tokens
sequence
tags
sequence
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "further", "comprises", "a", "nucleotide", "sequence", "encoding", "a", "dendritic", "cell", "maturation", "/", "stimulatory", "factor", ".", "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "dendritic", "cell", "maturation", "/", "stimulatory", "factor", "is", "selected", "from", "the", "group", "consisting", "of", "GM", "-", "CSF", ",", "IL-2", ",", "IL-4", ",", "IL-6", ",", "IL-7", ",", "IL-15", ",", "IL-21", ",", "IL-23", ",", "TNFα", ",", "B7.1", ",", "B7.2", ",", "4", "-", "1BB", ",", "CD40", "ligand", ",", "and", "drug", "-", "mducible", "CD40", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "nucleotide", "sequence", "encoding", "an", "antigen", "is", "operably", "linked", "to", "a", "promoter", "selected", "from", "the", "group", "consisting", "of", "the", "human", "Ubiquitin", "-", "C", "promoter", "(", "UbiC", ")", ",", "the", "cytomegalovirus", "immediate", "early", "promoter", "(", "CMV", ")", ",", "the", "Rous", "sarcoma", "virus", "promoter", "(", "RSV", ")", ",", "and", "the", "tetracycline", "-", "responsive", "promoter", ".", "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "promoter", "is", "an", "intron", "-", "deficient", "promoter", ".", "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "intron", "-", "deficient", "promoter", "is", "a", "human", "Ubiquitin", "-", "C", "(", "UbiC", ")", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "her", "embodiment", "all", "of", "those", "carbon", "atoms", "are", "in", "the", "S", "stereochemistry", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "g", "with", "antibody", "against", "the", "Sindbis", "viral", "envelope", ".", "Figure", "4A", "illustrates", "the", "ability", "of", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles", "produced", "in", "the", "presence", "of", "400", "µg", "/", "ml", "DMNJ", "or", "various", "concentrations", "of", "kifunensine", "to", "infect", "HT1080", "cells", "stably", "expressing", "the", "DC", "-", "SIGN", "receptor", ".", "Efficiency", "of", "infection", "was", "assessed", "as", "in", "Figure", "1", ".", "Figure", "4B", "illustrates", "the", "results", "of", "an", "experiment", "to", "determine", "the", "glycosylation", "status", "of", "the", "E2", "glycoprotein", "on", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles", "produced", "in", "Figure", "4A.Figure", "5A", "is", "a", "Western", "blot", "(", "anti", "-", "HA", ")", "of", "HA", "-", "tagged", "SIVmacVpx", "expressed", "in", "293", "T", "cells", ".", "was", "cloned", "into", "a", "mammalian", "expression", "vector", "driven", "by", "a", "CMV", "promoter", "(", "construct", "named", "pENV", "-", "SIVmacVpx", ")", ".", "Figure", "5B", "is", "a", "Western", "blot", "(", "anti", "-", "HA", ")", "of", "viral", "protein", "extracts", "from", "viral", "particles", "comprising", "HA", "-", "tagged", "SIVmacVpx", ".", "100ng", "of", "p24", "was", "loaded", "per", "well", "onto", "a", "gel", "for", "immunoblotting", "with", "anti", "-", "HA", "antibody", ".", "Anti", "-", "p24", "antibody", "was", "used", "as", "a", "loading", "control", ".", "Figure", "6", "is", "a", "scatter", "plot", "of", "transduction", "events", "measured", "by", "gating", "on", "dendritic", "cells", "that", "were", "positive", "for", "CD11c", "and", "assessing", "the", "percentage", "of", "cells", "positive", "for", "GFP", "(", "x", "-", "axis", ";", "as", "a", "result", "of", "infection", "by", "the", "VSV", "-", "G", "pseudotyped", ",", "integration", "-", "defective", "lentivirus", "with", "or", "without", "Vpx", ")", "with", "DC", "-", "SIGN", "on", "the", "y", "-", "axis", ".", "Figure", "7", "is", "a", "scatter", "plot", "of", "transduction", "events", "measured", "by", "gating", "on", "dendritic", "cells", "that", "were", "positive", "for", "CD11c", "and", "assessing", "the", "percentage", "of", "cells", "positive", "for", "GFP", "(", "x", "-", "axis", ";", "as", "a", "result", "of", "infection", "by", "the", "VSV", "-", "G", "pseudotyped", ",", "integrat" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "12", ":", "A", "portion", "of", "the", "vector", "genome", "(", "top", ")", "is", "represented", "containing", "long", "terminal", "repeats", "(", "LTR", ")", "at", "each", "end", ".", "The", "splice", "donor", "(", "SD", ")", "and", "splice", "acceptor", "(", "SA", ")", "sites", "flank", "the", "psi", "packaging", "signal", "(", "Ψ", ")", ",", "the", "partial", "gag", "sequence", "and", "the", "Rev", "-", "responsive", "element", "(", "RRE", ")", ".", "Components", "between", "the", "antigen", "promoter", "(", "Promoter", ")", "and", "the", "3", "'", "LTR", "are", "not", "highlighted", "and", "therefore", "forward", "slash", "marks", "(", "//", ")", "are", "used", ".", "A", "portion", "of", "the", "WT", "gag", "/", "pol", "(", "middle", ")", "is", "represented", "showing", "the", "gag", "(", "black", "box", ")", "and", "pol", "(", "grey", "box", ")", "genes", "followed", "by", "the", "RRE", ".", "The", "two", "components", "that", "are", "homologous", "between", "the", "WT", "gag", "/", "pol", "and", "the", "vector", "genome", "(", "the", "RRE", "and", "the", "first", "354", "bp", "of", "gag", ")", "are", "represented", "in", "brackets", "(", "not", "drawn", "to", "scale", ")", ".", "The", "hypothesized", "region", "of", "recombination", "between", "the", "vector", "genome", "and", "the", "WT", "gag", "/", "pol", "are", "shown", "with", "connecting", "lines", ".", "A", "portion", "of", "the", "RI", "gag", "/", "pol", "(", "bottom", ")", "is", "represented", "showing", "the", "codon", "-", "optimized", "gag", "and", "pol", "genes", "(", "white", "boxes", "to", "distinguish", "from", "wild", "-", "type", ")", ".", "The", "non", "-", "codon", "-", "optimized", "frameshift", "between", "the", "gag", "and", "pol", "genes", "is", "represented", "in", "its", "native", "codon", "sequence", "(", "overlapping", "black", "and", "grey", "boxes", ")", ".", "Primers", "used", "for", "the", "psi", "-", "gag", "recombination", "assay", "are", "shown", "with", "their", "approximate", "locations", "on", "the", "constructs", ".", "First", "round", "PCR", "primers", "are", "represented", "with", "closed", "arrows", "and", "are", "the", "pairs", "709", "and", "710", "(", "to", "detect", "the", "psi", "-", "gag", "recombinant", ")", "or", "709", "and", "378", "(", "to", "detect", "integrated", "vector", "genome", ")", ".", "The", "expected", "amplicon", "for", "integrated", "vector", "with", "primer", "pairs", "709", "and", "378", "is", "1697", "bp", ".", "The", "nested", "PCR", "primers", "ar" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "e", "represented", "with", "open", "arrows", "and", "are", "the", "pairs", "863", "and", "835", "(", "to", "detect", "psi", "-", "gag", "recombinant", "with", "the", "WT", "gag", "/", "pol", ")", "or", "863", "and", "864", "(", "to", "detect", "psi", "-", "gag", "recombination", "with", "the", "RI", "gag", "/", "pol", ")", ".", "The", "expected", "amplicon", "with", "either", "of", "the", "psi", "-", "gag", "recombinant", "primer", "pairs", "is", "937", "bp", ".", "Figure", "13", ":", "293", "T", "cells", "were", "transfected", "with", "either", "WT", "gag", "/", "pol", "or", "RI", "gag", "/", "pol", "plasmids", "in", "the", "presence", "of", "either", "Rev", "plasmid", "(", "+", ")", "or", "empty", "backbone", "plasmid", "(", "-", ")", ".", "Twenty", "-", "four", "hours", "later", "cells", "were", "lysed", "and", "analyzed", "for", "expression", "of", "Gag", "proteins", "using", "anti", "-", "p24", "antibody", ".", "Unprocessed", "Gag", "protein", "(", "p55", ")", "and", "p24", "are", "indicated", "with", "arrows", ".", "Lysate", "from", "untransfected", "cells", "was", "included", "as", "a", "control", ".", "Equal", "loading", "of", "wells", "was", "confirmed", "with", "anti", "-", "actin", "antibody", ".", "Figure", "14A", ":", "GFP", "-", "encoding", "vector", "was", "produced", "with", "two", "plasmid", "amounts", "(", "6", "µg", "or", "3", "µg", ")", "of", "either", "WT", "gag", "/", "pol", "or", "RI", "gag", "/", "pol", ".", "Resulting", "p24", "levels", "in", "vector", "supernatant", "is", "shown", "in", "the", "table", ".", "Figure", "14B", ":", "293", "T", "cells", "were", "transduced", "with", "2", "-", "fold", "dilutions", "of", "vectors", "produced", "in", "14A", "and", "analyzed", "for", "GFP", "expression", "after", "2", "days", ".", "GFU", "/", "mL", "were", "calculated", "and", "plotted", "on", "the", "y", "-", "axis", ".", "The", "µg", "amount", "of", "gag", "/", "pol", "plasmid", "used", "to", "make", "vector", "(", "6", "µg", "or", "3", "µg", ")", "are", "plotted", "on", "the", "x", "-", "axis", ".", "WT", "gag", "/", "pol", "and", "RI", "gag", "/", "pol", "are", "shown", "in", "black", "or", "white", "columns", "respectively", ".", "Figure", "15", ":", "C57BL/6", "mice", "were", "immunized", "with", "the", "indicated", "doses", "(", "2", "×", "107", ",", "1", "×", "108", ",", "or", "5", "×", "108", "TU", ")", "of", "LV", "encoding", "full", "-", "length", "OVA", "or", "HBSS", "vehicle", "alone", ".", "LVs", "were", "either", "integration", "-", "competent", "(", "INT+", ")", "or", "integration", "-", "deficient", "(", "INT-", ")", "and", "gener" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term" ]
