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"The",
"Sindbis",
"virus",
"envelope",
"protein",
"contains",
"four",
"N",
"-",
"linked",
"glycans",
"-",
"two",
"on",
"the",
"E2",
"protein",
"and",
"two",
"on",
"the",
"E1",
"protein",
".",
"Two",
"N",
"-",
"glycans",
"of",
"the",
"virus",
"produced",
"in",
"mammalian",
"cells",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"a",
"mannosidase",
"I",
"inhibitor",
"have",
"a",
"high",
"-",
"mannose",
"structure",
"(",
"one",
"E2",
"N",
"-",
"linked",
"glycan",
"and",
"one",
"E1",
"N",
"-",
"linked",
"glycan",
")",
",",
"while",
"the",
"remaining",
"two",
"have",
"a",
"complex",
"structure",
".",
"The",
"two",
"complex",
"structure",
"N",
"-",
"glycans",
"are",
"exposed",
"on",
"the",
"surface",
"of",
"the",
"envelope",
"protein",
",",
"while",
"the",
"two",
"high",
"-",
"mannose",
"structure",
"N",
"-",
"glycans",
"are",
"buried",
"within",
"the",
"center",
"of",
"the",
"trimer",
"of",
"the",
"envelope",
"proteins",
".",
"See",
"Morizono",
"et",
"al",
".",
",",
"J",
"Virol",
",",
"84:14",
",",
"6923",
"-",
"34",
"(",
"2010",
")",
",",
"incorporated",
"by",
"reference",
".",
"Accordingly",
",",
"typically",
"50",
"%",
"of",
"the",
"N",
"-",
"linked",
"glycans",
"on",
"a",
"viral",
"particle",
"with",
"a",
"Sindbis",
"virus",
"glycoprotein",
"produced",
"in",
"mammalian",
"cells",
"would",
"have",
"the",
"high",
"-",
"mannose",
"structure",
".",
"A",
"\"",
"highly",
"mannosylated",
"\"",
"viral",
"particle",
"is",
"a",
"particle",
"wherein",
"at",
"least",
"60",
"%",
",",
"at",
"least",
"70",
"%",
",",
"at",
"least",
"80",
"%",
",",
"at",
"least",
"90",
"%",
",",
"at",
"least",
"95",
"%",
",",
"at",
"least",
"99",
"%",
",",
"or",
"100",
"%",
"of",
"N",
"-",
"linked",
"glycans",
"on",
"the",
"viral",
"envelope",
"glycoproteins",
"comprise",
"at",
"least",
"a",
"Man5",
"structure",
",",
"preferably",
"Man9",
",",
"measured",
"by",
",",
"for",
"example",
",",
"mass",
"spectrometry",
"(",
"see",
"Crispin",
"et",
"al",
".",
",",
"JBC",
"2009",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Arthropod",
"-",
"borne",
"viruses",
"(",
"Arboviruses",
")",
"are",
"viruses",
"that",
"are",
"transmitted",
"to",
"a",
"host",
",",
"such",
"as",
"humans",
",",
"horses",
",",
"or",
"birds",
"by",
"an",
"infected",
"arthropod",
"vector",
"such",
"as",
"a",
"mosquito",
".",
"Arboviruses",
"are",
"further",
"divided",
"into",
"sub",
"-",
"families",
"of",
"viruses",
"including",
"alphaviruses",
"and",
"flaviviruses",
",",
"which",
"have",
"a",
"single",
"-",
"stranded",
"RNA",
"genome",
"of",
"positive",
"polarity",
"and",
"a",
"glycoprotein",
"-",
"containing",
"envelope",
".",
"For",
"example",
",",
"dengue",
"fever",
"virus",
",",
"yellow",
"fever",
"virus",
"and",
"West",
"Nile",
"virus",
"belong",
"to",
"the",
"flavivirus",
"family",
",",
"and",
"Sindbis",
"virus",
",",
"Semliki",
"Forest",
"virus",
"and",
"Venezuelan",
"Equine",
"Encephalitis",
"virus",
",",
"are",
"members",
"of",
"the",
"alphavirus",
"family",
"(",
"Wang",
"et",
"al",
".",
"J.",
"Virol",
".",
"66",
",",
"4992",
"(",
"1992",
")",
")",
".",
"The",
"envelope",
"of",
"Sindbis",
"virus",
"includes",
"two",
"transmembrane",
"glycoproteins",
"(",
"Mukhopadhyay",
"et",
"al",
".",
"Nature",
"Rev.",
"Microbio",
".",
"3",
",",
"13",
"(",
"2005",
")",
"):",
"E1",
",",
"believed",
"to",
"be",
"responsible",
"for",
"fusion",
",",
"and",
"E2",
",",
"believed",
"to",
"be",
"responsible",
"for",
"cell",
"binding",
".",
"Sindbis",
"virus",
"envelope",
"glycoproteins",
"are",
"known",
"to",
"pseudotype",
"other",
"retroviruses",
",",
"including",
"oncoretroviruses",
"and",
"lentiviruses",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"use",
"of",
"the",
"terms",
"\"",
"attachment",
",",
"\"",
"\"",
"binding",
",",
"\"",
"\"",
"targeting",
"\"",
"and",
"the",
"like",
"are",
"used",
"interchangeably",
"and",
"are",
"not",
"meant",
"to",
"indicate",
"a",
"mechanism",
"of",
"the",
"interaction",
"between",
"Sindbis",
"virus",
"envelope",
"glycoprotein",
"and",
"a",
"cellular",
"component",
".",
"DC",
"-",
"SIGN",
"(",
"Dendritic",
"Cell",
"Specific",
"ICAM-3",
"(",
"Intracellular",
"Adhesion",
"Molecules",
"3)-Grabbing",
"Nonintegrin",
";",
"also",
"known",
"as",
"CD209",
")",
"is",
"a",
"C",
"-",
"type",
"lectin",
"-",
"like",
"receptor",
"capable",
"of",
"rapid",
"binding",
"and",
"endocytosis",
"of",
"materials",
"(",
"Geijtenbeek",
",",
"T.",
"B.",
",",
"et",
"al",
".",
"Annu",
".",
"Rev.",
"Immunol",
".",
"22",
":",
"33",
"-",
"54",
",",
"2004",
")",
".",
"E2",
"appears",
"to",
"target",
"virus",
"to",
"dendritic",
"cells",
"through",
"DC",
"-",
"SIGN",
".",
"As",
"shown",
"herein",
",",
"cells",
"expressing",
"DC",
"-",
"SIGN",
"are",
"transduced",
"by",
"viral",
"vector",
"particles",
"pseudotyped",
"with",
"Sindbis",
"virus",
"E2",
"better",
"(",
"at",
"least",
"2",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"3",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"4",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"5",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"6",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"7",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"8",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"9",
"-",
"fold",
",",
"or",
"at",
"least",
"10",
"-",
"fold",
"better",
")",
"than",
"isogenic",
"cells",
"that",
"do",
"n't",
"express",
"DC",
"-",
"SIGN",
".",
"The",
"mechanism",
"of",
"how",
"E2",
"glycoprotein",
"facilitates",
"viral",
"infection",
"appears",
"to",
"involve",
"DC",
"-",
"SIGN",
",",
"possibly",
"through",
"direct",
"binding",
"to",
"DC",
"-",
"SIGN",
"or",
"causing",
"a",
"change",
"in",
"conformation",
"or",
"some",
"other",
"mechanism",
".",
"Regardless",
"of",
"the",
"actual",
"mechanism",
",",
"the",
"targeting",
"by",
"E2",
"is",
"preferential",
"for",
"cells",
"expressing",
"DC",
"-",
"SIGN",
",",
"namely",
"dendritic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"alpain",
")",
",",
"metalloendopeptidases",
",",
"(",
"e.g.",
",",
"collagenase",
",",
"thermolysin",
")",
",",
"serine",
"endopeptidases",
"(",
"e.g.",
",",
"chymotrypsin",
",",
"factor",
"IXa",
",",
"factor",
"X",
",",
"thrombin",
",",
"trypsin",
")",
",",
"streptokinases",
".",
"The",
"recognition",
"and",
"cleavage",
"site",
"sequences",
"for",
"these",
"enzymes",
"are",
"well",
"known",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"promoter",
"may",
"be",
"obtained",
",",
"for",
"example",
",",
"from",
"the",
"genomes",
"of",
"viruses",
"such",
"as",
"polyoma",
"virus",
",",
"fowlpox",
"virus",
",",
"adenovirus",
",",
"bovine",
"papilloma",
"virus",
",",
"avian",
"sarcoma",
"virus",
",",
"cytomegalovirus",
",",
"a",
"retrovirus",
",",
"hepatitis",
"-",
"B",
"virus",
"and",
"Simian",
"Virus",
"40",
"(",
"SV40",
")",
".",
"The",
"promoter",
"may",
"also",
"be",
",",
"for",
"example",
",",
"a",
"heterologous",
"mammalian",
"promoter",
",",
"e.g.",
",",
"the",
"actin",
"promoter",
"or",
"an",
"immunoglobulin",
"promoter",
",",
"a",
"heat",
"-",
"shock",
"promoter",
",",
"or",
"the",
"promoter",
"normally",
"associated",
"with",
"the",
"native",
"sequence",
",",
"provided",
"such",
"promoters",
"are",
"compatible",
"with",
"the",
"target",
"cell",
".",
"In",
"one",
"embodiment",
",",
"the",
"promoter",
"is",
"the",
"naturally",
"occurring",
"viral",
"promoter",
"in",
"a",
"viral",
"expression",
"system",
".",
"In",
"some",
"embodiments",
",",
"the",
"promoter",
"is",
"a",
"dendritic",
"cell",
"-",
"specific",
"promoter",
".",
"The",
"dendritic",
"cell",
"-",
"specific",
"promoter",
"can",
"be",
",",
"for",
"example",
",",
"CD11c",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"Transcription",
"may",
"be",
"increased",
"by",
"inserting",
"an",
"enhancer",
"sequence",
"into",
"the",
"vector(s",
")",
".",
"Enhancers",
"are",
"typically",
"cis",
"-",
"acting",
"elements",
"of",
"DNA",
",",
"usually",
"about",
"10",
"to",
"300",
"bp",
"in",
"length",
",",
"that",
"act",
"on",
"a",
"promoter",
"to",
"increase",
"its",
"transcription",
".",
"Many",
"enhancer",
"sequences",
"are",
"now",
"known",
"from",
"mammalian",
"genes",
"(",
"globin",
",",
"elastase",
",",
"albumin",
",",
"alpha",
"-",
"fetoprotein",
",",
"and",
"insulin",
")",
"and",
"from",
"eukaryotic",
"cell",
"viruses",
".",
"Examples",
"include",
"the",
"SV40",
"enhancer",
"on",
"the",
"late",
"side",
"of",
"the",
"replication",
"origin",
"(",
"bp",
"100",
"-",
"270",
")",
",",
"the",
"cytomegalovirus",
"early",
"promoter",
"enhancer",
",",
"the",
"polyoma",
"enhancer",
"on",
"the",
"late",
"side",
"of",
"the",
"replication",
"origin",
",",
"and",
"adenovirus",
"enhancers",
".",
"The",
"enhancer",
"may",
"be",
"spliced",
"into",
"the",
"vector",
"at",
"a",
"position",
"5",
"'",
"or",
"3",
"'",
"to",
"the",
"antigen",
"-",
"specific",
"polynucleotide",
"sequence",
",",
"but",
"is",
"preferably",
"located",
"at",
"a",
"site",
"5",
"'",
"from",
"the",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tumor",
"-",
"associated",
"antigens",
"are",
"known",
"for",
"a",
"variety",
"of",
"cancers",
"including",
",",
"for",
"example",
",",
"renal",
"cell",
"carcinoma",
",",
"prostate",
"cancer",
",",
"melanoma",
",",
"and",
"breast",
"cancer",
".",
"In",
"some",
"breast",
"cancers",
",",
"for",
"example",
",",
"the",
"Her-2",
"receptor",
"is",
"overexpressed",
"on",
"the",
"surface",
"of",
"cancerous",
"cells",
".",
"Exemplary",
"tumor",
"antigens",
"include",
",",
"but",
"are",
"not",
"limited",
"to",
",",
"MAGE",
",",
"e.g.",
",",
"MAGE",
"-",
"A3",
"and",
"MAGE",
"-",
"A1",
",",
"BAGE",
",",
"RAGE",
",",
"and",
"NY",
"-",
"ESO-1",
",",
"which",
"are",
"unmutated",
"antigens",
"expressed",
"in",
"the",
"immune",
"-",
"privileged",
"areas",
"of",
"the",
"testes",
"and",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"tumor",
"cells",
";",
"lineage",
"-",
"specific",
"tumor",
"antigens",
"such",
"as",
"the",
"melanocyte",
"-",
"melanoma",
"lineage",
"antigens",
",",
"MART-1",
"/",
"Melan",
"-",
"A",
",",
"gp100",
",",
"gp75",
",",
"mda-7",
",",
"tyrosinase",
"and",
"tyrosinase",
"-",
"related",
"protein",
",",
"e.g.",
",",
"TRP2",
";",
"renal",
"cell",
"carcinoma",
"-",
"5T4",
",",
"SM22",
"-",
"alpha",
",",
"carbonic",
"anhydrases",
"I",
"and",
"IX",
"(",
"also",
"known",
"as",
"G250",
")",
",",
"hypoxia",
"-",
"inducible",
"factors",
"(",
"e.g.",
",",
"HIF-1alpha",
"and",
"HIF-2alpha",
")",
",",
"VEGF",
"or",
"prostate",
"specific",
"membrane",
"antigen",
"(",
"PSMA",
")",
",",
"prostate",
"-",
"specific",
"antigen",
"(",
"PSA",
")",
",",
"prostatic",
"acid",
"phosphates",
",",
"and",
"six",
"-",
"transmembrane",
"epoithelial",
"antigen",
"of",
"the",
"prostate",
"(",
"STEAP",
")",
",",
"NKX3.1",
",",
"which",
"are",
"antigens",
"expressed",
"in",
"normal",
"and",
"neoplastic",
"cells",
"derived",
"from",
"the",
"same",
"tissue",
";",
"epitope",
"proteins",
"/",
"peptides",
"derived",
"from",
"genes",
"mutated",
"in",
"tumor",
"cells",
"or",
"genes",
"transcribed",
"at",
"different",
"levels",
"in",
"tumor",
"compared",
"to",
"normal",
"cells",
",",
"such",
"as",
"telomerase",
"enzyme",
",",
"survivin",
",",
"mesothelin",
",",
"mutated",
"ras",
",",
"bcr",
"/",
"abl",
"rearrangement",
",",
"Her2",
"/",
"neu",
",",
"mutated",
"or",
"wild",
"-",
"type",
"p53",
",",
"cytochrome",
"P450",
"1B1",
",",
"and",
"abnormally",
"expressed",
"intron",
"sequences",
"such",
"as",
"N",
"-",
"acetylglucosaminyltransferase",
"-",
"V",
";",
"clonal",
"rearrangements",
"of",
"immunogl"
] | [
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"is",
"derived",
"from",
"HIV-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"further",
"comprises",
"a",
"nucleotide",
"sequence",
"encoding",
"a",
"dendritic",
"cell",
"maturation",
"/",
"stimulatory",
"factor",
".",
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"dendritic",
"cell",
"maturation",
"/",
"stimulatory",
"factor",
"is",
"selected",
"from",
"the",
"group",
"consisting",
"of",
"GM",
"-",
"CSF",
",",
"IL-2",
",",
"IL-4",
",",
"IL-6",
",",
"IL-7",
",",
"IL-15",
",",
"IL-21",
",",
"IL-23",
",",
"TNFα",
",",
"B7.1",
",",
"B7.2",
",",
"4",
"-",
"1BB",
",",
"CD40",
"ligand",
",",
"and",
"drug",
"-",
"mducible",
"CD40",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"composition",
"further",
"comprises",
"an",
"adjuvant",
".",
"For",
"example",
",",
"as",
"disclosed",
"herein",
",",
"adjuvants",
"include",
"alum",
",",
"or",
"3",
"De",
"-",
"O",
"-",
"acylated",
"monophosphoryl",
"lipid",
"A",
"(",
"MPL",
")",
".",
"Classes",
"of",
"adjuvants",
"disclosed",
"herein",
"include",
"(",
"a",
")",
"aluminum",
"salts",
",",
"(",
"b",
")",
"oil",
"-",
"in",
"-",
"water",
"emulsion",
"formulations",
",",
"optionally",
"with",
"or",
"without",
"other",
"specific",
"immunostimulating",
"agents",
"such",
"as",
"muramyl",
"peptides",
"or",
"other",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"components",
",",
"(",
"c",
")",
"saponin",
"adjuvants",
",",
"including",
"ISCOMs",
"(",
"immunostimulating",
"complexes",
")",
"and",
"ISCOMATRIX",
";",
"(",
"d",
")",
"Complete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"CFA",
")",
"and",
"Incomplete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"IFA",
")",
";",
"(",
"e",
")",
"cytokines",
";",
"and",
"(",
"f",
")",
"adjuvants",
"of",
"formula",
"(",
"I).wherein",
"the",
"moieties",
"A1",
"and",
"A2",
"are",
"independently",
"selected",
"from",
"the",
"group",
"of",
"hydrogen",
",",
"phosphate",
",",
"and",
"phosphate",
"salts",
".",
"Sodium",
"and",
"potassium",
"are",
"exemplary",
"counterions",
"for",
"the",
"phosphate",
"salts",
".",
"The",
"moieties",
"R1",
",",
"R2",
",",
"R3",
",",
"R4",
",",
"R5",
",",
"and",
"R6",
"are",
"independently",
"selected",
"from",
"the",
"group",
"of",
"hydrocarbyl",
"having",
"3",
"to",
"23",
"carbons",
",",
"represented",
"by",
"C3",
"-",
"C23",
".",
"For",
"added",
"clarity",
"it",
"will",
"be",
"explained",
"that",
"when",
"a",
"moiety",
"is",
"\"",
"independently",
"selected",
"from",
"\"",
"a",
"specified",
"group",
"having",
"multiple",
"members",
",",
"it",
"should",
"be",
"understood",
"that",
"the",
"member",
"chosen",
"for",
"the",
"first",
"moiety",
"does",
"not",
"in",
"any",
"way",
"impact",
"or",
"limit",
"the",
"choice",
"of",
"the",
"member",
"selected",
"for",
"the",
"second",
"moiety",
".",
"The",
"carbon",
"atoms",
"to",
"which",
"R1",
",",
"R3",
",",
"R5",
"and",
"R6",
"are",
"joined",
"are",
"asymmetric",
",",
"and",
"thus",
"may",
"exist",
"in",
"either",
"the",
"R",
"or",
"S",
"stereochemistry",
".",
"In",
"one",
"embodiment",
"all",
"of",
"those",
"carbon",
"atoms",
"are",
"in",
"the",
"R",
"stereochemistry",
",",
"while",
"in",
"anot"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"B-Term",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"her",
"embodiment",
"all",
"of",
"those",
"carbon",
"atoms",
"are",
"in",
"the",
"S",
"stereochemistry",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"certain",
"options",
",",
"each",
"of",
"E2",
"through",
"E10",
"is",
"combined",
"with",
"embodiment",
"E1",
",",
"and/or",
"the",
"hydrocarbyl",
"groups",
"of",
"E2",
"through",
"E9",
"are",
"alkyl",
"groups",
",",
"preferably",
"straight",
"chain",
"alkyl",
"groups",
".",
"A",
"preferred",
"adjuvant",
"is",
"E1",
"in",
"combination",
"with",
"E10",
",",
"where",
"(",
"i",
")",
"A1",
"is",
"phosphate",
"or",
"phosphate",
"salt",
"and",
"A2",
"is",
"hydrogen",
"and",
"(",
"ii",
")",
"R1",
",",
"R3",
",",
"R5",
"and",
"R6",
"are",
"undecyl",
"and",
"R2",
"and",
"R4",
"are",
"tridecyl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"envelope",
"glycoproteins",
"also",
"bind",
"cells",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"of",
"the",
"embodiments",
"described",
"herein",
",",
"the",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles",
"also",
"more",
"efficiently",
"transduce",
"cells",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"compared",
"to",
"cells",
"not",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"e",
"represented",
"with",
"open",
"arrows",
"and",
"are",
"the",
"pairs",
"863",
"and",
"835",
"(",
"to",
"detect",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"with",