[ "ed", "(", "1:1", ")", ",", "or", "with", "1:100", ",", "or", "1:1000", "dilutions", "in", "a", "nested", "PCR", ".", "Primer", "pairs", "for", "nested", "PCR", "were", "either", "863", "and", "835", ",", "or", "863", "and", "864", ".", "The", "former", "pair", "(", "863", ",", "835", ")", "binds", "in", "the", "vector", "genome", "and", "the", "WT", "gag", "/", "pol", "respectively", ".", "The", "latter", "pair", "(", "863", ",", "864", ")", "binds", "in", "the", "vector", "genome", "and", "the", "RI", "gag", "/", "pol", ".", "All", "primers", "and", "their", "binding", "sites", "are", "schematized", "in", "Figure", "12", ".", "Template", "only", "controls", "were", "included", ".", "Resulting", "nested", "PCR", "products", "were", "visualized", "on", "a", "1", "%", "agarose", "gel", ".", "The", "amplicon", "size", "of", "the", "psi", "-", "gag", "recombinant", "is", "shown", "with", "an", "arrow", ".", "Figure", "17C", ":", "The", "band", "from", "the", "nested", "PCR", "for", "WT", "gag", "/", "pol", "(", "the", "bright", "band", "below", "1", "kb", ")", "was", "cloned", "into", "a", "TOPO", "-", "TA", "vector", "and", "sequenced", ".", "Sequence", "of", "the", "WT", "gag", "/", "pol", "psi", "-", "gag", "recombinant", "band", "is", "shown", "with", "regions", "marked", "for", "aligning", "with", "the", "vector", "genome", ",", "partial", "gag", "or", "WT", "gag", "/", "pol", ".", "Double", "slashes", "(", "//", ")", "and", "dots", "indicate", "sequences", "not", "shown", "for", "simplicity", ".", "Numbers", "on", "sequence", "indicate", "nucleotide", "position", "on", "the", "amplicon", ".", "Base", "pairs", "1", "-", "414", "of", "the", "psi", "-", "gag", "recombinant", "aligns", "with", "the", "vector", "genome", ",", "while", "bp", "120", "-", "937", "aligns", "with", "the", "WT", "gag", "/", "pol", ".", "For", "reference", ",", "the", "partial", "gag", "sequence", "is", "bp", "76", "-", "439", "of", "the", "recombinant", ".", "Figure", "17D", ":", "The", "band", "from", "nested", "PCR", "for", "the", "RI", "gag", "/", "pol", "(", "faint", "band", "between", "1", "kb", "and", "3", "kb", ")", "was", "cloned", "into", "a", "TOPO", "-", "TA", "vector", "and", "sequenced", ".", "Sequence", "of", "the", "RI", "gag", "/", "pol", "recombinant", "band", "is", "shown", "with", "regions", "marked", "for", "aligning", "with", "the", "vector", "genome", "or", "the", "RI", "gag", "/", "pol", ".", "Dots", "indicate", "sequences", "not", "shown", "for", "simplicity", ".", "Numbers", "on", "sequence", "indicate", "nucleotide" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "per", "group", ")", "were", "injected", "subcutaneously", "in", "the", "footpad", "with", "3", "×", "1010", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "GFP", ",", "control", "ID", "-", "VP02", "encoding", "a", "non", "-", "fluorescent", "protein", ",", "or", "left", "untreated", ".", "Four", "days", "later", ",", "the", "popliteal", "and", "cervical", "lymph", "nodes", "were", "separately", "pooled", "from", "5", "mice", "(", "3", "pools", "per", "treatment", "group", ")", "and", "analyzed", "for", "the", "presence", "of", "GFP", "-", "expressing", "cells", ".", "(", "A", ")", "Live", ",", "singlet", "events", "from", "the", "popliteal", "(", "draining", ")", "or", "cervical", "(", "non", "-", "draining", ")", "lymph", "nodes", "were", "analyzed", "for", "GFP", "expression", ".", "Popliteal", "lymph", "node", "cells", "from", "naive", "or", "negative", "control", "ID", "-", "VP02", "served", "as", "negative", "controls", ".", "(", "B", ")", "Frequency", "of", "CD11c", "and", "MHC", "-", "II", "on", "GFP+", "events", "from", "the", "popliteal", "lymph", "nodes", "of", "mice", "injected", "with", "GFP", "-", "encoding", "ID", "-", "VP02", "are", "shown", "as", "black", "dots", "overlayed", "on", "total", "B220-", "TCRβ-", "events", ",", "shown", "in", "gray", ",", "as", "a", "reference", ".", "(", "C", ")", "Expression", "of", "SIGNR1", "on", "GFP+", "CD11c+", "MHC", "-", "II+", "events", ",", "shown", "with", "(", "left", "panel", ")", "and", "without", "(", "right", "panel", ")", "inclusion", "of", "SIGNR1", "-", "specific", "antibody", ".", "Gate", "statistics", "are", "the", "mean", "value", "of", "three", "biological", "replicates", ".", "Values", "in", "panel", "(", "A", ")", "are", "number", "of", "positive", "events", "per", "1", "×", "106", "cells", ",", "whereas", "all", "other", "gate", "values", "are", "percentages", ".", "Figure", "21", ":", "C57BL/6", "mice", "(", "3", "per", "group", ")", "received", "a", "single", "subcutaneous", "injection", "of", "3", "×", "1010", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "at", "the", "base", "of", "the", "tail", ".", "Biodistribution", ",", "as", "determined", "by", "the", "presence", "of", "reverse", "-", "transcribed", "vector", "DNA", ",", "of", "ID", "-", "VP02", "in", "the", "indicated", "tissues", "was", "evaluated", "by", "quantitative", "PCR", "at", "1", ",", "4", ",", "8", ",", "21", ",", "or", "42", "days", "post", "-", "injection", ".", "Inguinal", "and", "cervical", "lymph", "nodes", "are", "indicated", "as", "dr" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ry", "of", "each", "population", "was", "compared", "between", "naïve", "and", "immunized", "mice", "to", "calculate", "specific", "killing", ".", "(", "C", ")", "BALB", "/", "c", "mice", "(", "10", "per", "group", ")", "were", "immunized", "with", "4", "×", "109", "vector", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "OVA", "-", "AH1A5", ".", "Four", "weeks", "later", ",", "mice", "were", "injected", "subcutaneously", "with", "8x104", "CT26", "tumor", "cells", "on", "the", "right", "flank", "and", "mice", "were", "euthanized", "when", "tumors", "exceeded", "100", "mm2", ".", "(", "D", ")", "Therapeutic", "immunization", ":", "BALB", "/", "c", "mice", "(", "10", "per", "group", ")", "were", "injected", "subcutaneously", "with", "8", "×", "104", "CT26", "tumor", "cells", ".", "Four", "days", "later", ",", "mice", "were", "either", "immunized", "with", "4x109", "vector", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "OVA", "-", "AH1A5", "or", "left", "untreated", "and", "mice", "were", "euthanized", "when", "tumors", "exceeded", "100", "mm2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O" ]
[ "Definitions" ]
[ "B-Term" ]
[ "As", "used", "herein", ",", "the", "terms", "\"", "integration", "deficient", "\"", "and", "\"", "integration", "defective", "\"", "are", "used", "interchangeably", ".", "An", "integration", "deficient", "viral", "vector", "is", "one", "that", "is", "at", "least", "10", "-", "fold", "(", "preferably", ",", "at", "least", "20", "-", "fold", ",", "at", "least", "30", "-", "fold", ",", "at", "least", "40", "-", "fold", ",", "at", "least", "50", "-", "fold", ",", "at", "least", "60", "-", "fold", ",", "at", "least", "70", "-", "fold", ",", "at", "least", "80", "-", "fold", ",", "at", "least", "90", "-", "fold", ",", "at", "least", "100", "-", "fold", ",", "at", "least", "150", "-", "fold", ",", "at", "least", "200", "-", "fold", ",", "at", "least", "250", "-", "fold", ",", "at", "least", "300", "-", "fold", ",", "at", "least", "350", "-", "fold", ",", "at", "least", "400", "-", "fold", ",", "at", "least", "450", "-", "fold", ",", "at", "least", "500", "-", "fold", ",", "at", "least", "550", "-", "fold", ",", "at", "least", "600", "-", "fold", ",", "at", "least", "650", "-", "fold", ",", "at", "least", "700", "-", "fold", ",", "at", "least", "750", "-", "fold", ",", "at", "least", "800", "-", "fold", ",", "at", "least", "850", "-", "fold", ",", "at", "least", "900", "-", "fold", ",", "at", "least", "950", "-", "fold", ",", "or", "at", "least", "1000", "-", "fold", ")", "less", "efficient", "at", "integrating", "than", "an", "integration", "-", "competent", "viral", "vector", ".", "For", "example", ",", "integration", "-", "deficient", "may", "mean", "at", "least", "about", "20", "-", "fold", "to", "about", "100", "-", "fold", "less", "efficient", "at", "integrating", "than", "a", "viral", "vector", "which", "has", "not", "been", "modified", "to", "be", "integration", "defective", ".", "Integration", "can", "be", "measured", "by", "any", "method", "known", "in", "the", "art", ",", "e.g.", ",", "by", "PCR", "detection", "of", "integration", "events", "near", "an", "Alu", "element", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "The", "Sindbis", "virus", "envelope", "protein", "contains", "four", "N", "-", "linked", "glycans", "-", "two", "on", "the", "E2", "protein", "and", "two", "on", "the", "E1", "protein", ".", "Two", "N", "-", "glycans", "of", "the", "virus", "produced", "in", "mammalian", "cells", "in", "the", "absence", "of", "a", "mannosidase", "I", "inhibitor", "have", "a", "high", "-", "mannose", "structure", "(", "one", "E2", "N", "-", "linked", "glycan", "and", "one", "E1", "N", "-", "linked", "glycan", ")", ",", "while", "the", "remaining", "two", "have", "a", "complex", "structure", ".", "The", "two", "complex", "structure", "N", "-", "glycans", "are", "exposed", "on", "the", "surface", "of", "the", "envelope", "protein", ",", "while", "the", "two", "high", "-", "mannose", "structure", "N", "-", "glycans", "are", "buried", "within", "the", "center", "of", "the", "trimer", "of", "the", "envelope", "proteins", ".", "See", "Morizono", "et", "al", ".", ",", "J", "Virol", ",", "84:14", ",", "6923", "-", "34", "(", "2010", ")", ",", "incorporated", "by", "reference", ".", "Accordingly", ",", "typically", "50", "%", "of", "the", "N", "-", "linked", "glycans", "on", "a", "viral", "particle", "with", "a", "Sindbis", "virus", "glycoprotein", "produced", "in", "mammalian", "cells", "would", "have", "the", "high", "-", "mannose", "structure", ".", "A", "\"", "highly", "mannosylated", "\"", "viral", "particle", "is", "a", "particle", "wherein", "at", "least", "60", "%", ",", "at", "least", "70", "%", ",", "at", "least", "80", "%", ",", "at", "least", "90", "%", ",", "at", "least", "95", "%", ",", "at", "least", "99", "%", ",", "or", "100", "%", "of", "N", "-", "linked", "glycans", "on", "the", "viral", "envelope", "glycoproteins", "comprise", "at", "least", "a", "Man5", "structure", ",", "preferably", "Man9", ",", "measured", "by", ",", "for", "example", ",", "mass", "spectrometry", "(", "see", "Crispin", "et", "al", ".", ",", "JBC", "2009", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Arthropod", "-", "borne", "viruses", "(", "Arboviruses", ")", "are", "viruses", "that", "are", "transmitted", "to", "a", "host", ",", "such", "as", "humans", ",", "horses", ",", "or", "birds", "by", "an", "infected", "arthropod", "vector", "such", "as", "a", "mosquito", ".", "Arboviruses", "are", "further", "divided", "into", "sub", "-", "families", "of", "viruses", "including", "alphaviruses", "and", "flaviviruses", ",", "which", "have", "a", "single", "-", "stranded", "RNA", "genome", "of", "positive", "polarity", "and", "a", "glycoprotein", "-", "containing", "envelope", ".", "For", "example", ",", "dengue", "fever", "virus", ",", "yellow", "fever", "virus", "and", "West", "Nile", "virus", "belong", "to", "the", "flavivirus", "family", ",", "and", "Sindbis", "virus", ",", "Semliki", "Forest", "virus", "and", "Venezuelan", "Equine", "Encephalitis", "virus", ",", "are", "members", "of", "the", "alphavirus", "family", "(", "Wang", "et", "al", ".", "J.", "Virol", ".", "66", ",", "4992", "(", "1992", ")", ")", ".", "The", "envelope", "of", "Sindbis", "virus", "includes", "two", "transmembrane", "glycoproteins", "(", "Mukhopadhyay", "et", "al", ".", "Nature", "Rev.", "Microbio", ".", "3", ",", "13", "(", "2005", ")", "):", "E1", ",", "believed", "to", "be", "responsible", "for", "fusion", ",", "and", "E2", ",", "believed", "to", "be", "responsible", "for", "cell", "binding", ".", "Sindbis", "virus", "envelope", "glycoproteins", "are", "known", "to", "pseudotype", "other", "retroviruses", ",", "including", "oncoretroviruses", "and", "lentiviruses", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "use", "of", "the", "terms", "\"", "attachment", ",", "\"", "\"", "binding", ",", "\"", "\"", "targeting", "\"", "and", "the", "like", "are", "used", "interchangeably", "and", "are", "not", "meant", "to", "indicate", "a", "mechanism", "of", "the", "interaction