"the",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
")",
"or",
"863",
"and",
"864",
"(",
"to",
"detect",
"psi",
"-",
"gag",
"recombination",
"with",
"the",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
")",
".",
"The",
"expected",
"amplicon",
"with",
"either",
"of",
"the",
"psi",
"-",
"gag",
"recombinant",
"primer",
"pairs",
"is",
"937",
"bp",
".",
"Figure",
"13",
":",
"293",
"T",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"either",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"or",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"plasmids",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"either",
"Rev",
"plasmid",
"(",
"+",
")",
"or",
"empty",
"backbone",
"plasmid",
"(",
"-",
")",
".",
"Twenty",
"-",
"four",
"hours",
"later",
"cells",
"were",
"lysed",
"and",
"analyzed",
"for",
"expression",
"of",
"Gag",
"proteins",
"using",
"anti",
"-",
"p24",
"antibody",
".",
"Unprocessed",
"Gag",
"protein",
"(",
"p55",
")",
"and",
"p24",
"are",
"indicated",
"with",
"arrows",
".",
"Lysate",
"from",
"untransfected",
"cells",
"was",
"included",
"as",
"a",
"control",
".",
"Equal",
"loading",
"of",
"wells",
"was",
"confirmed",
"with",
"anti",
"-",
"actin",
"antibody",
".",
"Figure",
"14A",
":",
"GFP",
"-",
"encoding",
"vector",
"was",
"produced",
"with",
"two",
"plasmid",
"amounts",
"(",
"6",
"µg",
"or",
"3",
"µg",
")",
"of",
"either",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"or",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
".",
"Resulting",
"p24",
"levels",
"in",
"vector",
"supernatant",
"is",
"shown",
"in",
"the",
"table",
".",
"Figure",
"14B",
":",
"293",
"T",
"cells",
"were",
"transduced",
"with",
"2",
"-",
"fold",
"dilutions",
"of",
"vectors",
"produced",
"in",
"14A",
"and",
"analyzed",
"for",
"GFP",
"expression",
"after",
"2",
"days",
".",
"GFU",
"/",
"mL",
"were",
"calculated",
"and",
"plotted",
"on",
"the",
"y",
"-",
"axis",
".",
"The",
"µg",
"amount",
"of",
"gag",
"/",
"pol",
"plasmid",
"used",
"to",
"make",
"vector",
"(",
"6",
"µg",
"or",
"3",
"µg",
")",
"are",
"plotted",
"on",
"the",
"x",
"-",
"axis",
".",
"WT",
"gag",
"/",
"pol",
"and",
"RI",
"gag",
"/",
"pol",
"are",
"shown",
"in",
"black",
"or",
"white",
"columns",
"respectively",
".",
"Figure",
"15",
":",
"C57BL/6",
"mice",
"were",
"immunized",
"with",
"the",
"indicated",
"doses",
"(",
"2",
"×",
"107",
",",
"1",
"×",
"108",
",",
"or",
"5",
"×",
"108",
"TU",
")",
"of",
"LV",
"encoding",
"full",
"-",
"length",
"OVA",
"or",
"HBSS",
"vehicle",
"alone",
".",
"LVs",
"were",
"either",
"integration",
"-",
"competent",
"(",
"INT+",
")",
"or",
"integration",
"-",
"deficient",
"(",
"INT-",
")",
"and",
"gener"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term"
] |
[
"6",
"mice",
"(",
"5",
"per",
"group",
")",
"were",
"immunized",
"with",
"5",
"×",
"1010",
",",
"1",
"×",
"1010",
",",
"or",
"2",
"×",
"109",
"vector",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"a",
"polyepitope",
"antigen",
"(",
"LV1b",
")",
"that",
"contains",
"the",
"H-2b",
"-",
"restricted",
"OVA257",
"and",
"LCMV",
"GP33",
"CD8",
"T",
"cell",
"epitopes",
"and",
"then",
"challenged",
"on",
"day",
"35",
"post",
"-",
"immunization",
"with",
"1",
"×",
"107",
"TCID50",
"wild",
"-",
"type",
"WR",
"-",
"strain",
"vaccine",
"virus",
"(",
"VV",
"-",
"WT",
")",
",",
"WR",
"-",
"strain",
"recombinant",
"OVA",
"vaccine",
"virus",
"(",
"rVV",
"-",
"OVA",
")",
",",
"or",
"left",
"unchallenged",
".",
"On",
"day",
"40",
"(",
"day",
"5",
"post",
"-",
"challenge",
")",
"splenic",
"CD8",
"T",
"cell",
"responses",
"and",
"viral",
"load",
"in",
"the",
"ovaries",
"were",
"measured",
".",
"(",
"B",
")",
"OVA257-",
"and",
"LCMV",
"GP33",
"-",
"specitic",
"CD8",
"T",
"cell",
"responses",
"were",
"measured",
"by",
"staining",
"for",
"intracellular",
"IFN",
"-",
"γ",
"and",
"TNF",
"-",
"α",
"after",
"ex",
"vivo",
"peptide",
"restimulation",
".",
"Representative",
"dot",
"plots",
"of",
"the",
"CD8",
"T",
"cell",
"cytokine",
"profile",
"is",
"shown",
".",
"(",
"C",
")",
"Frequency",
"of",
"OVA-257",
"-",
"specific",
"IFN",
"-",
"γ+",
"CD8",
"T",
"cells",
"for",
"each",
"animal",
".",
"(",
"D",
")",
"Viral",
"load",
"(",
"measured",
"by",
"TCID50",
"assay",
")",
"within",
"the",
"ovaries",
"of",
"each",
"animal",
".",
"Figure",
"24",
":",
"(",
"A",
")",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"5",
"per",
"group",
")",
"were",
"immunized",
"with",
"indicated",
"doses",
",",
"in",
"vector",
"genomes",
",",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"AH1A5",
",",
"a",
"heteroclitic",
"mutant",
"of",
"the",
"endogenous",
"CT26",
"tumor",
"rejection",
"epitope",
"AH1",
",",
"linked",
"to",
"OVA",
"(",
"OVA",
"-",
"AH1A5",
")",
"or",
"HBSS",
"vehicle",
"alone",
".",
"At",
"day",
"12",
"post",
"immunization",
",",
"the",
"percentage",
"of",
"AH1A5-",
"or",
"AH1",
"-",
"specific",
"splenic",
"CD8",
"T",
"cells",
"was",
"measured",
"by",
"ICS",
".",
"(",
"B",
")",
"Twelve",
"days",
"after",
"immunization",
",",
"a",
"1:1:1",
"mixture",
"of",
"dye",
"-",
"labeled",
"target",
"cells",
"each",
"pulsed",
"with",
"AH1",
",",
"AH1A5",
",",
"or",
"a",
"control",
"peptide",
"were",
"transferred",
"intravenously",
"into",
"immunized",
"and",
"naive",
"mice",
"(",
"3",
"per",
"group",
")",
".",
"The",
"following",
"day",
",",
"spleens",
"were",
"harvested",
"and",
"the",
"relative",
"recove"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ry",
"of",
"each",
"population",
"was",
"compared",
"between",
"naïve",
"and",
"immunized",
"mice",
"to",
"calculate",
"specific",
"killing",
".",
"(",
"C",
")",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"10",
"per",
"group",
")",
"were",
"immunized",
"with",
"4",
"×",
"109",
"vector",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"OVA",
"-",
"AH1A5",
".",
"Four",
"weeks",
"later",
",",
"mice",
"were",
"injected",
"subcutaneously",
"with",
"8x104",
"CT26",
"tumor",
"cells",
"on",
"the",
"right",
"flank",
"and",
"mice",
"were",
"euthanized",
"when",
"tumors",
"exceeded",
"100",
"mm2",
".",
"(",
"D",
")",
"Therapeutic",
"immunization",
":",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"10",
"per",
"group",
")",
"were",
"injected",
"subcutaneously",
"with",
"8",
"×",
"104",
"CT26",
"tumor",
"cells",
".",
"Four",
"days",
"later",
",",
"mice",
"were",
"either",
"immunized",
"with",
"4x109",
"vector",
"genomes",
"of",
"ID",
"-",
"VP02",
"encoding",
"OVA",
"-",
"AH1A5",
"or",
"left",
"untreated",
"and",
"mice",
"were",
"euthanized",
"when",
"tumors",
"exceeded",
"100",
"mm2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O"
] |
[
"The",
"term",
"\"",
"variant",
"\"",
"when",
"used",
"in",
"reference",
"to",
"a",
"polypeptide",
"means",
"a",
"polypeptide",
"that",
"has",
"one",
"or",
"more",
"substitutions",
",",
"deletions",
"or",
"insertions",
"relative",
"to",
"a",
"parent",
"polypeptide",
".",
"In",
"some",
"contexts",
",",
"the",
"variant",
"is",
"one",
"that",
"retains",
"the",
"desired",
"activity",
".",
"When",
"used",
"in",
"reference",
"to",
"a",
"Vpx",
"protein",
",",
"\"",
"functional",
"variant",
"\"",
"means",
"a",
"variant",
"that",
"retains",
"the",
"ability",
"to",
"inhibit",
"the",
"activity",
"of",
"SAMHD1",
".",
"The",
"term",
"may",
"analogously",
"be",
"applied",
"to",
"polynucleotides",
"that",
"have",
"one",
"or",
"more",
"substitutions",
",",
"deletions",
"or",
"insertions",
"relative",
"to",
"a",
"parent",
"polynucleotide",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"As",
"used",
"herein",
",",
"the",
"term",
"\"",
"conservative",
"amino",
"acid",
"substitution",
"\"",
"is",
"the",
"replacement",
"of",
"one",
"amino",
"acid",
"with",
"another",
"amino",
"acid",
"having",
"similar",
"properties",
",",
"e.g.",
"size",
",",
"charge",
",",
"hydrophobicity",
",",
"hydrophilicity",
",",
"and/or",
"aromaticity",
",",
"and",
"includes",
"exchanges",
"as",
"indicated",
"below",
":"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Amino",
"acid",
"residues",
"which",
"share",
"common",
"side",
"-",
"chain",
"properties",
"are",
"often",
"grouped",
"as",
"follows",
"."