", "between", "Sindbis", "virus", "envelope", "glycoprotein", "and", "a", "cellular", "component", ".", "DC", "-", "SIGN", "(", "Dendritic", "Cell", "Specific", "ICAM-3", "(", "Intracellular", "Adhesion", "Molecules", "3)-Grabbing", "Nonintegrin", ";", "also", "known", "as", "CD209", ")", "is", "a", "C", "-", "type", "lectin", "-", "like", "receptor", "capable", "of", "rapid", "binding", "and", "endocytosis", "of", "materials", "(", "Geijtenbeek", ",", "T.", "B.", ",", "et", "al", ".", "Annu", ".", "Rev.", "Immunol", ".", "22", ":", "33", "-", "54", ",", "2004", ")", ".", "E2", "appears", "to", "target", "virus", "to", "dendritic", "cells", "through", "DC", "-", "SIGN", ".", "As", "shown", "herein", ",", "cells", "expressing", "DC", "-", "SIGN", "are", "transduced", "by", "viral", "vector", "particles", "pseudotyped", "with", "Sindbis", "virus", "E2", "better", "(", "at", "least", "2", "-", "fold", ",", "at", "least", "3", "-", "fold", ",", "at", "least", "4", "-", "fold", ",", "at", "least", "5", "-", "fold", ",", "at", "least", "6", "-", "fold", ",", "at", "least", "7", "-", "fold", ",", "at", "least", "8", "-", "fold", ",", "at", "least", "9", "-", "fold", ",", "or", "at", "least", "10", "-", "fold", "better", ")", "than", "isogenic", "cells", "that", "do", "n't", "express", "DC", "-", "SIGN", ".", "The", "mechanism", "of", "how", "E2", "glycoprotein", "facilitates", "viral", "infection", "appears", "to", "involve", "DC", "-", "SIGN", ",", "possibly", "through", "direct", "binding", "to", "DC", "-", "SIGN", "or", "causing", "a", "change", "in", "conformation", "or", "some", "other", "mechanism", ".", "Regardless", "of", "the", "actual", "mechanism", ",", "the", "targeting", "by", "E2", "is", "preferential", "for", "cells", "expressing", "DC", "-", "SIGN", ",", "namely", "dendritic", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "alpain", ")", ",", "metalloendopeptidases", ",", "(", "e.g.", ",", "collagenase", ",", "thermolysin", ")", ",", "serine", "endopeptidases", "(", "e.g.", ",", "chymotrypsin", ",", "factor", "IXa", ",", "factor", "X", ",", "thrombin", ",", "trypsin", ")", ",", "streptokinases", ".", "The", "recognition", "and", "cleavage", "site", "sequences", "for", "these", "enzymes", "are", "well", "known", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "promoter", "may", "be", "obtained", ",", "for", "example", ",", "from", "the", "genomes", "of", "viruses", "such", "as", "polyoma", "virus", ",", "fowlpox", "virus", ",", "adenovirus", ",", "bovine", "papilloma", "virus", ",", "avian", "sarcoma", "virus", ",", "cytomegalovirus", ",", "a", "retrovirus", ",", "hepatitis", "-", "B", "virus", "and", "Simian", "Virus", "40", "(", "SV40", ")", ".", "The", "promoter", "may", "also", "be", ",", "for", "example", ",", "a", "heterologous", "mammalian", "promoter", ",", "e.g.", ",", "the", "actin", "promoter", "or", "an", "immunoglobulin", "promoter", ",", "a", "heat", "-", "shock", "promoter", ",", "or", "the", "promoter", "normally", "associated", "with", "the", "native", "sequence", ",", "provided", "such", "promoters", "are", "compatible", "with", "the", "target", "cell", ".", "In", "one", "embodiment", ",", "the", "promoter", "is", "the", "naturally", "occurring", "viral", "promoter", "in", "a", "viral", "expression", "system", ".", "In", "some", "embodiments", ",", "the", "promoter", "is", "a", "dendritic", "cell", "-", "specific", "promoter", ".", "The", "dendritic", "cell", "-", "specific", "promoter", "can", "be", ",", "for", "example", ",", "CD11c", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "Transcription", "may", "be", "increased", "by", "inserting", "an", "enhancer", "sequence", "into", "the", "vector(s", ")", ".", "Enhancers", "are", "typically", "cis", "-", "acting", "elements", "of", "DNA", ",", "usually", "about", "10", "to", "300", "bp", "in", "length", ",", "that", "act", "on", "a", "promoter", "to", "increase", "its", "transcription", ".", "Many", "enhancer", "sequences", "are", "now", "known", "from", "mammalian", "genes", "(", "globin", ",", "elastase", ",", "albumin", ",", "alpha", "-", "fetoprotein", ",", "and", "insulin", ")", "and", "from", "eukaryotic", "cell", "viruses", ".", "Examples", "include", "the", "SV40", "enhancer", "on", "the", "late", "side", "of", "the", "replication", "origin", "(", "bp", "100", "-", "270", ")", ",", "the", "cytomegalovirus", "early", "promoter", "enhancer", ",", "the", "polyoma", "enhancer", "on", "the", "late", "side", "of", "the", "replication", "origin", ",", "and", "adenovirus", "enhancers", ".", "The", "enhancer", "may", "be", "spliced", "into", "the", "vector", "at", "a", "position", "5", "'", "or", "3", "'", "to", "the", "antigen", "-", "specific", "polynucleotide", "sequence", ",", "but", "is", "preferably", "located", "at", "a", "site", "5", "'", "from", "the", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tumor", "-", "associated", "antigens", "are", "known", "for", "a", "variety", "of", "cancers", "including", ",", "for", "example", ",", "renal", "cell", "carcinoma", ",", "prostate", "cancer", ",", "melanoma", ",", "and", "breast", "cancer", ".", "In", "some", "breast", "cancers", ",", "for", "example", ",", "the", "Her-2", "receptor", "is", "overexpressed", "on", "the", "surface", "of", "cancerous", "cells", ".", "Exemplary", "tumor", "antigens", "include", ",", "but", "are", "not", "limited", "to", ",", "MAGE", ",", "e.g.", ",", "MAGE", "-", "A3", "and", "MAGE", "-", "A1", ",", "BAGE", ",", "RAGE", ",", "and", "NY", "-", "ESO-1", ",", "which", "are", "unmutated", "antigens", "expressed", "in", "the", "immune", "-", "privileged", "areas", "of", "the", "testes", "and", "in", "a", "variety", "of", "tumor", "cells", ";", "lineage", "-", "specific", "tumor", "antigens", "such", "as", "the", "melanocyte", "-", "melanoma", "lineage", "antigens", ",", "MART-1", "/", "Melan", "-", "A", ",", "gp100", ",", "gp75", ",", "mda-7", ",", "tyrosinase", "and", "tyrosinase", "-", "related", "protein", ",", "e.g.", ",", "TRP2", ";", "renal", "cell", "carcinoma", "-", "5T4", ",", "SM22", "-", "alpha", ",", "carbonic", "anhydrases", "I", "and", "IX", "(", "also", "known", "as", "G250", ")", ",", "hypoxia", "-", "inducible", "factors", "(", "e.g.", ",", "HIF-1alpha", "and", "HIF-2alpha", ")", ",", "VEGF", "or", "prostate", "specific", "membrane", "antigen", "(", "PSMA", ")", ",", "prostate", "-", "specific", "antigen", "(", "PSA", ")", ",", "prostatic", "acid", "phosphates", ",", "and", "six", "-", "transmembrane", "epoithelial", "antigen", "of", "the", "prostate", "(", "STEAP", ")", ",", "NKX3.1", ",", "which", "are", "antigens", "expressed", "in", "normal", "and", "neoplastic", "cells", "derived", "from", "the", "same", "tissue", ";", "epitope", "proteins", "/", "peptides", "derived", "from", "genes", "mutated", "in", "tumor", "cells", "or", "genes", "transcribed", "at", "different", "levels", "in", "tumor", "compared", "to", "normal", "cells", ",", "such", "as", "telomerase", "enzyme", ",", "survivin", ",", "mesothelin", ",", "mutated", "ras", ",", "bcr", "/", "abl", "rearrangement", ",", "Her2", "/", "neu", ",", "mutated", "or", "wild", "-", "type", "p53", ",", "cytochrome", "P450", "1B1", ",", "and", "abnormally", "expressed", "intron", "sequences", "such", "as", "N", "-", "acetylglucosaminyltransferase", "-", "V", ";", "clonal", "rearrangements", "of", "immunogl" ]
[ "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "is", "derived", "from", "HIV-1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "further", "comprises", "a", "nucleotide", "sequence", "encoding", "a", "dendritic", "cell", "maturation", "/", "stimulatory", "factor", ".", "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "dendritic", "cell", "maturation", "/", "stimulatory", "factor", "is", "selected", "from", "the", "group", "consisting", "of", "GM", "-", "CSF", ",", "IL-2", ",", "IL-4", ",", "IL-6", ",", "IL-7", ",", "IL-15", ",", "IL-21", ",", "IL-23", ",", "TNFα", ",", "B7.1", ",", "B7.2", ",", "4", "-", "1BB", ",", "CD40", "ligand", ",", "and", "drug", "-", "mducible", "CD40", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "composition", "further", "comprises", "an", "adjuvant", ".", "For", "example", ",", "as", "disclosed", "herein", ",", "adjuvants", "include", "alum", ",", "or", "3", "De", "-", "O", "-", "acylated", "monophosphoryl", "lipid", "A", "(", "MPL", ")", ".", "Classes", "of", "adjuvants", "disclosed", "herein", "include", "(", "a", ")", "aluminum", "salts", ",", "(", "b", ")", "oil", "-", "in", "-", "water", "emulsion", "formulations", ",", "optionally", "with", "or", "without", "other", "specific", "immunostimulating", "agents", "such", "as", "muramyl", "peptides", "or", "other", "bacterial", "cell", "wall", "components", ",", "(", "c", ")", "saponin", "adjuvants", ",", "including", "ISCOMs", "(", "immunostimulating", "complexes", ")", "and", "ISCOMATRIX", ";", "(", "d", ")", "Complete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "CFA", ")", "and", "Incomplete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "IFA", ")", ";", "(", "e", ")", "cytokines", ";", "and", "(", "f", ")", "adjuvants", "of", "formula", "(", "I).wherein", "the", "moieties", "A1", "and", "A2", "are", "independently", "selected", "from", "the", "group", "of", "hydrogen", ",", "phosphate", ",", "and", "phosphate", "salts", ".", "Sodium", "and", "potassium", "are", "exemplary", "counterions", "for", "the", "phosphate", "salts", ".", "The", "moieties", "R1", ",", "R2", ",", "R3", ",", "R4", ",", "R5", ",", "and", "R6", "are", "independently", "selected", "from", "the", "group", "of", "hydrocarbyl", "having", "3", "to", "23", "carbons", ",", "represented", "by", "C3", "-", "C23", ".", "For", "added", "clarity", "it", "will", "be", "explained", "that", "when", "a", "moiety", "is", "\"", "independently", "selected", "from", "\"", "a", "specified", "group", "having", "multiple", "members", ",", "it", "should", "be", "understood", "that", "the", "member", "chosen", "for", "the", "first", "moiety", "does", "not", "in", "any", "way", "impact", "or", "limit", "the", "choice", "of", "the", "member", "selected", "for", "the", "second", "moiety", ".", "The", "carbon", "atoms", "to", "which", "R1", ",", "R3", ",", "R5", "and", "R6", "are", "joined", "are", "asymmetric", ",", "and", "thus", "may", "exist", "in", "either", "the", "R", "or", "S", "stereochemistry", ".", "In", "one", "embodiment", "all", "of", "those", "carbon", "atoms", "are", "in", "the", "R", "stereochemistry", ",", "while", "in", "anot" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Chemical", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "B-Term", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "her", "embodiment", "all", "of", "those", "carbon", "atoms", "are", "in", "the", "S", "stereochemistry", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "certain", "options", ",", "each", "of", "E2", "through", "E10", "is", "combined", "with", "embodiment", "E1", ",", "and/or", "the", "hydrocarbyl", "groups", "of", "E2", "through", "E9", "are", "alkyl", "groups", ",", "preferably", "straight", "chain", "alkyl", "groups", ".", "A", "preferred", "adjuvant", "is", "E1", "in", "combination", "with", "E10", ",", "where", "(", "i", ")", "A1", "is", "phosphate", "or", "phosphate", "salt", "and", "A2", "is", "hydrogen", "and", "(", "ii", ")", "R1", ",", "R3", ",", "R5", "and", "R6", "are", "undecyl", "and", "R2", "and", "R4", "are", "tridecyl", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "envelope", "glycoproteins", "also", "bind", "cells", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "of", "the", "embodiments", "described", "herein", ",", "the", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles", "also", "more", "efficiently", "transduce", "cells", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "compared", "to", "cells", "not", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "e", "represented", "with", "open", "arrows", "and", "are", "the", "pairs", "863", "and", "835", "(", "to", "detect", "psi", "-", "gag", "recombinant", "with", "the", "WT", "gag", "/", "pol", ")", "or", "863", "and", "864", "(", "to", "detect", "psi", "-", "gag", "recombination", "with", "the", "RI", "gag", "/", "pol", ")", ".", "The", "expected", "amplicon", "with", "either", "of", "the", "psi", "-", "gag", "recombinant", "primer", "pairs", "is", "937", "bp", ".", "Figure", "13", ":", "293", "T", "cells", "were", "transfected", "with", "either", "WT", "gag", "/", "pol", "or", "RI", "gag", "/", "pol", "plasmids", "in", "the", "presence", "of", "either", "Rev", "plasmid", "(", "+", ")", "or", "empty", "backbone", "plasmid", "(", "-", ")", ".", "Twenty", "-", "four", "hours", "later", "cells", "were", "lysed", "and", "analyzed", "for", "expression", "of", "Gag", "proteins", "using", "anti", "-", "p24", "antibody", ".", "Unprocessed", "Gag", "protein", "(", "p55", ")", "and", "p24", "are", "indicated", "with", "arrows", ".", "Lysate", "from", "untransfected", "cells", "was", "included", "as", "a", "control", ".", "Equal", "loading", "of", "wells", "was", "confirmed", "with", "anti", "-", "actin", "antibody", ".", "Figure", "14A", ":", "GFP", "-", "encoding", "vector", "was", "produced", "with", "two", "plasmid", "amounts", "(", "6", "µg", "or", "3", "µg", ")", "of", "either", "WT", "gag", "/", "pol", "or", "RI", "gag", "/", "pol", ".", "Resulting", "p24", "levels", "in", "vector", "supernatant", "is", "shown", "in", "the", "table", ".", "Figure", "14B", ":", "293", "T", "cells", "were", "transduced", "with", "2", "-", "fold", "dilutions", "of", "vectors", "produced", "in", "14A", "and", "analyzed", "for", "GFP", "expression", "after", "2", "days", ".", "GFU", "/", "mL", "were", "calculated", "and", "plotted", "on", "the", "y", "-", "axis", ".", "The", "µg", "amount", "of", "gag", "/", "pol", "plasmid", "used", "to", "make", "vector", "(", "6", "µg", "or", "3", "µg", ")", "are", "plotted", "on", "the", "x", "-", "axis", ".", "WT", "gag", "/", "pol", "and", "RI", "gag", "/", "pol", "are", "shown", "in", "black", "or", "white", "columns", "respectively", ".", "Figure", "15", ":", "C57BL/6", "mice", "were", "immunized", "with", "the", "indicated", "doses", "(", "2", "×", "107", ",", "1", "×", "108", ",", "or", "5", "×", "108", "TU", ")", "of", "LV", "encoding", "full", "-", "length", "OVA", "or", "HBSS", "vehicle", "alone", ".", "LVs", "were", "either", "integration", "-", "competent", "(", "INT+", ")", "or", "integration", "-", "deficient", "(", "INT-", ")", "and", "gener" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term" ]
[ "6", "mice", "(", "5", "per", "group", ")", "were", "immunized", "with", "5", "×", "1010", ",", "1", "×", "1010", ",", "or", "2", "×", "109", "vector", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "a", "polyepitope", "antigen", "(", "LV1b", ")", "that", "contains", "the", "H-2b", "-", "restricted", "OVA257", "and", "LCMV", "GP33", "CD8", "T", "cell", "epitopes", "and", "then", "challenged", "on", "day", "35", "post", "-", "immunization", "with", "1", "×", "107", "TCID50", "wild", "-", "type", "WR", "-", "strain", "vaccine", "virus", "(", "VV", "-", "WT", ")", ",", "WR", "-", "strain", "recombinant", "OVA", "vaccine", "virus", "(", "rVV", "-", "OVA", ")", ",", "or", "left", "unchallenged", ".", "On", "day", "40", "(", "day", "5", "post", "-", "challenge", ")", "splenic", "CD8", "T", "cell", "responses", "and", "viral", "load", "in", "the", "ovaries", "were", "measured", ".", "(", "B", ")", "OVA257-", "and", "LCMV", "GP33", "-", "specitic", "CD8", "T", "cell", "responses", "were", "measured", "by", "staining", "for", "intracellular", "IFN", "-", "γ", "and", "TNF", "-", "α", "after", "ex", "vivo", "peptide", "restimulation", ".", "Representative", "dot", "plots", "of", "the", "CD8", "T", "cell", "cytokine", "profile", "is", "shown", ".", "(", "C", ")", "Frequency", "of", "OVA-257", "-", "specific", "IFN", "-", "γ+", "CD8", "T", "cells", "for", "each", "animal", ".", "(", "D", ")", "Viral", "load", "(", "measured", "by", "TCID50", "assay", ")", "within", "the", "ovaries", "of", "each", "animal", ".", "Figure", "24", ":", "(", "A", ")", "BALB", "/", "c", "mice", "(", "5", "per", "group", ")", "were", "immunized", "with", "indicated", "doses", ",", "in", "vector", "genomes", ",", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "AH1A5", ",", "a", "heteroclitic", "mutant", "of", "the", "endogenous", "CT26", "tumor", "rejection", "epitope", "AH1", ",", "linked", "to", "OVA", "(", "OVA", "-", "AH1A5", ")", "or", "HBSS", "vehicle", "alone", ".", "At", "day", "12", "post", "immunization", ",", "the", "percentage", "of", "AH1A5-", "or", "AH1", "-", "specific", "splenic", "CD8", "T", "cells", "was", "measured", "by", "ICS", ".", "(", "B", ")", "Twelve", "days", "after", "immunization", ",", "a", "1:1:1", "mixture", "of", "dye", "-", "labeled", "target", "cells", "each", "pulsed", "with", "AH1", ",", "AH1A5", ",", "or", "a", "control", "peptide", "were", "transferred", "intravenously", "into", "immunized", "and", "naive", "mice", "(", "3", "per", "group", ")", ".", "The", "following", "day", ",", "spleens", "were", "harvested", "and", "the", "relative", "recove" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ry", "of", "each", "population", "was", "compared", "between", "naïve", "and", "immunized", "mice", "to", "calculate", "specific", "killing", ".", "(", "C", ")", "BALB", "/", "c", "mice", "(", "10", "per", "group", ")", "were", "immunized", "with", "4", "×", "109", "vector", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "OVA", "-", "AH1A5", ".", "Four", "weeks", "later", ",", "mice", "were", "injected", "subcutaneously", "with", "8x104", "CT26", "tumor", "cells", "on", "the", "right", "flank", "and", "mice", "were", "euthanized", "when", "tumors", "exceeded", "100", "mm2", ".", "(", "D", ")", "Therapeutic", "immunization", ":", "BALB", "/", "c", "mice", "(", "10", "per", "group", ")", "were", "injected", "subcutaneously", "with", "8", "×", "104", "CT26", "tumor", "cells", ".", "Four", "days", "later", ",", "mice", "were", "either", "immunized", "with", "4x109", "vector", "genomes", "of", "ID", "-", "VP02", "encoding", "OVA", "-", "AH1A5", "or", "left", "untreated", "and", "mice", "were", "euthanized", "when", "tumors", "exceeded", "100", "mm2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O" ]
[ "The", "term", "\"", "variant", "\"", "when", "used", "in", "reference", "to", "a", "polypeptide", "means", "a", "polypeptide", "that", "has", "one", "or", "more", "substitutions", ",", "deletions", "or", "insertions", "relative", "to", "a", "parent", "polypeptide", ".", "In", "some", "contexts", ",", "the", "variant", "is", "one", "that", "retains", "the", "desired", "activity", ".", "When", "used", "in", "reference", "to", "a", "Vpx", "protein", ",", "\"", "functional", "variant", "\"", "means", "a", "variant", "that", "retains", "the", "ability", "to", "inhibit", "the", "activity", "of", "SAMHD1", ".", "The", "term", "may", "analogously", "be", "applied", "to", "polynucleotides", "that", "have", "one", "or", "more", "substitutions", ",", "deletions", "or", "insertions", "relative", "to", "a", "parent", "polynucleotide", "." ]
[ "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "As", "used", "herein", ",", "the", "term", "\"", "conservative", "amino", "acid", "substitution", "\"", "is", "the", "replacement", "of", "one", "amino", "acid", "with", "another", "amino", "acid", "having", "similar", "properties", ",", "e.g.", "size", ",", "charge", ",", "hydrophobicity", ",", "hydrophilicity", ",", "and/or", "aromaticity", ",", "and", "includes", "exchanges", "as", "indicated", "below", ":" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Amino", "acid", "residues", "which", "share", "common", "side", "-", "chain", "properties", "are", "often", "grouped", "as", "follows", "." ]
[ "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "used", "herein", ",", "the", "terms", "\"", "integration", "deficient", "\"", "and", "\"", "integration", "defective", "\"", "are", "used", "interchangeably", ".", "An", "integration", "deficient", "viral", "vector", "is", "one", "that", "is", "at", "least", "10", "-", "fold", "(", "preferably", ",", "at", "least", "20", "-", "fold", ",", "at", "least", "30", "-", "fold", ",", "at", "least", "40", "-", "fold", ",", "at", "least", "50", "-", "fold", ",", "at", "least", "60", "-", "fold", ",", "at", "least", "70", "-", "fold", ",", "at", "least", "80", "-", "fold", ",", "at", "least", "90", "-", "fold", ",", "at", "least", "100", "-", "fold", ",", "at", "least", "150", "-", "fold", ",", "at", "least", "200", "-", "fold", ",", "at", "least", "250", "-", "fold", ",", "at", "least", "300", "-", "fold", ",", "at", "least", "350", "-", "fold", ",", "at", "least", "400", "-", "fold", ",", "at", "least", "450", "-", "fold", ",", "at", "least", "500", "-", "fold", ",", "at", "least", "550", "-", "fold", ",", "at", "least", "600", "-", "fold", ",", "at", "least", "650", "-", "fold", ",", "at", "least", "700", "-", "fold", ",", "at", "least", "750", "-", "fold", ",", "at", "least", "800", "-", "fold", ",", "at", "least", "850", "-", "fold", ",", "at", "least", "900", "-", "fold", ",", "at", "least", "950", "-", "fold", ",", "or", "at", "least", "1000", "-", "fold", ")", "less", "efficient", "at", "integrating", "than", "an", "integration", "-", "competent", "viral", "vector", ".", "For", "example", ",", "integration", "-", "deficient", "may", "mean", "at", "least", "about", "20", "-", "fold", "to", "about", "100", "-", "fold", "less", "efficient", "at", "integrating", "than", "a", "viral", "vector", "which", "has", "not", "been", "modified", "to", "be", "integration", "defective", ".", "Integration", "can", "be", "measured", "by", "any", "method", "known", "in", "the", "art", ",", "e.g.", ",", "by", "PCR", "detection", "of", "integration", "events", "near", "an", "Alu", "element", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "A", "\"", "pseudotyped", "\"", "lentivirus", "is", "a", "lentiviral", "particle", "having", "one", "or", "more", "envelope", "glycoproteins", "that", "are", "encoded", "by", "a", "virus", "that", "is", "distinct", "from", "the", "lentiviral", "genome", ".", "The", "envelope", "glycoprotein", "may", "be", "modified", ",", "mutated", "or", "engineered", "as", "described", "herein", "." ]