] | [
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"used",
"herein",
",",
"the",
"terms",
"\"",
"integration",
"deficient",
"\"",
"and",
"\"",
"integration",
"defective",
"\"",
"are",
"used",
"interchangeably",
".",
"An",
"integration",
"deficient",
"viral",
"vector",
"is",
"one",
"that",
"is",
"at",
"least",
"10",
"-",
"fold",
"(",
"preferably",
",",
"at",
"least",
"20",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"30",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"40",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"50",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"60",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"70",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"80",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"90",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"100",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"150",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"200",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"250",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"300",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"350",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"400",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"450",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"500",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"550",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"600",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"650",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"700",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"750",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"800",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"850",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"900",
"-",
"fold",
",",
"at",
"least",
"950",
"-",
"fold",
",",
"or",
"at",
"least",
"1000",
"-",
"fold",
")",
"less",
"efficient",
"at",
"integrating",
"than",
"an",
"integration",
"-",
"competent",
"viral",
"vector",
".",
"For",
"example",
",",
"integration",
"-",
"deficient",
"may",
"mean",
"at",
"least",
"about",
"20",
"-",
"fold",
"to",
"about",
"100",
"-",
"fold",
"less",
"efficient",
"at",
"integrating",
"than",
"a",
"viral",
"vector",
"which",
"has",
"not",
"been",
"modified",
"to",
"be",
"integration",
"defective",
".",
"Integration",
"can",
"be",
"measured",
"by",
"any",
"method",
"known",
"in",
"the",
"art",
",",
"e.g.",
",",
"by",
"PCR",
"detection",
"of",
"integration",
"events",
"near",
"an",
"Alu",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"A",
"\"",
"pseudotyped",
"\"",
"lentivirus",
"is",
"a",
"lentiviral",
"particle",
"having",
"one",
"or",
"more",
"envelope",
"glycoproteins",
"that",
"are",
"encoded",
"by",
"a",
"virus",
"that",
"is",
"distinct",
"from",
"the",
"lentiviral",
"genome",
".",
"The",
"envelope",
"glycoprotein",
"may",
"be",
"modified",
",",
"mutated",
"or",
"engineered",
"as",
"described",
"herein",
"."
] | [
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"used",
"herein",
",",
"the",
"term",
"\"",
"exogenous",
"antigen",
"\"",
"refers",
"to",
"an",
"antigen",
"that",
"has",
"been",
"genetically",
"engineered",
"to",
"be",
"expressed",
"in",
"the",
"lentiviral",
"vectors",
"disclosed",
"herein",
".",
"Accordingly",
",",
"the",
"term",
"explicitly",
"includes",
"antigens",
"derived",
"from",
"HIV",
"that",
"have",
"been",
"genetically",
"engineered",
"to",
"be",
"expressed",
"in",
"the",
"lentiviral",
"vectors",
"disclosed",
"herein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"or",
"any",
"embodiments",
",",
"the",
"Vpx",
"protein",
"is",
"fused",
"to",
"HIV-1",
"Vpr",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"Typically",
",",
"the",
"Vpx",
"protein",
"is",
"packaged",
"in",
"the",
"viral",
"particle",
".",
"However",
",",
"in",
"some",
"or",
"any",
"embodiments",
",",
"a",
"gene",
"encoding",
"a",
"Vpx",
"protein",
"is",
"included",
"on",
"the",
"lentiviral",
"genome",
"and",
"is",
"expressed",
"when",
"the",
"viral",
"particle",
"infects",
"a",
"target",
"cell",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"porated",
"by",
"reference",
"for",
"envelope",
"glycoprotein",
"sequences",
")",
"and",
"sequence",
"encoding",
"Venezuelan",
"equine",
"encephalitis",
"virus",
"envelope",
"glycoproteins",
"in",
"Accession",
"NP",
"040824",
"(",
"incorporated",
"by",
"reference",
"for",
"sequences",
"of",
"envelope",
"glycoproteins",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"understood",
"that",
"references",
"to",
"a",
"\"",
"residue",
"number",
"of",
"the",
"E2",
"glycoprotein",
"\"",
"(",
"such",
"as",
"residue",
"160",
",",
"70",
",",
"76",
"or",
"159",
")",
"are",
"defined",
"by",
"reference",
"to",
"the",
"amino",
"acid",
"sequence",
"of",
"the",
"protein",
"of",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"18",
",",
"which",
"is",
"the",
"E2",
"glycoprotein",
"of",
"Sindbis",
"strain",
"HR",
"(",
"i.e.",
",",
"\"",
"Sindbis",
"HR",
"reference",
"strain",
"\"",
")",
".",
"For",
"example",
",",
"if",
"a",
"variant",
"of",
"Sindbis",
"E2",
"glycoprotein",
"has",
"been",
"produced",
"in",
"which",
"residue",
"70",
"has",
"been",
"deleted",
"from",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"18",
",",
"then",
"\"",
"residue",
"160",
"\"",
"will",
"refer",
"to",
"actual",
"residue",
"159",
"of",
"such",
"a",
"variant",
".",
"Analogous",
"positions",
"in",
"other",
"alphaviruses",
"can",
"be",
"determined",
"through",
"alignments",
"that",
"maximize",
"homology",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"alpain",
")",
",",
"metalloendopeptidases",
",",
"(",
"e.g.",
",",
"collagenase",
",",
"thermolysin",
")",
",",
"serine",
"endopeptidases",
"(",
"e.g.",
",",
"chymotrypsin",
",",
"factor",
"IXa",
",",
"factor",
"X",
",",
"thrombin",
",",
"trypsin",
")",
",",
"streptokinases",
".",
"The",
"recognition",
"and",
"cleavage",
"site",
"sequences",
"for",
"these",
"enzymes",
"are",
"well",
"known",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"about",
"500:1",
",",
"at",
"least",
"about",
"1000:1",
",",
"at",
"least",
"about",
"5000:1",
",",
"at",
"least",
"about",
"10,000:1",
",",
"or",
"more",
".",
"For",
"limiting",
"dilution",
",",
"greater",
"selectivity",
"is",
"typically",
"seen",
"at",
"higher",
"dilutions",
"(",
"i.e.",
",",
"lower",
"amounts",
")",
"of",
"input",
"virus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lentiviral",
"Vector",
"Genome"
] | [
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term"
] |
[
"Suitable",
"lentiviral",
"vector",
"genomes",
"include",
"those",
"based",
"on",
"Human",
"Immunodeficiency",
"Virus",
"(",
"HIV-1",
")",
",",
"HIV-2",
",",
"feline",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"FIV",
")",
",",
"equine",
"infectious",
"anemia",
"virus",
",",
"Simian",
"Immunodeficiency",
"Virus",
"(",
"SIV",
")",
"and",
"maedi",
"/",
"visna",
"virus",
".",
"A",
"desirable",
"characteristic",
"of",
"lentiviruses",
"is",
"that",
"they",
"are",
"able",
"to",
"infect",
"both",
"dividing",
"and",
"non",
"-",
"dividing",
"cells",
",",
"it",
"is",
"not",
"necessary",
"for",
"target",
"cells",
"to",
"be",
"dividing",
"(",
"or",
"to",
"stimulate",
"the",
"target",
"cells",
"to",
"divide",
")",
".",
"Generally",
",",
"the",
"genome",
"and",
"envelope",
"glycoproteins",
"will",
"be",
"based",
"on",
"different",
"viruses",
",",
"such",
"that",
"the",
"resulting",
"viral",
"vector",
"particle",
"is",
"pseudotyped",
".",
"Safety",
"features",
"of",
"the",
"vector",
"genome",
"are",
"desirably",
"incorporated",
".",
"Safety",
"features",
"include",
"self",
"-",
"inactivating",
"LTR",
"and",
"a",
"non",
"-",
"integrating",
"genome",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"1558",
"is",
"codon",
"optimized",
".",
"In",
"some",
"embodiments",
",",
"the",
"codon",
"optimized",
"polynucleotide",
"encoding",
"Gag",
"and",
"Pol",
"comprises",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"54",
".",
"In",
"some",
"embodiments",
",",
"the",
"plasmid",
"encoding",
"the",
"codon",
"optimized",
"gag",
"-",
"pol",
"polynucleotide",
"comprises",
"the",
"sequence",
"of",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"55",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Alternatively",
",",
"the",
"promoter",
"may",
"be",
"a",
"tissue",
"specific",
"promoter",
".",
"In",
"some",
"preferred",
"embodiments",
",",
"the",
"promoter",
"is",
"a",
"target",
"cell",
"-",
"specific",
"promoter",
".",
"For",
"example",
",",
"the",
"promoter",
"can",
"be",
"from",
"any",
"product",
"expressed",
"by",
"dendritic",
"cells",
",",
"including",
"CD11c",
",",
"CD103",
",",
"TLRs",
",",
"DC",
"-",
"SIGN",
",",
"BDCA-3",
",",
"DEC-205",
",",
"DCIR2",
",",
"mannose",
"receptor",
",",
"Dectin-1",
",",
"Clec9A",
",",
"MHC",
"classII",
".",
"In",
"addition",
",",
"promoters",
"may",
"be",
"selected",
"to",
"allow",
"for",
"inducible",
"expression",
"of",
"the",
"sequence",
"of",
"interest",
".",
"A",
"number",
"of",
"systems",
"for",
"inducible",
"expression",
"are",
"known",
"in",
"the",
"art",
",",
"including",
"the",
"tetracycline",
"responsive",
"system",
",",
"the",
"lac",
"operator",
"-",
"repressor",
"system",
",",
"as",
"well",
"as",
"promoters",
"responsive",
"to",
"a",
"variety",
"of",
"environmental",
"or",
"physiological",
"changes",
",",
"including",
"heat",
"shock",
",",
"metal",
"ions",
",",
"such",
"as",
"metallothionein",
"promoter",
",",
"interferons",
",",
"hypoxia",
",",
"steroids",
",",
"such",
"as",
"progesterone",
"or",
"glucocorticoid",
"receptor",
"promoter",
",",
"radiation",
",",
"such",
"as",
"VEGF",
"promoter",
".",
"A",
"combination",
"of",
"promoters",
"may",
"also",
"be",
"used",
"to",
"obtain",
"the",
"desired",
"expression",
"of",
"the",
"gene",
"of",
"interest",
".",
"The",
"artisan",
"of",
"ordinary",
"skill",
"will",
"be",
"able",
"to",
"select",
"a",
"promoter",
"based",
"on",
"the",
"desired",
"expression",
"pattern",
"of",
"the",
"gene",
"in",
"the",
"organism",
"or",
"the",
"target",
"cell",
"of",
"interest",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"internal",
"enhancer",
"may",
"also",
"be",
"present",
"in",
"the",
"viral",
"construct",
"to",
"increase",
"expression",
"of",
"the",
"gene",
"of",
"interest",
".",
"For",
"example",
",",
"the",
"CMV",
"enhancer",
"(",
"Boshart",
"et",
"al",
".",
"Cell",
",",
"41:521",
",",
"1985",
";",
"which",
"is",
"incorporated",
"herein",
"by",
"reference",
"in",
"its",
"entirety",
")",
"may",
"be",
"used",
".",
"Many",
"enhancers",
"in",
"viral",
"genomes",
",",
"such",
"as",
"HIV",
",",
"CMV",
",",
"and",
"in",
"mammalian",
"genomes",
"have",
"been",
"identified",
"and",
"characterized",
"(",
"see",
"GenBank",
")",
".",
"An",
"enhancer",
"can",
"be",
"used",
"in",
"combination",
"with",
"a",
"heterologous",
"promoter",
".",
"One",
"of",
"ordinary",
"skill",
"in",
"the",
"art",
"will",
"be",
"able",
"to",
"select",
"the",
"appropriate",
"enhancer",
"based",
"on",
"the",
"desired",
"expression",
"pattern",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Transcription",
"may",
"be",
"increased",
"by",
"inserting",
"an",
"enhancer",
"sequence",
"into",
"the",
"vector(s",
")",
".",
"Enhancers",
"are",
"typically",
"cis",
"-",
"acting",
"elements",
"of",
"DNA",
",",
"usually",
"about",
"10",
"to",
"300",
"bp",
"in",
"length",
",",
"that",
"act",
"on",
"a",
"promoter",
"to",
"increase",
"its",
"transcription",
".",
"Many",
"enhancer",
"sequences",
"are",
"now",
"known",
"from",
"mammalian",
"genes",
"(",
"globin",
",",
"elastase",
",",
"albumin",
",",
"alpha",
"-",
"fetoprotein",
",",
"and",
"insulin",
")",
"and",
"from",
"eukaryotic",
"cell",
"viruses",
".",
"Examples",
"include",
"the",
"SV40",
"enhancer",
"on",
"the",
"late",
"side",
"of",
"the",
"replication",
"origin",
"(",
"bp",
"100",
"-",
"270",
")",
",",
"the",
"cytomegalovirus",
"early",
"promoter",
"enhancer",
",",
"the",
"polyoma",
"enhancer",
"on",
"the",
"late",
"side",
"of",
"the",
"replication",
"origin",
",",
"and",
"adenovirus",
"enhancers",
".",
"The",
"enhancer",
"may",
"be",
"spliced",
"into",
"the",
"vector",
"at",
"a",
"position",
"5",
"'",
"or",
"3",
"'",
"to",
"the",
"antigen",
"-",
"specific",
"polynucleotide",
"sequence",
",",
"but",
"is",
"preferably",
"located",
"at",
"a",
"site",
"5",
"'",
"from",
"the",
"promoter",
"."
] | [
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"Plasmids",
"containing",
"one",
"or",
"more",
"of",
"the",
"components",
"described",
"herein",
"are",
"readily",
"constructed",
"using",
"standard",
"techniques",
"well",
"known",
"in",
"the",
"art",
".",
"For",
"analysis",
"to",
"confirm",
"correct",
"sequences",
"in",
"plasmids",
"constructed",
",",
"the",
"plasmid",
"may",
"be",
"replicated",
"in",
"E.",
"coli",
",",
"purified",
",",
"and",
"analyzed",
"by",
"restriction",
"endonuclease",
"digestion",
"or",
"its",
"DNA",
"sequence",
"determined",
"by",
"conventional",
"methods",
"."
] | [
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"Using",
"the",
"teachings",
"provided",
"herein",
",",
"one",
"of",
"skill",
"in",
"the",
"art",
"will",
"recognize",
"that",
"the",
"efficacy",
"of",
"a",
"particular",
"expression",
"system",
"can",
"be",
"tested",
"by",
"transfecting",
"packaging",
"cells",
"with",
"a",
"vector",
"comprising",
"a",
"gene",
"encoding",
"a",
"reporter",
"protein",
"and",
"measuring",
"the",
"expression",
"using",
"a",
"suitable",
"technique",
",",
"for",
"example",
",",
"measuring",
"fluorescence",
"from",
"a",
"green",
"fluorescent",
"protein",
"conjugate",
".",
"Suitable",
"reporter",
"genes",
"are",
"well",
"known",
"in",
"the",
"art",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Types",
"of",
"Sequences",
"of",
"interest"
] | [
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term"
] |
[
"In",
"certain",
"cases",
",",
"the",
"sequence",
"of",
"interest",
"can",
"be",
"a",
"gene",
"encoding",
"a",
"small",
"inhibiting",
"RNA",
"(",
"siRNA",
")",
"or",
"a",
"microRNA",
"(",
"miRNA",
")",
"of",
"interest",
"that",
"down",
"-",
"regulates",
"expression",
"of",
"a",
"molecule",
".",
"For",
"example",
",",
"the",
"gene",
"encoding",
"an",
"siRNA",
"or",
"a",
"microRNA",
"can",
"be",
"used",
"to",
"down",
"-",
"regulate",
"expression",
"of",
"negative",
"regulators",
"in",
"a",
"cell",
",",
"including",
"those",
"that",
"inhibit",
"activation",
"or",
"maturation",
"of",
"dendritic",
"cells",
".",
"siRNAs",
"and",
"microRNAs",
"are",
"well",
"known",
"in",
"the",
"art",
"(",
"Fire",
"et",
"al",
".",
",",
"Nature",
"391:806",
",",
"1998",
";",
"see",
"also",
"\"",
"The",
"RNA",
"Interference",
"Resource",
"\"",
"of",
"Applied",
"Biosystems",
",",
"Trang",
"et",
"al",
".",
",",
"Oncogene",
"Suppl",
"2",
":",
"S52",
",",
"2008",
";",
"Taganov",
",",
"K.",
",",
"et",
"al",
".",
"2007",
".",
"Immunity",
"26:133",
"-",
"137",
";",
"Dahlberg",
",",
"J.",
"E.",
"and",
"E.",
"Lund",
".",
"2007",
".",
"Sci",
".",
"STKE",
"387",
":",
"pe25",
";",
"Tiemann",
"and",
"Rossi",
",",
"EMBO",
"Mol",
"Med",
"1",
":",
"142",
",",
"2009",
")",
".",
"Alternatively",
",",
"the",
"sequence",
"of",
"interest",
"can",
"encode",
"a",
"self",
"-",
"complementary",
"double",
"stranded",
"RNA",
"in",
"which",
"the",
"complementary",
"region",
"is",
"greater",
"than",
"about",
"20",
"ribonucleotides",
"in",
"length",
",",
"or",
"an",
"anti",
"-",
"sense",
"RNA",
"that",
"is",
"greater",
"than",
"about",
"20",
"ribonucleotides",
"in",
"length",
".",
"Those",
"of",
"ordinary",
"skill",
"in",
"the",
"art",
"will",
"appreciate",
"that",
"siRNA",
",",
"miRNA",
",",
"dsRNA",
"and",
"anti",
"-",
"sense",
"RNA",
"molecules",
"can",
"be",
"expressed",
"from",
"an",
"RNA",
"polymerase",
"III",
"promoter",
",",
"or",
",",
"alternatively",
",",
"can",
"be",
"a",
"component",
"of",
"a",
"non",
"-",
"coding",
"RNA",
"that",
"is",
"transcribed",
"from",
"an",
"RNA",
"polymerase",
"II",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"two",
"or",
"more",
"antigens",
"can",
"also",
"be",
"accomplished",
"using",
"bidirectional",
"promoters",
",",
"i.e.",
",",
"a",
"promoter",
"region",
"or",
"two",
"back",
"-",
"to",
"-",
"back",
"cloned",
"promoters",
"whose",
"reading",
"directions",
"point",
"away",
"from",
"each",
"other",
",",
"and",
"from",
"which",
"two",
"open",
"reading",
"frames",
"flanking",
"the",
"promoter",
"region",
"are",
"transcribed",
".",
"Examples",
"of",
"such",
"promoters",
"include",
"the",
"PDGF",
"-",
"A",
",",
"neurotropic",
"JC",
"virus",
",",
"BRCA1",
",",
"transcobalamin",
"II",
",",
"and",
"dipeptidylpeptidase",
"IV",
"promoters",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"a",
"specific",
"exemplification",
",",
"the",
"viral",
"vector",
"genome",
"comprises",
":",
"a",
"cytomegalovirus",
"(",
"CMV",
")",
"enhancer",
"/",
"promoter",
"sequence",
";",
"the",
"R",
"and",
"U5",
"sequences",
"from",
"the",
"HIV",
"5",
"'",
"LTR",
";",
"a",
"packaging",
"sequence",
"(",
"ψ",
")",
";",
"the",
"HIV-1",
"flap",
"signal",
";",
"an",
"internal",
"enhancer",
";",
"an",
"internal",
"promoter",
";",
"a",
"gene",
"of",
"interest",
";",
"the",
"woodchuck",
"hepatitis",
"virus",
"responsive",
"element",
";",
"a",
"tRNA",
"amber",
"suppressor",
"sequence",
";",
"a",
"U3",
"element",
"with",
"a",
"deletion",
"of",
"its",
"enhancer",
"sequence",
";",
"the",
"chicken",
"β",
"-",
"globin",
"insulator",
";",
"and",
"the",
"R",
"and",
"U5",
"sequences",
"of",
"the",
"3",
"'",
"HIV",
"LTR",
".",
"In",
"some",
"exemplifications",
",",
"the",
"vector",
"genome",
"comprises",
"an",
"intact",
"lentiviral",
"5",
"'",
"LTR",
"and",
"a",
"self",
"-",
"inactivating",
"3",
"'",
"LTR",
"(",
"Iwakuma",
"et",
"al",
".",
"Virology",
"15:120",
",",
"1999",
",",
"incorporated",
"by",
"reference",
"in",
"its",
"entirety",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Construction",
"of",
"the",
"vector",
"genome",
"can",
"be",
"accomplished",
"using",
"any",
"suitable",
"genetic",
"engineering",
"techniques",
"known",
"in",
"the",
"art",
",",
"including",
",",
"without",
"limitation",
",",
"the",
"standard",
"techniques",
"of",
"restriction",
"endonuclease",
"digestion",
",",
"ligation",
",",
"transformation",
",",
"plasmid",
"purification",
",",
"and",
"DNA",
"sequencing",
",",
"for",
"example",
"as",
"described",
"in",
"Sambrook",
"et",
"al",
".",
"(",
"1989",
".",
"Molecular",
"Cloning",
":",
"A",
"Laboratory",
"Manual",
".",
"Cold",
"Spring",
"Harbor",
"Laboratory",
"Press",
",",
"N.Y.",
")",
",",
"Coffin",
"et",
"al",
".",
"(",
"Retroviruses",
".",
"Cold",
"Spring",
"Harbor",
"Laboratory",
"Press",
",",
"N.Y.",
"(",
"1997",
")",
")",
"and",
"\"",
"RNA",
"Viruses",
":",
"A",
"Practical",
"Approach",
"\"",
"(",
"Alan",
"J.",
"Cann",
",",
"Ed",
".",
",",
"Oxford",
"University",
"Press",
",",
"(",
"2000",
")",
",",
"each",
"of",
"the",
"foregoing",
"which",
"is",
"incorporated",
"herein",
"by",
"reference",
"in",
"its",
"entirety",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"glycosylation",
"profile",
"of",
"a",
"viral",
"envelope",
"protein",
"can",
"be",
"determined",
"by",
"any",
"method",
"known",
"in",
"the",
"art",
".",
"For",
"example",
",",
"gel",
"shift",
"assays",
"on",
"viral",
"glycoproteins",
"treated",
"with",
"glycosidases",
"(",
"e.g.",
",",
"EndoH",
"or",
"PNGaseF",
")",
"or",
"left",
"untreated",
"may",
"be",
"compared",
".",
"Other",
"methods",
"include",
"cleaving",
"glycans",
"from",
"the",
"viral",
"glycoproteins",
"and",
"separating",
"and",
"identifying",
"the",
"components",
"via",
"HPLC",
"and",
"mass",
"spectrometry",
"methods",
"."