[ "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "used", "herein", ",", "the", "term", "\"", "exogenous", "antigen", "\"", "refers", "to", "an", "antigen", "that", "has", "been", "genetically", "engineered", "to", "be", "expressed", "in", "the", "lentiviral", "vectors", "disclosed", "herein", ".", "Accordingly", ",", "the", "term", "explicitly", "includes", "antigens", "derived", "from", "HIV", "that", "have", "been", "genetically", "engineered", "to", "be", "expressed", "in", "the", "lentiviral", "vectors", "disclosed", "herein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O" ]
[ "In", "some", "or", "any", "embodiments", ",", "the", "Vpx", "protein", "is", "fused", "to", "HIV-1", "Vpr", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "Typically", ",", "the", "Vpx", "protein", "is", "packaged", "in", "the", "viral", "particle", ".", "However", ",", "in", "some", "or", "any", "embodiments", ",", "a", "gene", "encoding", "a", "Vpx", "protein", "is", "included", "on", "the", "lentiviral", "genome", "and", "is", "expressed", "when", "the", "viral", "particle", "infects", "a", "target", "cell", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "porated", "by", "reference", "for", "envelope", "glycoprotein", "sequences", ")", "and", "sequence", "encoding", "Venezuelan", "equine", "encephalitis", "virus", "envelope", "glycoproteins", "in", "Accession", "NP", "040824", "(", "incorporated", "by", "reference", "for", "sequences", "of", "envelope", "glycoproteins", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "understood", "that", "references", "to", "a", "\"", "residue", "number", "of", "the", "E2", "glycoprotein", "\"", "(", "such", "as", "residue", "160", ",", "70", ",", "76", "or", "159", ")", "are", "defined", "by", "reference", "to", "the", "amino", "acid", "sequence", "of", "the", "protein", "of", "SEQ", "ID", "NO", ":", "18", ",", "which", "is", "the", "E2", "glycoprotein", "of", "Sindbis", "strain", "HR", "(", "i.e.", ",", "\"", "Sindbis", "HR", "reference", "strain", "\"", ")", ".", "For", "example", ",", "if", "a", "variant", "of", "Sindbis", "E2", "glycoprotein", "has", "been", "produced", "in", "which", "residue", "70", "has", "been", "deleted", "from", "SEQ", "ID", "NO", ":", "18", ",", "then", "\"", "residue", "160", "\"", "will", "refer", "to", "actual", "residue", "159", "of", "such", "a", "variant", ".", "Analogous", "positions", "in", "other", "alphaviruses", "can", "be", "determined", "through", "alignments", "that", "maximize", "homology", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "alpain", ")", ",", "metalloendopeptidases", ",", "(", "e.g.", ",", "collagenase", ",", "thermolysin", ")", ",", "serine", "endopeptidases", "(", "e.g.", ",", "chymotrypsin", ",", "factor", "IXa", ",", "factor", "X", ",", "thrombin", ",", "trypsin", ")", ",", "streptokinases", ".", "The", "recognition", "and", "cleavage", "site", "sequences", "for", "these", "enzymes", "are", "well", "known", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "about", "500:1", ",", "at", "least", "about", "1000:1", ",", "at", "least", "about", "5000:1", ",", "at", "least", "about", "10,000:1", ",", "or", "more", ".", "For", "limiting", "dilution", ",", "greater", "selectivity", "is", "typically", "seen", "at", "higher", "dilutions", "(", "i.e.", ",", "lower", "amounts", ")", "of", "input", "virus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lentiviral", "Vector", "Genome" ]
[ "B-Term", "I-Term", "I-Term" ]
[ "Suitable", "lentiviral", "vector", "genomes", "include", "those", "based", "on", "Human", "Immunodeficiency", "Virus", "(", "HIV-1", ")", ",", "HIV-2", ",", "feline", "immunodeficiency", "virus", "(", "FIV", ")", ",", "equine", "infectious", "anemia", "virus", ",", "Simian", "Immunodeficiency", "Virus", "(", "SIV", ")", "and", "maedi", "/", "visna", "virus", ".", "A", "desirable", "characteristic", "of", "lentiviruses", "is", "that", "they", "are", "able", "to", "infect", "both", "dividing", "and", "non", "-", "dividing", "cells", ",", "it", "is", "not", "necessary", "for", "target", "cells", "to", "be", "dividing", "(", "or", "to", "stimulate", "the", "target", "cells", "to", "divide", ")", ".", "Generally", ",", "the", "genome", "and", "envelope", "glycoproteins", "will", "be", "based", "on", "different", "viruses", ",", "such", "that", "the", "resulting", "viral", "vector", "particle", "is", "pseudotyped", ".", "Safety", "features", "of", "the", "vector", "genome", "are", "desirably", "incorporated", ".", "Safety", "features", "include", "self", "-", "inactivating", "LTR", "and", "a", "non", "-", "integrating", "genome", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "1558", "is", "codon", "optimized", ".", "In", "some", "embodiments", ",", "the", "codon", "optimized", "polynucleotide", "encoding", "Gag", "and", "Pol", "comprises", "SEQ", "ID", "NO", ":", "54", ".", "In", "some", "embodiments", ",", "the", "plasmid", "encoding", "the", "codon", "optimized", "gag", "-", "pol", "polynucleotide", "comprises", "the", "sequence", "of", "SEQ", "ID", "NO", ":", "55", "." ]
[ "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Alternatively", ",", "the", "promoter", "may", "be", "a", "tissue", "specific", "promoter", ".", "In", "some", "preferred", "embodiments", ",", "the", "promoter", "is", "a", "target", "cell", "-", "specific", "promoter", ".", "For", "example", ",", "the", "promoter", "can", "be", "from", "any", "product", "expressed", "by", "dendritic", "cells", ",", "including", "CD11c", ",", "CD103", ",", "TLRs", ",", "DC", "-", "SIGN", ",", "BDCA-3", ",", "DEC-205", ",", "DCIR2", ",", "mannose", "receptor", ",", "Dectin-1", ",", "Clec9A", ",", "MHC", "classII", ".", "In", "addition", ",", "promoters", "may", "be", "selected", "to", "allow", "for", "inducible", "expression", "of", "the", "sequence", "of", "interest", ".", "A", "number", "of", "systems", "for", "inducible", "expression", "are", "known", "in", "the", "art", ",", "including", "the", "tetracycline", "responsive", "system", ",", "the", "lac", "operator", "-", "repressor", "system", ",", "as", "well", "as", "promoters", "responsive", "to", "a", "variety", "of", "environmental", "or", "physiological", "changes", ",", "including", "heat", "shock", ",", "metal", "ions", ",", "such", "as", "metallothionein", "promoter", ",", "interferons", ",", "hypoxia", ",", "steroids", ",", "such", "as", "progesterone", "or", "glucocorticoid", "receptor", "promoter", ",", "radiation", ",", "such", "as", "VEGF", "promoter", ".", "A", "combination", "of", "promoters", "may", "also", "be", "used", "to", "obtain", "the", "desired", "expression", "of", "the", "gene", "of", "interest", ".", "The", "artisan", "of", "ordinary", "skill", "will", "be", "able", "to", "select", "a", "promoter", "based", "on", "the", "desired", "expression", "pattern", "of", "the", "gene", "in", "the", "organism", "or", "the", "target", "cell", "of", "interest", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "internal", "enhancer", "may", "also", "be", "present", "in", "the", "viral", "construct", "to", "increase", "expression", "of", "the", "gene", "of", "interest", ".", "For", "example", ",", "the", "CMV", "enhancer", "(", "Boshart", "et", "al", ".", "Cell", ",", "41:521", ",", "1985", ";", "which", "is", "incorporated", "herein", "by", "reference", "in", "its", "entirety", ")", "may", "be", "used", ".", "Many", "enhancers", "in", "viral", "genomes", ",", "such", "as", "HIV", ",", "CMV", ",", "and", "in", "mammalian", "genomes", "have", "been", "identified", "and", "characterized", "(", "see", "GenBank", ")", ".", "An", "enhancer", "can", "be", "used", "in", "combination", "with", "a", "heterologous", "promoter", ".", "One", "of", "ordinary", "skill", "in", "the", "art", "will", "be", "able", "to", "select", "the", "appropriate", "enhancer", "based", "on", "the", "desired", "expression", "pattern", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transcription", "may", "be", "increased", "by", "inserting", "an", "enhancer", "sequence", "into", "the", "vector(s", ")", ".", "Enhancers", "are", "typically", "cis", "-", "acting", "elements", "of", "DNA", ",", "usually", "about", "10", "to", "300", "bp", "in", "length", ",", "that", "act", "on", "a", "promoter", "to", "increase", "its", "transcription", ".", "Many", "enhancer", "sequences", "are", "now", "known", "from", "mammalian", "genes", "(", "globin", ",", "elastase", ",", "albumin", ",", "alpha", "-", "fetoprotein", ",", "and", "insulin", ")", "and", "from", "eukaryotic", "cell", "viruses", ".", "Examples", "include", "the", "SV40", "enhancer", "on", "the", "late", "side", "of", "the", "replication", "origin", "(", "bp", "100", "-", "270", ")", ",", "the", "cytomegalovirus", "early", "promoter", "enhancer", ",", "the", "polyoma", "enhancer", "on", "the", "late", "side", "of", "the", "replication", "origin", ",", "and", "adenovirus", "enhancers", ".", "The", "enhancer", "may", "be", "spliced", "into", "the", "vector", "at", "a", "position", "5", "'", "or", "3", "'", "to", "the", "antigen", "-", "specific", "polynucleotide", "sequence", ",", "but", "is", "preferably", "located", "at", "a", "site", "5", "'", "from", "the", "promoter", "." ]
[ "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "Plasmids", "containing", "one", "or", "more", "of", "the", "components", "described", "herein", "are", "readily", "constructed", "using", "standard", "techniques", "well", "known", "in", "the", "art", ".", "For", "analysis", "to", "confirm", "correct", "sequences", "in", "plasmids", "constructed", ",", "the", "plasmid", "may", "be", "replicated", "in", "E.", "coli", ",", "purified", ",", "and", "analyzed", "by", "restriction", "endonuclease", "digestion", "or", "its", "DNA", "sequence", "determined", "by", "conventional", "methods", "." ]
[ "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "Using", "the", "teachings", "provided", "herein", ",", "one", "of", "skill", "in", "the", "art", "will", "recognize", "that", "the", "efficacy", "of", "a", "particular", "expression", "system", "can", "be", "tested", "by", "transfecting", "packaging", "cells", "with", "a", "vector", "comprising", "a", "gene", "encoding", "a", "reporter", "protein", "and", "measuring", "the", "expression", "using", "a", "suitable", "technique", ",", "for", "example", ",", "measuring", "fluorescence", "from", "a", "green", "fluorescent", "protein", "conjugate", ".", "Suitable", "reporter", "genes", "are", "well", "known", "in", "the", "art", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Types", "of", "Sequences", "of", "interest" ]
[ "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term" ]
[ "In", "certain", "cases", ",", "the", "sequence", "of", "interest", "can", "be", "a", "gene", "encoding", "a", "small", "inhibiting", "RNA", "(", "siRNA", ")", "or", "a", "microRNA", "(", "miRNA", ")", "of", "interest", "that", "down", "-", "regulates", "expression", "of", "a", "molecule", ".", "For", "example", ",", "the", "gene", "encoding", "an", "siRNA", "or", "a", "microRNA", "can", "be", "used", "to", "down", "-", "regulate", "expression", "of", "negative", "regulators", "in", "a", "cell", ",", "including", "those", "that", "inhibit", "activation", "or", "maturation", "of", "dendritic", "cells", ".", "siRNAs", "and", "microRNAs", "are", "well", "known", "in", "the", "art", "(", "Fire", "et", "al", ".", ",", "Nature", "391:806", ",", "1998", ";", "see", "also", "\"", "The", "RNA", "Interference", "Resource", "\"", "of", "Applied", "Biosystems", ",", "Trang", "et", "al", ".", ",", "Oncogene", "Suppl", "2", ":", "S52", ",", "2008", ";", "Taganov", ",", "K.", ",", "et", "al", ".", "2007", ".", "Immunity", "26:133", "-", "137", ";", "Dahlberg", ",", "J.", "E.", "and", "E.", "Lund", ".", "2007", ".", "Sci", ".", "STKE", "387", ":", "pe25", ";", "Tiemann", "and", "Rossi", ",", "EMBO", "Mol", "Med", "1", ":", "142", ",", "2009", ")", ".", "Alternatively", ",", "the", "sequence", "of", "interest", "can", "encode", "a", "self", "-", "complementary", "double", "stranded", "RNA", "in", "which", "the", "complementary", "region", "is", "greater", "than", "about", "20", "ribonucleotides", "in", "length", ",", "or", "an", "anti", "-", "sense", "RNA", "that", "is", "greater", "than", "about", "20", "ribonucleotides", "in", "length", ".", "Those", "of", "ordinary", "skill", "in", "the", "art", "will", "appreciate", "that", "siRNA", ",", "miRNA", ",", "dsRNA", "and", "anti", "-", "sense", "RNA", "molecules", "can", "be", "expressed", "from", "an", "RNA", "polymerase", "III", "promoter", ",", "or", ",", "alternatively", ",", "can", "be", "a", "component", "of", "a", "non", "-", "coding", "RNA", "that", "is", "transcribed", "from", "an", "RNA", "polymerase", "II", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "Expression", "of", "two", "or", "more", "antigens", "can", "also", "be", "accomplished", "using", "bidirectional", "promoters", ",", "i.e.", ",", "a", "promoter", "region", "or", "two", "back", "-", "to", "-", "back", "cloned", "promoters", "whose", "reading", "directions", "point", "away", "from", "each", "other", ",", "and", "from", "which", "two", "open", "reading", "frames", "flanking", "the", "promoter", "region", "are", "transcribed", ".", "Examples", "of", "such", "promoters", "include", "the", "PDGF", "-", "A", ",", "neurotropic", "JC", "virus", ",", "BRCA1", ",", "transcobalamin", "II", ",", "and", "dipeptidylpeptidase", "IV", "promoters", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "a", "specific", "exemplification", ",", "the", "viral", "vector", "genome", "comprises", ":", "a", "cytomegalovirus", "(", "CMV", ")", "enhancer", "/", "promoter", "sequence", ";", "the", "R", "and", "U5", "sequences", "from", "the", "HIV", "5", "'", "LTR", ";", "a", "packaging", "sequence", "(", "ψ", ")", ";", "the", "HIV-1", "flap", "signal", ";", "an", "internal", "enhancer", ";", "an", "internal", "promoter", ";", "a", "gene", "of", "interest", ";", "the", "woodchuck", "hepatitis", "virus", "responsive", "element", ";", "a", "tRNA", "amber", "suppressor", "sequence", ";", "a", "U3", "element", "with", "a", "deletion", "of", "its", "enhancer", "sequence", ";", "the", "chicken", "β", "-", "globin", "insulator", ";", "and", "the", "R", "and", "U5", "sequences", "of", "the", "3", "'", "HIV", "LTR", ".", "In", "some", "exemplifications", ",", "the", "vector", "genome", "comprises", "an", "intact", "lentiviral", "5", "'", "LTR", "and", "a", "self", "-", "inactivating", "3", "'", "LTR", "(", "Iwakuma", "et", "al", ".", "Virology", "15:120", ",", "1999", ",", "incorporated", "by", "reference", "in", "its", "entirety", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Construction", "of", "the", "vector", "genome", "can", "be", "accomplished", "using", "any", "suitable", "genetic", "engineering", "techniques", "known", "in", "the", "art", ",", "including", ",", "without", "limitation", ",", "the", "standard", "techniques", "of", "restriction", "endonuclease", "digestion", ",", "ligation", ",", "transformation", ",", "plasmid", "purification", ",", "and", "DNA", "sequencing", ",", "for", "example", "as", "described", "in", "Sambrook", "et", "al", ".", "(", "1989", ".", "Molecular", "Cloning", ":", "A", "Laboratory", "Manual", ".", "Cold", "Spring", "Harbor", "Laboratory", "Press", ",", "N.Y.", ")", ",", "Coffin", "et", "al", ".", "(", "Retroviruses", ".", "Cold", "Spring", "Harbor", "Laboratory", "Press", ",", "N.Y.", "(", "1997", ")", ")", "and", "\"", "RNA", "Viruses", ":", "A", "Practical", "Approach", "\"", "(", "Alan", "J.", "Cann", ",", "Ed", ".", ",", "Oxford", "University", "Press", ",", "(", "2000", ")", ",", "each", "of", "the", "foregoing", "which", "is", "incorporated", "herein", "by", "reference", "in", "its", "entirety", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "glycosylation", "profile", "of", "a", "viral", "envelope", "protein", "can", "be", "determined", "by", "any", "method", "known", "in", "the", "art", ".", "For", "example", ",", "gel", "shift", "assays", "on", "viral", "glycoproteins", "treated", "with", "glycosidases", "(", "e.g.", ",", "EndoH", "or", "PNGaseF", ")", "or", "left", "untreated", "may", "be", "compared", ".", "Other", "methods", "include", "cleaving", "glycans", "from", "the", "viral", "glycoproteins", "and", "separating", "and", "identifying", "the", "components", "via", "HPLC", "and", "mass", "spectrometry", "methods", "." ]
[ "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O" ]
[ "Delivery", "of", "the", "Virus" ]
[ "O", "O", "O", "B-Term" ]
[ "Therapeutic", "and", "prophylactic", "immunizations" ]
[ "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term" ]
[ "In", "some", "of", "the", "viruses", ",", "DC", "maturation", "factors", "that", "activate", "and/or", "stimulate", "maturation", "of", "the", "DCs", "are", "delivered", "in", "conjunction", "with", "the", "sequence", "of", "interest", ".", "In", "alternatives", ",", "the", "DCs", "are", "activated", "by", "delivery", "of", "DC", "maturation", "factors", "prior", "to", ",", "simultaneously", "with", ",", "or", "after", "delivery", "of", "the", "virus", ".", "DC", "maturation", "factors", "may", "be", "provided", "separately", "from", "administration", "of", "the", "virus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "described", "herein", ",", "one", "or", "more", "immune", "modulation", "or", "DC", "maturation", "factors", "can", "be", "encoded", "by", "one", "or", "more", "sequences", "that", "are", "contained", "in", "the", "viral", "genome", "and", "expressed", "after", "the", "virus", "infects", "a", "dendritic", "cell", ".", "The", "sequences", "encoding", "immune", "modulation", "factors", "can", "also", "be", "provided", "in", "a", "separate", "vector", "that", "is", "co", "-", "transfected", "with", "the", "viral", "vector", "encoding", "one", "or", "more", "antigens", "in", "a", "packaging", "cell", "line", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "viral", "particles", "may", "be", "injected", "in", "vivo", ",", "where", "they", "infect", "DCs", "and", "deliver", "a", "sequence", "of", "interest", ",", "typically", "encoding", "an", "antigen", ".", "The", "amount", "of", "viral", "particles", "is", "at", "least", "3X106", "IU", ",", "and", "can", "be", "at", "least", "1X107", "IU", ",", "at", "least", "3X107IU", ",", "at", "least", "1X108", "IU", ",", "at", "least", "3X108", "IU", ",", "at", "least", "1X109", "IU", ",", "or", "at", "least", "3X109", "IU", ".", "At", "selected", "intervals", ",", "DCs", "from", "the", "recipient", "'s", "lymphoid", "organs", "may", "be", "used", "to", "measure", "expression", ",", "for", "example", ",", "by", "observing", "marker", "expression", ",", "such", "as", "GFP", "or", "luciferase", ".", "Nucleic", "acid", "monitoring", "techniques", "and", "measurements", "of", "reverse", "transcriptase", "(", "RT", ")", "activity", "can", "also", "be", "used", "to", "analyze", "the", "biodistribution", "of", "viral", "particles", ".", "T", "cells", "from", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", ",", "lymph", "nodes", ",", "spleens", ",", "or", "malignant", "or", "target", "pathogen", "-", "infected", "tissue", "of", "lentiviral", "vector", "particle", "-", "treated", "recipients", "may", "be", "measured", "from", "the", "magnitude", "and", "durability", "of", "response", "to", "antigen", "stimulation", ".", "Tissue", "cells", "other", "than", "DCs", ",", "such", "as", "epithelial", "cells", "and", "lymphoid", "cells", ",", "may", "be", "analyzed", "for", "the", "specificity", "of", "in", "vivo", "gene", "delivery", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "A", "variety", "of", "adjuvants", "can", "be", "used", "in", "combination", "with", "the", "virus", "to", "elicit", "an", "immune", "response", "to", "the", "antigen", "encoded", "in", "the", "viral", "vector", "genome", ".", "Preferred", "adjuvants", "augment", "the", "intrinsic", "response", "to", "an", "antigen", "without", "causing", "conformational", "changes", "in", "the", "antigen", "that", "affect", "the", "qualitative", "form", "of", "the", "response", ".", "Preferred", "adjuvants", "include", "alum", ",", "3", "De", "-", "O", "-", "acylated", "monophosphoryl", "lipid", "A", "(", "MPL", ")", "(", "see", "GB", "2220211", ")", ".", "QS21", "is", "a", "triterpene", "glycoside", "or", "saponin", "isolated", "from", "the", "bark", "of", "the", "Quillaja", "Saponaria", "Molina", "tree", "found", "in", "South", "America", "(", "see", "Kensil", "et", "al", ".", ",", "in", "Vaccine", "Design", ":", "The", "Subunit", "and", "Adjuvant", "Approach", "(", "eds", ".", "Powell", "and", "Newman", ",", "Plenum", "Press", ",", "NY", ",", "1995", ")", ";", "U.S.", "Pat", ".", "No", ".", "5,057,540", ")", ".", "Other", "adjuvants", "are", "oil", "in", "water", "emulsions", "(", "such", "as", "squalene", "or", "peanut", "oil", ")", ",", "optionally", "in", "combination", "with", "immune", "stimulants", ",", "such", "as", "monophosphoryl", "lipid", "A", "(", "see", "Stoute", "et", "al", ".", ",", "N.", "Engl", "J.", "Med", ".", "336", ",", "86", "-", "91", "(", "1997", ")", ")", ".", "Another", "adjuvant", "is", "CpG", "(", "Bioworld", "Today", ",", "Nov.", "15", ",", "1998", ")", ".", "Adjuvants", "can", "be", "administered", "as", "a", "component", "of", "a", "therapeutic", "composition", "with", "an", "active", "agent", "or", "can", "be", "administered", "separately", ",", "before", ",", "concurrently", "with", ",", "or", "after", "administration", "of", "the", "therapeutic", "agent", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "B-Chemical", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "omponents", "from", "the", "group", "consisting", "of", "monophosphorylipid", "A", "(", "MPL", ")", ",", "trehalose", "dimycolate", "(", "TDM", ")", ",", "and", "cell", "wall", "skeleton", "(", "CWS", ")", ",", "preferably", "MPL+CWS", "(", "Detox", "™", ")", ".", "Another", "class", "of", "preferred", "adjuvants", "is", "saponin", "adjuvants", ",", "such", "as", "Stimulon", ".", "TM", ".", "(", "QS21", ",", "Aquila", ",", "Worcester", ",", "Mass.", ")", "or", "particles", "generated", "there", "from", "such", "as", "ISCOMs", "(", "immunostimulating", "complexes", ")", "and", "ISCOMATRIX", ".", "Other", "adjuvants", "include", "Complete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "CFA", ")", "and", "Incomplete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "IFA", ")", ".", "Other", "adjuvants", "include", "cytokines", ",", "such", "as", "interleukins", "(", "IL-1", ",", "IL-2", ",", "and", "IL-12", ")", ",", "macrophage", "colony", "stimulating", "factor", "(", "M", "-", "CSF", ")", ",", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Chemical", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O" ]
[ "The", "adjuvant", "of", "formula", "(", "I", ")", "may", "be", "formulated", "into", "a", "pharmaceutical", "composition", ",", "optionally", "with", "a", "co", "-", "adjuvant", ",", "each", "as", "discussed", "below", ".", "In", "this", "regard", "reference", "is", "made", "to", "US", "Patent", "Publication", "No", ".", "2008/0131466", "which", "provides", "formulations", ",", "e.g.", ",", "aqueous", "formulation", "(", "AF", ")", "and", "stable", "emulsion", "formulations", "(", "SE", ")", "for", "GLA", "adjuvant", ",", "where", "these", "formulations", "may", "be", "utilized", "for", "any", "of", "the", "adjuvants", "of", "formula", "(", "I", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pharmaceutical", "compositions", "and", "kits" ]
[ "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term" ]
[ "Also", "contemplated", "herein", "are", "pharmaceutical", "compositions", "and", "kits", "containing", "a", "virus", "provided", "herein", "and", "one", "or", "more", "components", ".", "Pharmaceutical", "compositions", "can", "include", "viral", "vector", "particles", "as", "provided", "herein", "and", "a", "pharmaceutical", "carrier", ".", "Kits", "can", "include", "the", "pharmaceutical", "compositions", "and/or", "combinations", "provided", "herein", ",", "and", "one", "or", "more", "components", ",", "such", "as", "instructions", "for", "use", ",", "a", "device", "for", "administering", "a", "compound", "to", "a", "subject", ",", "and", "a", "device", "for", "administering", "a", "compound", "to", "a", "subject", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Kits", "comprising", "a", "viral", "vector", "encoding", "a", "sequence", "of", "interest", "(", "typically", "an", "antigen", ")", "and", "optionally", ",", "a", "polynucleotide", "sequence", "encoding", "a", "DC", "maturation", "factor", "are", "also", "contemplated", "herein", ".", "In", "some", "kits", ",", "the", "kit", "includes", "at", "least", "one", "plasmid", "encoding", "virus", "packaging", "components", "and", "a", "vector", "encoding", "Sindbis", "virus", "E2", "glycoprotein", "variant", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "Exemplary", "Embodiments" ]
[ "B-Term", "I-Term" ]
[ "Methods", "of", "generating", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles" ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term" ]
[ "In", "some", "embodiments", "of", "the", "disclosure", ",", "a", "method", "of", "generating", "a", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "comprises", ":" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "mannosidase", "inhibitor", "is", "kifunensine", "or", "DMNJ", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "SAMHD1", "inhibitor", "is", "a", "Vpx", "protein", ",", "e.g.", ",", "a", "SIVmac", "Vpx", "protein", ",", "a", "SIVsm", "protein", ",", "a", "SIVrcm", ",", "or", "an", "HIV-2", "Vpx", "protein", ".", "In", "specific", "aspects", ",", "the", "SAMHD1", "inhibitor", "is", "an", "antibody", "or", "fragment", "thereof", ".", "In", "specific", "aspects", ",", "the", "SAMHD1", "inhibitor", "is", "a", "Vpr", "protein", "with", "SAMHD1", "-", "inhibiting", "ability", ",", "e.g.", ",", "a", "SIVdeb", "Vpr", "protein", "or", "a", "SIVmus", "Vpr", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "kifunensine", "is", "present", "in", "the", "culture", "medium", "at", "a", "concentration", "of", "about", "0.1", "µg", "/", "ml", "to", "about", "10", "µg", "/", "ml", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "kifunensine", "is", "present", "in", "the", "culture", "medium", "at", "a", "concentration", "of", "about", "0.25", "µg", "/", "ml", "to", "about", "2", "µg", "/", "ml", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "kifunensine", "is", "present", "in", "the", "culture", "medium", "at", "a", "concentration", "of", "about", "0.01", "µg", "/", "ml", "to", "about", "1", "mg", "/", "ml", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "virus", "packaging", "cell", "further", "comprises", ":" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "(", "i", ")", "a", "polynucleotide", "comprising", "gag", "and", "pol", "genes", ";", "and(ii", ")", "a", "polynucleotide", "encoding", "a", "rev", "protein", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "polynucleotide", "encoding", "the", "Vpx", "protein", "is", "on", "the", "same", "or", "different", "plasmid", "as", "the", "polynucleotide", "encoding", "the", "rev", "protein", ",", "or", "the", "polynucleotide", "comprising", "the", "gag", "and", "pol", "genes", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "gag", "and", "pol", "genes", "are", "human", "codon", "optimized", "and", "comprise", "a", "non", "-", "optimized", "window", "around", "position", "1228", "to", "1509", "of", "SEQ", "ID", "NO", ":", "54", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "polynucleotide", "comprising", "gag", "and", "pol", "genes", "lacks", "a", "functional", "rev", "responsive", "element", "(", "RRE", ")", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "pol", "gene", "encodes", "an", "inactive", "integrase", "enzyme", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "integrase", "enzyme", "has", "a", "D64V", "mutation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "is", "derived", "from", "HIV-1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "of", "the", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "or", "packaging", "system", "of", "any", "of", "the", "preceding", "embodiments", "is", "capable", "of", "integrating", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "has", "an", "inactivated", "3", "'", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", "or", "a", "self", "-", "inactivating", "3", "'", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "comprises", "a", "U3", "element", "lacking", "at", "least", "one", "of", "an", "enhancer", "sequence", ",", "a", "TATA", "box", ",", "an", "Spl", "site", ",", "an", "NK", "-", "kappa", "B", "site", ",", "or", "a", "polypurine", "tract", "(", "PPT", ")", ".", "In", "some", "aspects", ",", "the", "pol", "gene", "encodes", "an", "inactive", "integrase", "enzyme", "and", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "lacks", "a", "functional", "polypurine", "tract", "(", "PPT", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "a", "lentiviral", "vector", "particle", "produced", "by", "the", "method", "of", "paragraph", "[", "0206", "]", ",", "[", "0210", "]", ",", "or", "[", "0218", "]", "is", "provided", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "a", "lentiviral", "vector", "particle", "produced", "by", "the", "method", "of", "paragraph", "[", "0216", "]", "is", "provided", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Compositions", "comprising", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles" ]
[ "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "Vpx", "protein", "comprises", "an", "amino", "acid", "sequence", "at", "least", "80", "%", "identical", "to", "SIVmac", "Vpx", "(", "SEQ", "ID", "NO", ":", "44", ")", ",", "SIVsm", "Vpx", "(", "SEQ", "ID", "NO", ":", "45", ")", ",", "SIVrcm", "Vpx" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "of", "the", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "or", "packaging", "system", "of", "any", "of", "the", "preceding", "embodiments", "is", "capable", "of", "integrating", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "lentiviral", "vector", "genome", "of", "the", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "or", "packaging", "system", "of", "any", "of", "the", "preceding", "embodiments", "is", "integration", "deficient", "or", "integration", "defective", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "some", "aspects", ",", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles", "comprise", "a", "Rev", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "composition", "further", "comprises", "an", "immunostimulating", "agent", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "composition", "further", "comprises", "an", "adjuvant", ".", "For", "example", ",", "as", "noted", "above", ",", "adjuvants", "include", "alum", ",", "or", "3", "De", "-", "O", "-", "acylated", "monophosphoryl", "lipid", "A", "(", "MPL", ")", ".", "Classes", "of", "adjuvants", "disclosed", "herein", "include", "(", "a", ")", "aluminum", "salts", ",", "(", "b", ")", "oil", "-", "in", "-", "water", "emulsion", "formulations", ",", "optionally", "with", "or", "without", "other", "specific", "immunostimulating", "agents", "such", "as", "muramyl", "peptides", "or", "other", "bacterial", "cell", "wall", "components", ",", "(", "c", ")", "saponin", "adjuvants", ",", "including", "ISCOMs", "(", "immunostimulating", "complexes", ")", "and", "ISCOMATRIX", ";", "(", "d", ")", "Complete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "CFA", ")", "and", "Incomplete", "Freund", "'s", "Adjuvant", "(", "IFA", ")", ";", "(", "e", ")", "cytokines", ";", "and", "(", "f", ")", "adjuvants", "of", "formula", "(", "I", ")", ".", "Within", "formula", "(", "I", ")", ",", "a", "preferred", "adjuvant", "is", "Product", "No", ".", "699800", "as", "identified", "in", "the", "catalog", "of", "Avanti", "Polar", "Lipids", ",", "Alabaster", ",", "AL", ",", "see", "E1", "in", "combination", "with", "E10", ",", "where", "(", "i", ")", "A1", "is", "phosphate", "or", "phosphate", "salt", "and", "A2", "is", "hydrogen", "and", "(", "ii", ")", "R1", ",", "R3", ",", "R5", "and", "R6", "are", "undecyl", "and", "R2", "and", "R4", "are", "tridecyl", ".", "In", "specific", "aspects", ",", "the", "envelope", "glycoproteins", "also", "bind", "cells", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "B-Chemical", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "specific", "aspects", ",", "the", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particles", "also", "more", "efficiently", "transduce", "cells", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "compared", "to", "cells", "not", "expressing", "mouse", "SIGNR1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "O" ]