] | [
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O"
] |
[
"Delivery",
"of",
"the",
"Virus"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term"
] |
[
"Therapeutic",
"and",
"prophylactic",
"immunizations"
] | [
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term"
] |
[
"In",
"some",
"of",
"the",
"viruses",
",",
"DC",
"maturation",
"factors",
"that",
"activate",
"and/or",
"stimulate",
"maturation",
"of",
"the",
"DCs",
"are",
"delivered",
"in",
"conjunction",
"with",
"the",
"sequence",
"of",
"interest",
".",
"In",
"alternatives",
",",
"the",
"DCs",
"are",
"activated",
"by",
"delivery",
"of",
"DC",
"maturation",
"factors",
"prior",
"to",
",",
"simultaneously",
"with",
",",
"or",
"after",
"delivery",
"of",
"the",
"virus",
".",
"DC",
"maturation",
"factors",
"may",
"be",
"provided",
"separately",
"from",
"administration",
"of",
"the",
"virus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"described",
"herein",
",",
"one",
"or",
"more",
"immune",
"modulation",
"or",
"DC",
"maturation",
"factors",
"can",
"be",
"encoded",
"by",
"one",
"or",
"more",
"sequences",
"that",
"are",
"contained",
"in",
"the",
"viral",
"genome",
"and",
"expressed",
"after",
"the",
"virus",
"infects",
"a",
"dendritic",
"cell",
".",
"The",
"sequences",
"encoding",
"immune",
"modulation",
"factors",
"can",
"also",
"be",
"provided",
"in",
"a",
"separate",
"vector",
"that",
"is",
"co",
"-",
"transfected",
"with",
"the",
"viral",
"vector",
"encoding",
"one",
"or",
"more",
"antigens",
"in",
"a",
"packaging",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"viral",
"particles",
"may",
"be",
"injected",
"in",
"vivo",
",",
"where",
"they",
"infect",
"DCs",
"and",
"deliver",
"a",
"sequence",
"of",
"interest",
",",
"typically",
"encoding",
"an",
"antigen",
".",
"The",
"amount",
"of",
"viral",
"particles",
"is",
"at",
"least",
"3X106",
"IU",
",",
"and",
"can",
"be",
"at",
"least",
"1X107",
"IU",
",",
"at",
"least",
"3X107IU",
",",
"at",
"least",
"1X108",
"IU",
",",
"at",
"least",
"3X108",
"IU",
",",
"at",
"least",
"1X109",
"IU",
",",
"or",
"at",
"least",
"3X109",
"IU",
".",
"At",
"selected",
"intervals",
",",
"DCs",
"from",
"the",
"recipient",
"'s",
"lymphoid",
"organs",
"may",
"be",
"used",
"to",
"measure",
"expression",
",",
"for",
"example",
",",
"by",
"observing",
"marker",
"expression",
",",
"such",
"as",
"GFP",
"or",
"luciferase",
".",
"Nucleic",
"acid",
"monitoring",
"techniques",
"and",
"measurements",
"of",
"reverse",
"transcriptase",
"(",
"RT",
")",
"activity",
"can",
"also",
"be",
"used",
"to",
"analyze",
"the",
"biodistribution",
"of",
"viral",
"particles",
".",
"T",
"cells",
"from",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
",",
"lymph",
"nodes",
",",
"spleens",
",",
"or",
"malignant",
"or",
"target",
"pathogen",
"-",
"infected",
"tissue",
"of",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"-",
"treated",
"recipients",
"may",
"be",
"measured",
"from",
"the",
"magnitude",
"and",
"durability",
"of",
"response",
"to",
"antigen",
"stimulation",
".",
"Tissue",
"cells",
"other",
"than",
"DCs",
",",
"such",
"as",
"epithelial",
"cells",
"and",
"lymphoid",
"cells",
",",
"may",
"be",
"analyzed",
"for",
"the",
"specificity",
"of",
"in",
"vivo",
"gene",
"delivery",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"A",
"variety",
"of",
"adjuvants",
"can",
"be",
"used",
"in",
"combination",
"with",
"the",
"virus",
"to",
"elicit",
"an",
"immune",
"response",
"to",
"the",
"antigen",
"encoded",
"in",
"the",
"viral",
"vector",
"genome",
".",
"Preferred",
"adjuvants",
"augment",
"the",
"intrinsic",
"response",
"to",
"an",
"antigen",
"without",
"causing",
"conformational",
"changes",
"in",
"the",
"antigen",
"that",
"affect",
"the",
"qualitative",
"form",
"of",
"the",
"response",
".",
"Preferred",
"adjuvants",
"include",
"alum",
",",
"3",
"De",
"-",
"O",
"-",
"acylated",
"monophosphoryl",
"lipid",
"A",
"(",
"MPL",
")",
"(",
"see",
"GB",
"2220211",
")",
".",
"QS21",
"is",
"a",
"triterpene",
"glycoside",
"or",
"saponin",
"isolated",
"from",
"the",
"bark",
"of",
"the",
"Quillaja",
"Saponaria",
"Molina",
"tree",
"found",
"in",
"South",
"America",
"(",
"see",
"Kensil",
"et",
"al",
".",
",",
"in",
"Vaccine",
"Design",
":",
"The",
"Subunit",
"and",
"Adjuvant",
"Approach",
"(",
"eds",
".",
"Powell",
"and",
"Newman",
",",
"Plenum",
"Press",
",",
"NY",
",",
"1995",
")",
";",
"U.S.",
"Pat",
".",
"No",
".",
"5,057,540",
")",
".",
"Other",
"adjuvants",
"are",
"oil",
"in",
"water",
"emulsions",
"(",
"such",
"as",
"squalene",
"or",
"peanut",
"oil",
")",
",",
"optionally",
"in",
"combination",
"with",
"immune",
"stimulants",
",",
"such",
"as",
"monophosphoryl",
"lipid",
"A",
"(",
"see",
"Stoute",
"et",
"al",
".",
",",
"N.",
"Engl",
"J.",
"Med",
".",
"336",
",",
"86",
"-",
"91",
"(",
"1997",
")",
")",
".",
"Another",
"adjuvant",
"is",
"CpG",
"(",
"Bioworld",
"Today",
",",
"Nov.",
"15",
",",
"1998",
")",
".",
"Adjuvants",
"can",
"be",
"administered",
"as",
"a",
"component",
"of",
"a",
"therapeutic",
"composition",
"with",
"an",
"active",
"agent",
"or",
"can",
"be",
"administered",
"separately",
",",
"before",
",",
"concurrently",
"with",
",",
"or",
"after",
"administration",
"of",
"the",
"therapeutic",
"agent",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"omponents",
"from",
"the",
"group",
"consisting",
"of",
"monophosphorylipid",
"A",
"(",
"MPL",
")",
",",
"trehalose",
"dimycolate",
"(",
"TDM",
")",
",",
"and",
"cell",
"wall",
"skeleton",
"(",
"CWS",
")",
",",
"preferably",
"MPL+CWS",
"(",
"Detox",
"™",
")",
".",
"Another",
"class",
"of",
"preferred",
"adjuvants",
"is",
"saponin",
"adjuvants",
",",
"such",
"as",
"Stimulon",
".",
"TM",
".",
"(",
"QS21",
",",
"Aquila",
",",
"Worcester",
",",
"Mass.",
")",
"or",
"particles",
"generated",
"there",
"from",
"such",
"as",
"ISCOMs",
"(",
"immunostimulating",
"complexes",
")",
"and",
"ISCOMATRIX",
".",
"Other",
"adjuvants",
"include",
"Complete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"CFA",
")",
"and",
"Incomplete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"IFA",
")",
".",
"Other",
"adjuvants",
"include",
"cytokines",
",",
"such",
"as",
"interleukins",
"(",
"IL-1",
",",
"IL-2",
",",
"and",
"IL-12",
")",
",",
"macrophage",
"colony",
"stimulating",
"factor",
"(",
"M",
"-",
"CSF",
")",
",",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"(",
"TNF",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"adjuvant",
"of",
"formula",
"(",
"I",
")",
"may",
"be",
"formulated",
"into",
"a",
"pharmaceutical",
"composition",
",",
"optionally",
"with",
"a",
"co",
"-",
"adjuvant",
",",
"each",
"as",
"discussed",
"below",
".",
"In",
"this",
"regard",
"reference",
"is",
"made",
"to",
"US",
"Patent",
"Publication",
"No",
".",
"2008/0131466",
"which",
"provides",
"formulations",
",",
"e.g.",
",",
"aqueous",
"formulation",
"(",
"AF",
")",
"and",
"stable",
"emulsion",
"formulations",
"(",
"SE",
")",
"for",
"GLA",
"adjuvant",
",",
"where",
"these",
"formulations",
"may",
"be",
"utilized",
"for",
"any",
"of",
"the",
"adjuvants",
"of",
"formula",
"(",
"I",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Pharmaceutical",
"compositions",
"and",
"kits"
] | [
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term"
] |
[
"Also",
"contemplated",
"herein",
"are",
"pharmaceutical",
"compositions",
"and",
"kits",
"containing",
"a",
"virus",
"provided",
"herein",
"and",
"one",
"or",
"more",
"components",
".",
"Pharmaceutical",
"compositions",
"can",
"include",
"viral",
"vector",
"particles",
"as",
"provided",
"herein",
"and",
"a",
"pharmaceutical",
"carrier",
".",
"Kits",
"can",
"include",
"the",
"pharmaceutical",
"compositions",
"and/or",
"combinations",
"provided",
"herein",
",",
"and",
"one",
"or",
"more",
"components",
",",
"such",
"as",
"instructions",
"for",
"use",
",",
"a",
"device",
"for",
"administering",
"a",
"compound",
"to",
"a",
"subject",
",",
"and",
"a",
"device",
"for",
"administering",
"a",
"compound",
"to",
"a",
"subject",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Kits",
"comprising",
"a",
"viral",
"vector",
"encoding",
"a",
"sequence",
"of",
"interest",
"(",
"typically",
"an",
"antigen",
")",
"and",
"optionally",
",",
"a",
"polynucleotide",
"sequence",
"encoding",
"a",
"DC",
"maturation",
"factor",
"are",
"also",
"contemplated",
"herein",
".",
"In",
"some",
"kits",
",",
"the",
"kit",
"includes",
"at",
"least",
"one",
"plasmid",
"encoding",
"virus",
"packaging",
"components",
"and",
"a",
"vector",
"encoding",
"Sindbis",
"virus",
"E2",
"glycoprotein",
"variant",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"Exemplary",
"Embodiments"
] | [
"B-Term",
"I-Term"
] |
[
"Methods",
"of",
"generating",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term"
] |
[
"In",
"some",
"embodiments",
"of",
"the",
"disclosure",
",",
"a",
"method",
"of",
"generating",
"a",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"comprises",
":"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"mannosidase",
"inhibitor",
"is",
"kifunensine",
"or",
"DMNJ",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"SAMHD1",
"inhibitor",
"is",
"a",
"Vpx",
"protein",
",",
"e.g.",
",",
"a",
"SIVmac",
"Vpx",
"protein",
",",
"a",
"SIVsm",
"protein",
",",
"a",
"SIVrcm",
",",
"or",
"an",
"HIV-2",
"Vpx",
"protein",
".",
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"SAMHD1",
"inhibitor",
"is",
"an",
"antibody",
"or",
"fragment",
"thereof",
".",
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"SAMHD1",
"inhibitor",
"is",
"a",
"Vpr",
"protein",
"with",
"SAMHD1",
"-",
"inhibiting",
"ability",
",",
"e.g.",
",",
"a",
"SIVdeb",
"Vpr",
"protein",
"or",
"a",
"SIVmus",
"Vpr",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"kifunensine",
"is",
"present",
"in",
"the",
"culture",
"medium",
"at",
"a",
"concentration",
"of",
"about",
"0.1",
"µg",
"/",
"ml",
"to",
"about",
"10",
"µg",
"/",
"ml",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"kifunensine",
"is",
"present",
"in",
"the",
"culture",
"medium",
"at",
"a",
"concentration",
"of",
"about",
"0.25",
"µg",
"/",
"ml",
"to",
"about",
"2",
"µg",
"/",
"ml",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"kifunensine",
"is",
"present",
"in",
"the",
"culture",
"medium",
"at",
"a",
"concentration",
"of",
"about",
"0.01",
"µg",
"/",
"ml",
"to",
"about",
"1",
"mg",
"/",
"ml",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"virus",
"packaging",
"cell",
"further",
"comprises",
":"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"(",
"i",
")",
"a",
"polynucleotide",
"comprising",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
";",
"and(ii",
")",
"a",
"polynucleotide",
"encoding",
"a",
"rev",
"protein",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"polynucleotide",
"encoding",
"the",
"Vpx",
"protein",
"is",
"on",
"the",
"same",
"or",
"different",
"plasmid",
"as",
"the",
"polynucleotide",
"encoding",
"the",
"rev",
"protein",
",",
"or",
"the",
"polynucleotide",
"comprising",
"the",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
"are",
"human",
"codon",
"optimized",
"and",
"comprise",
"a",
"non",
"-",
"optimized",
"window",
"around",
"position",
"1228",
"to",
"1509",
"of",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"54",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"polynucleotide",
"comprising",
"gag",
"and",
"pol",
"genes",
"lacks",
"a",
"functional",
"rev",
"responsive",
"element",
"(",
"RRE",
")",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"pol",
"gene",
"encodes",
"an",
"inactive",
"integrase",
"enzyme",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"integrase",
"enzyme",
"has",
"a",
"D64V",
"mutation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"is",
"derived",
"from",
"HIV-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"of",
"the",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"or",
"packaging",
"system",
"of",
"any",
"of",
"the",
"preceding",
"embodiments",
"is",
"capable",
"of",
"integrating",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"has",
"an",
"inactivated",
"3",
"'",
"long",
"terminal",
"repeat",
"(",
"LTR",
")",
"or",
"a",
"self",
"-",
"inactivating",
"3",
"'",
"long",
"terminal",
"repeat",
"(",
"LTR",
")",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"comprises",
"a",
"U3",
"element",
"lacking",
"at",
"least",
"one",
"of",
"an",
"enhancer",
"sequence",
",",
"a",
"TATA",
"box",
",",
"an",
"Spl",
"site",
",",
"an",
"NK",
"-",
"kappa",
"B",
"site",
",",
"or",
"a",
"polypurine",
"tract",
"(",
"PPT",
")",
".",
"In",
"some",
"aspects",
",",
"the",
"pol",
"gene",
"encodes",
"an",
"inactive",
"integrase",
"enzyme",
"and",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"lacks",
"a",
"functional",
"polypurine",
"tract",
"(",
"PPT",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"a",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"produced",
"by",
"the",
"method",
"of",
"paragraph",
"[",
"0206",
"]",
",",
"[",
"0210",
"]",
",",
"or",
"[",
"0218",
"]",
"is",
"provided",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"a",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"produced",
"by",
"the",
"method",
"of",
"paragraph",
"[",
"0216",
"]",
"is",
"provided",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Compositions",
"comprising",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"Vpx",
"protein",
"comprises",
"an",
"amino",
"acid",
"sequence",
"at",
"least",
"80",
"%",
"identical",
"to",
"SIVmac",
"Vpx",
"(",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"44",
")",
",",
"SIVsm",
"Vpx",
"(",
"SEQ",
"ID",
"NO",
":",
"45",
")",
",",
"SIVrcm",
"Vpx"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"of",
"the",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"or",
"packaging",
"system",
"of",
"any",
"of",
"the",
"preceding",
"embodiments",
"is",
"capable",
"of",
"integrating",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"lentiviral",
"vector",
"genome",
"of",
"the",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"or",
"packaging",
"system",
"of",
"any",
"of",
"the",
"preceding",
"embodiments",
"is",
"integration",
"deficient",
"or",
"integration",
"defective",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"aspects",
",",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles",
"comprise",
"a",
"Rev",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"composition",
"further",
"comprises",
"an",
"immunostimulating",
"agent",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"composition",
"further",
"comprises",
"an",
"adjuvant",
".",
"For",
"example",
",",
"as",
"noted",
"above",
",",
"adjuvants",
"include",
"alum",
",",
"or",
"3",
"De",
"-",
"O",
"-",
"acylated",
"monophosphoryl",
"lipid",
"A",
"(",
"MPL",
")",
".",
"Classes",
"of",
"adjuvants",
"disclosed",
"herein",
"include",
"(",
"a",
")",
"aluminum",
"salts",
",",
"(",
"b",
")",
"oil",
"-",
"in",
"-",
"water",
"emulsion",
"formulations",
",",
"optionally",
"with",
"or",
"without",
"other",
"specific",
"immunostimulating",
"agents",
"such",
"as",
"muramyl",
"peptides",
"or",
"other",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"components",
",",
"(",
"c",
")",
"saponin",
"adjuvants",
",",
"including",
"ISCOMs",
"(",
"immunostimulating",
"complexes",
")",
"and",
"ISCOMATRIX",
";",
"(",
"d",
")",
"Complete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"CFA",
")",
"and",
"Incomplete",
"Freund",
"'s",
"Adjuvant",
"(",
"IFA",
")",
";",
"(",
"e",
")",
"cytokines",
";",
"and",
"(",
"f",
")",
"adjuvants",
"of",
"formula",
"(",
"I",
")",
".",
"Within",
"formula",
"(",
"I",
")",
",",
"a",
"preferred",
"adjuvant",
"is",
"Product",
"No",
".",
"699800",
"as",
"identified",
"in",
"the",
"catalog",
"of",
"Avanti",
"Polar",
"Lipids",
",",
"Alabaster",
",",
"AL",
",",
"see",
"E1",
"in",
"combination",
"with",
"E10",
",",
"where",
"(",
"i",
")",
"A1",
"is",
"phosphate",
"or",
"phosphate",
"salt",
"and",
"A2",
"is",
"hydrogen",
"and",
"(",
"ii",
")",
"R1",
",",
"R3",
",",
"R5",
"and",
"R6",
"are",
"undecyl",
"and",
"R2",
"and",
"R4",
"are",
"tridecyl",
".",
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"envelope",
"glycoproteins",
"also",
"bind",
"cells",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"specific",
"aspects",
",",
"the",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particles",
"also",
"more",
"efficiently",
"transduce",
"cells",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"compared",
"to",
"cells",
"not",
"expressing",
"mouse",
"SIGNR1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"embodiments",
"of",
"the",
"disclosure",
",",
"there",
"is",
"provided",
"a",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"capable",
"of",
"targeting",
"a",
"cell",
"expressing",
"comprising",
":"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"aspects",
",",
"pseudotyped",
"lentiviral",
"vector",
"particle",
"further",
"comprises",
"a",
"Rev",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"invention",
"provides",
"an",
"anhydrous",
"crystal",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
"and",
"a",
"preparation",
"method",
"thereof",
".",
"The",
"preparation",
"method",
"comprises",
"using",
"an",
"organic",
"solvent",
"to",
"precipitate",
"a",
"solid",
"from",
"a",
"saturated",
"solution",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
",",
"drying",
"it",
"under",
"vacuum",
"to",
"obtain",
"an",
"anhydrous",
"crystal",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"invention",
"belongs",
"to",
"the",
"technical",
"field",
"of",
"pharmacy",
",",
"and",
"in",
"particular",
"relates",
"to",
"a",