[ "In", "some", "embodiments", "of", "the", "disclosure", ",", "there", "is", "provided", "a", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "capable", "of", "targeting", "a", "cell", "expressing", "comprising", ":" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "some", "aspects", ",", "pseudotyped", "lentiviral", "vector", "particle", "further", "comprises", "a", "Rev", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O" ]
[ "The", "present", "invention", "provides", "an", "anhydrous", "crystal", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", "and", "a", "preparation", "method", "thereof", ".", "The", "preparation", "method", "comprises", "using", "an", "organic", "solvent", "to", "precipitate", "a", "solid", "from", "a", "saturated", "solution", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", ",", "drying", "it", "under", "vacuum", "to", "obtain", "an", "anhydrous", "crystal", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "invention", "belongs", "to", "the", "technical", "field", "of", "pharmacy", ",", "and", "in", "particular", "relates", "to", "a", "crystal", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", "and", "a", "preparation", "method", "thereof", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Polymyxin", "B", "is", "an", "alkaline", "cyclic", "polypeptide", "antibiotic", "produced", "by", "bacillus", "polymyxa", "and", "composed", "of", "various", "amino", "acids", "and", "fatty", "acids", ".", "Polymyxin", "B", "product", "is", "a", "multi", "-", "component", "compound", ",", "including", "polymyxin", "B1", ",", "B2", ",", "B3", ",", "B1", "-", "I", "(", "it", "is", "required", "that", "the", "sum", "of", "these", "four", "components", "≥80.0", "%", "in", "the", "European", "Pharmacopoeia", ")", ",", "and", "its", "sulfate", "is", "commonly", "used", ",", "which", "is", "a", "white", "or", "off", "-", "white", "powder", "with", "hygroscopicity", ".", "Polymyxin", "B", "sulfate", "has", "a", "strong", "killing", "effect", "on", "Gram", "-", "negative", "bacteria", ",", "and", "in", "particular", ",", "it", "renders", "high", "in", "vitro", "sensitivity", "to", "NDM-1", "bacteria", "(", "super", "bacteria", ")", ",", "and", "thus", "has", "attracted", "much", "attention", ".", "Since", "the", "two", "components", ",", "polymyxin", "B3", "and", "B1", "-", "I", ",", "are", "nephrotoxic", ",", "a", "mixture", "containing", "the", "four", "components", "is", "mainly", "for", "external", "use", "clinically", ".", "The", "two", "components", ",", "B1", "and", "B2", ",", "have", "low", "side", "effects", "and", "can", "be", "used", "for", "injection", ".", "High", "levels", "of", "polymyxin", "B1", "and", "B2", "crystals", "have", "higher", "product", "quality", "and", "can", "be", "more", "used", "for", "injection", "." ]
[ "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "O", "B-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "B-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "for", "the", "refining", "of", "polymyxin", "B", "sulfate", "product", ",", "it", "is", "usually", "carried", "out", "by", "a", "spray", "drying", "method", "(", "patent", "application", "CN201210519331.7", ")", "or", "a", "lyophilization", "method", "(", "patent", "application", "CN201510775580.6", ")", "due", "to", "its", "difficulty", "to", "crystallize", ".", "The", "current", "patent", "about", "polymyxin", "B", "crystal", "includes", "polymyxin", "B1", "dihydrate", "crystal", "disclosed", "in", "the", "patent", "application", "CN201210379231.9", ",", "which", "explicitly", "claims", "a", "compound", "having", "a", "molecular", "formula", "of", "C56H98N16O13·2H2O", ",", "which", "is", "not", "a", "sulfate", ".", "The", "polymyxin", "B1", "dihydrate", "crystal", "of", "the", "patent", "is", "obtained", "by", "precipitation", "using", "a", "mixture", "of", "acetone", "and", "diethyl", "ether", ".", "Diethyl", "ether", "is", "extremely", "volatile", "and", "easily", "to", "be", "oxidized", "in", "air", "and", "causes", "an", "explosion", ",", "which", "is", "not", "suitable", "for", "industrial", "production", ".", "In", "addition", ",", "the", "products", "on", "the", "market", "are", "all", "mixtures", "of", "polymyxin", "B", "sulfate", ".", "Regarding", "the", "preparation", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", "monomer", ",", "the", "patent", "application", "filed", "by", "the", "present", "applicant", "has", "been", "granted", "(", "Patent", "No", ".", "ZL201110390624.5", ")", ",", "in", "which", "the", "polymyxin", "B1", "sulfate", "has", "a", "purity", "of", "99.5", "%", ",", "and", "its", "solid", "is", "obtained", "by", "spray", "drying", "method", ".", "However", ",", "the", "polymyxin", "B", "sulfate", "prepared", "by", "the", "current", "spray", "drying", "method", "is", "difficult", "to", "form", "a", "crystal", "form", ",", "and", "the", "product", "is", "very", "easy", "to", "agglomerate", ",", "which", "brings", "inconvenience", "to", "production", "and", "research", ",", "and", "also", "affects", "the", "quality", "and", "efficacy", "of", "the", "drug", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "view", "of", "the", "problems", "existing", "in", "the", "prior", "art", ",", "the", "present", "invention", "provides", "a", "crystal", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", "and", "a", "preparation", "method", "thereof", ",", "wherein", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "polymyxin", "B2", "sulfate", "or", "a", "mixture", "thereof", "can", "be", "prepared", "by", "the", "method", "described", "in", "the", "patent", "ZL201110390624.5", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "invention", "provides", "an", "anhydrous", "crystal", "1", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "has", "an", "X", "-", "ray", "powder", "diffraction", "pattern", "having", "diffraction", "peaks", "at", "3.396", ",", "4.895", "and", "6.903", "expressed", "by", "2θ", "degree", "using", "Cu", "-", "Ka", "radiation", ";", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "has", "an", "X", "-", "ray", "powder", "diffraction", "pattern", "expressed", "by", "2θ", "degree", "using", "Cu", "-", "Ka", "radiation", "as", "shown", "in", "Figure", "2A." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "has", "an", "infrared", "absorption", "spectrum", "having", "characteristic", "bands", "at", "1071.93", "cm-1", ",", "1242.91", "cm-1", ",", "1384.25", "cm-1", ",", "1457.69", "cm-1", ",", "1524.29", "cm-1", ",", "1639.38", "cm-1", ",", "2957.69", "cm-1", ",", "3064.55", "cm-1", "and", "3270.53", "cm-1", "as", "measured", "by", "KBr", "tableting", "method", ";", "and", "more", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "has", "an", "infrared", "absorption", "spectrum", "as", "measured", "by", "KBr", "tableting", "method", "as", "shown", "in", "Figure", "3A." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "More", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "has", "a", "melting", "point", "of", "226.97", "°", "C", ",", "and", "has", "a", "differential", "scanning", "calorimetry", "pattern", "as", "shown", "in", "Figure", "4", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "inventor", "conducted", "a", "more", "detailed", "analysis", "on", "anhydrous", "crystal", "1", ",", "in", "which", "said", "anhydrous", "crystal", "1", "exhibits", "a", "dynamic", "moisture", "adsorption", "analysis", "spectrum", "as", "shown", "in", "Figure", "5", ",", "a", "thermogravimetric", "analysis", "spectrum", "as", "shown", "in", "Figure", "6", ",", "and", "an", "isotherm", "diagram", "as", "shown", "in", "Figure", "7", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "invention", "also", "provides", "an", "anhydrous", "crystal", "A", "of", "polymyxin", "B1", "sulfate", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "A", "has", "an", "X", "-", "ray", "powder", "diffraction", "pattern", "having", "a", "diffraction", "peak", "at", "3.401", "expressed", "by", "2θ", "degree", "using", "Cu", "-", "Ka", "radiation", ";", "and", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "A", "has", "an", "X", "-", "ray", "powder", "diffraction", "pattern", "expressed", "by", "2θ", "degree", "using", "Cu", "-", "Ka", "radiation", "as", "shown", "in", "Figure", "8A." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Chemical", "I-Chemical", "I-Chemical", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "A", "has", "an", "infrared", "absorption", "spectrum", "having", "characteristic", "bands", "at", "1071.93", "cm-1", ",", "1242.91", "cm-1", ",", "1384.25", "cm-1", ",", "1457.69", "cm-1", ",", "1524.29", "cm-1", ",", "1639.38", "cm-1", ",", "2957.69", "cm-1", ",", "3064.55", "cm-1", "and", "3270.53", "cm-1", "as", "measured", "by", "KBr", "tableting", "method", ";", "and", "more", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "A", "has", "an", "infrared", "absorption", "spectrum", "as", "measured", "by", "KBr", "tableting", "method", "as", "shown", "in", "Figure", "9A." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "More", "preferably", ",", "said", "anhydrous", "crystal", "A", "has", "a", "melting", "point", "of", "225.00", "°", "C", ",", "and", "a", "differential", "scanning", "calorimetry", "pattern", "as", "shown", "in", "Figure", "10", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "O", "B-Lab_value", "I-Lab_value", "I-Lab_value", "O", "O", "O", "B-Term", "I-Term", "I-Term", "I-Term", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

No dataset card yet

New: Create and edit this dataset card directly on the website!

Contribute a Dataset Card
Downloads last month
4
Add dataset card