"crystal",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
"and",
"a",
"preparation",
"method",
"thereof",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Polymyxin",
"B",
"is",
"an",
"alkaline",
"cyclic",
"polypeptide",
"antibiotic",
"produced",
"by",
"bacillus",
"polymyxa",
"and",
"composed",
"of",
"various",
"amino",
"acids",
"and",
"fatty",
"acids",
".",
"Polymyxin",
"B",
"product",
"is",
"a",
"multi",
"-",
"component",
"compound",
",",
"including",
"polymyxin",
"B1",
",",
"B2",
",",
"B3",
",",
"B1",
"-",
"I",
"(",
"it",
"is",
"required",
"that",
"the",
"sum",
"of",
"these",
"four",
"components",
"≥80.0",
"%",
"in",
"the",
"European",
"Pharmacopoeia",
")",
",",
"and",
"its",
"sulfate",
"is",
"commonly",
"used",
",",
"which",
"is",
"a",
"white",
"or",
"off",
"-",
"white",
"powder",
"with",
"hygroscopicity",
".",
"Polymyxin",
"B",
"sulfate",
"has",
"a",
"strong",
"killing",
"effect",
"on",
"Gram",
"-",
"negative",
"bacteria",
",",
"and",
"in",
"particular",
",",
"it",
"renders",
"high",
"in",
"vitro",
"sensitivity",
"to",
"NDM-1",
"bacteria",
"(",
"super",
"bacteria",
")",
",",
"and",
"thus",
"has",
"attracted",
"much",
"attention",
".",
"Since",
"the",
"two",
"components",
",",
"polymyxin",
"B3",
"and",
"B1",
"-",
"I",
",",
"are",
"nephrotoxic",
",",
"a",
"mixture",
"containing",
"the",
"four",
"components",
"is",
"mainly",
"for",
"external",
"use",
"clinically",
".",
"The",
"two",
"components",
",",
"B1",
"and",
"B2",
",",
"have",
"low",
"side",
"effects",
"and",
"can",
"be",
"used",
"for",
"injection",
".",
"High",
"levels",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"and",
"B2",
"crystals",
"have",
"higher",
"product",
"quality",
"and",
"can",
"be",
"more",
"used",
"for",
"injection",
"."
] | [
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"B-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"for",
"the",
"refining",
"of",
"polymyxin",
"B",
"sulfate",
"product",
",",
"it",
"is",
"usually",
"carried",
"out",
"by",
"a",
"spray",
"drying",
"method",
"(",
"patent",
"application",
"CN201210519331.7",
")",
"or",
"a",
"lyophilization",
"method",
"(",
"patent",
"application",
"CN201510775580.6",
")",
"due",
"to",
"its",
"difficulty",
"to",
"crystallize",
".",
"The",
"current",
"patent",
"about",
"polymyxin",
"B",
"crystal",
"includes",
"polymyxin",
"B1",
"dihydrate",
"crystal",
"disclosed",
"in",
"the",
"patent",
"application",
"CN201210379231.9",
",",
"which",
"explicitly",
"claims",
"a",
"compound",
"having",
"a",
"molecular",
"formula",
"of",
"C56H98N16O13·2H2O",
",",
"which",
"is",
"not",
"a",
"sulfate",
".",
"The",
"polymyxin",
"B1",
"dihydrate",
"crystal",
"of",
"the",
"patent",
"is",
"obtained",
"by",
"precipitation",
"using",
"a",
"mixture",
"of",
"acetone",
"and",
"diethyl",
"ether",
".",
"Diethyl",
"ether",
"is",
"extremely",
"volatile",
"and",
"easily",
"to",
"be",
"oxidized",
"in",
"air",
"and",
"causes",
"an",
"explosion",
",",
"which",
"is",
"not",
"suitable",
"for",
"industrial",
"production",
".",
"In",
"addition",
",",
"the",
"products",
"on",
"the",
"market",
"are",
"all",
"mixtures",
"of",
"polymyxin",
"B",
"sulfate",
".",
"Regarding",
"the",
"preparation",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
"monomer",
",",
"the",
"patent",
"application",
"filed",
"by",
"the",
"present",
"applicant",
"has",
"been",
"granted",
"(",
"Patent",
"No",
".",
"ZL201110390624.5",
")",
",",
"in",
"which",
"the",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
"has",
"a",
"purity",
"of",
"99.5",
"%",
",",
"and",
"its",
"solid",
"is",
"obtained",
"by",
"spray",
"drying",
"method",
".",
"However",
",",
"the",
"polymyxin",
"B",
"sulfate",
"prepared",
"by",
"the",
"current",
"spray",
"drying",
"method",
"is",
"difficult",
"to",
"form",
"a",
"crystal",
"form",
",",
"and",
"the",
"product",
"is",
"very",
"easy",
"to",
"agglomerate",
",",
"which",
"brings",
"inconvenience",
"to",
"production",
"and",
"research",
",",
"and",
"also",
"affects",
"the",
"quality",
"and",
"efficacy",
"of",
"the",
"drug",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"view",
"of",
"the",
"problems",
"existing",
"in",
"the",
"prior",
"art",
",",
"the",
"present",
"invention",
"provides",
"a",
"crystal",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
"and",
"a",
"preparation",
"method",
"thereof",
",",
"wherein",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"polymyxin",
"B2",
"sulfate",
"or",
"a",
"mixture",
"thereof",
"can",
"be",
"prepared",
"by",
"the",
"method",
"described",
"in",
"the",
"patent",
"ZL201110390624.5",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"invention",
"provides",
"an",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"has",
"an",
"X",
"-",
"ray",
"powder",
"diffraction",
"pattern",
"having",
"diffraction",
"peaks",
"at",
"3.396",
",",
"4.895",
"and",
"6.903",
"expressed",
"by",
"2θ",
"degree",
"using",
"Cu",
"-",
"Ka",
"radiation",
";",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"has",
"an",
"X",
"-",
"ray",
"powder",
"diffraction",
"pattern",
"expressed",
"by",
"2θ",
"degree",
"using",
"Cu",
"-",
"Ka",
"radiation",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"2A."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"has",
"an",
"infrared",
"absorption",
"spectrum",
"having",
"characteristic",
"bands",
"at",
"1071.93",
"cm-1",
",",
"1242.91",
"cm-1",
",",
"1384.25",
"cm-1",
",",
"1457.69",
"cm-1",
",",
"1524.29",
"cm-1",
",",
"1639.38",
"cm-1",
",",
"2957.69",
"cm-1",
",",
"3064.55",
"cm-1",
"and",
"3270.53",
"cm-1",
"as",
"measured",
"by",
"KBr",
"tableting",
"method",
";",
"and",
"more",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"has",
"an",
"infrared",
"absorption",
"spectrum",
"as",
"measured",
"by",
"KBr",
"tableting",
"method",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"3A."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"has",
"a",
"melting",
"point",
"of",
"226.97",
"°",
"C",
",",
"and",
"has",
"a",
"differential",
"scanning",
"calorimetry",
"pattern",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"4",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"inventor",
"conducted",
"a",
"more",
"detailed",
"analysis",
"on",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
",",
"in",
"which",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"1",
"exhibits",
"a",
"dynamic",
"moisture",
"adsorption",
"analysis",
"spectrum",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"5",
",",
"a",
"thermogravimetric",
"analysis",
"spectrum",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"6",
",",
"and",
"an",
"isotherm",
"diagram",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"7",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"invention",
"also",
"provides",
"an",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"of",
"polymyxin",
"B1",
"sulfate",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"has",
"an",
"X",
"-",
"ray",
"powder",
"diffraction",
"pattern",
"having",
"a",
"diffraction",
"peak",
"at",
"3.401",
"expressed",
"by",
"2θ",
"degree",
"using",
"Cu",
"-",
"Ka",
"radiation",
";",
"and",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"has",
"an",
"X",
"-",
"ray",
"powder",
"diffraction",
"pattern",
"expressed",
"by",
"2θ",
"degree",
"using",
"Cu",
"-",
"Ka",
"radiation",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"8A."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Chemical",
"I-Chemical",
"I-Chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"has",
"an",
"infrared",
"absorption",
"spectrum",
"having",
"characteristic",
"bands",
"at",
"1071.93",
"cm-1",
",",
"1242.91",
"cm-1",
",",
"1384.25",
"cm-1",
",",
"1457.69",
"cm-1",
",",
"1524.29",
"cm-1",
",",
"1639.38",
"cm-1",
",",
"2957.69",
"cm-1",
",",
"3064.55",
"cm-1",
"and",
"3270.53",
"cm-1",
"as",
"measured",
"by",
"KBr",
"tableting",
"method",
";",
"and",
"more",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"has",
"an",
"infrared",
"absorption",
"spectrum",
"as",
"measured",
"by",
"KBr",
"tableting",
"method",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"9A."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"preferably",
",",
"said",
"anhydrous",
"crystal",
"A",
"has",
"a",
"melting",
"point",
"of",
"225.00",
"°",
"C",
",",
"and",
"a",
"differential",
"scanning",
"calorimetry",
"pattern",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"10",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"O",
"B-Lab_value",
"I-Lab_value",
"I-Lab_value",
"O",
"O",
"O",
"B-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"I-Term",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
End of preview. Expand
in Dataset Viewer.
No dataset card yet
New: Create and edit this dataset card directly on the website!
Contribute a Dataset Card- Downloads last month
- 4