Datasets:

chintagunta85

/

ncbi_disease

like 0

[ "Identification", "of", "APC2", ",", "a", "homologue", "of", "the", "adenomatous", "polyposis", "coli", "tumour", "suppressor", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0 ]

[ "The", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "tumour", "-", "suppressor", "protein", "controls", "the", "Wnt", "signalling", "pathway", "by", "forming", "a", "complex", "with", "glycogen", "synthase", "kinase", "3beta", "(", "GSK", "-", "3beta", ")", ",", "axin", "/", "conductin", "and", "betacatenin", "." ]

[ 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Complex", "formation", "induces", "the", "rapid", "degradation", "of", "betacatenin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "colon", "carcinoma", "cells", ",", "loss", "of", "APC", "leads", "to", "the", "accumulation", "of", "betacatenin", "in", "the", "nucleus", ",", "where", "it", "binds", "to", "and", "activates", "the", "Tcf", "-", "4", "transcription", "factor", "(", "reviewed", "in", "[", "1", "]", "[", "2", "]", ")", "." ]

[ 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "report", "the", "identification", "and", "genomic", "structure", "of", "APC", "homologues", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mammalian", "APC2", ",", "which", "closely", "resembles", "APC", "in", "overall", "domain", "structure", ",", "was", "functionally", "analyzed", "and", "shown", "to", "contain", "two", "SAMP", "domains", ",", "both", "of", "which", "are", "required", "for", "binding", "to", "conductin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Like", "APC", ",", "APC2", "regulates", "the", "formation", "of", "active", "betacatenin", "-", "Tcf", "complexes", ",", "as", "demonstrated", "using", "transient", "transcriptional", "activation", "assays", "in", "APC", "-", "/", "-", "colon", "carcinoma", "cells", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0 ]

[ "Human", "APC2", "maps", "to", "chromosome", "19p13", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "." ]

[ 0, 0 ]

[ "APC", "and", "APC2", "may", "therefore", "have", "comparable", "functions", "in", "development", "and", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "A", "common", "MSH2", "mutation", "in", "English", "and", "North", "American", "HNPCC", "families", ":", "origin", ",", "phenotypic", "expression", ",", "and", "sex", "specific", "differences", "in", "colorectal", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]

[ "The", "frequency", ",", "origin", ",", "and", "phenotypic", "expression", "of", "a", "germline", "MSH2", "gene", "mutation", "previously", "identified", "in", "seven", "kindreds", "with", "hereditary", "non", "-", "polyposis", "cancer", "syndrome", "(", "HNPCC", ")", "was", "investigated", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutation", "(", "A", "-", "-", ">", "T", "at", "nt943", "+", "3", ")", "disrupts", "the", "3", "splice", "site", "of", "exon", "5", "leading", "to", "the", "deletion", "of", "this", "exon", "from", "MSH2", "mRNA", "and", "represents", "the", "only", "frequent", "MSH2", "mutation", "so", "far", "reported", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Although", "this", "mutation", "was", "initially", "detected", "in", "four", "of", "33", "colorectal", "cancer", "families", "analysed", "from", "eastern", "England", ",", "more", "extensive", "analysis", "has", "reduced", "the", "frequency", "to", "four", "of", "52", "(", "8", "%", ")", "English", "HNPCC", "kindreds", "analysed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "MSH2", "mutation", "was", "identified", "in", "10", "of", "20", "(", "50", "%", ")", "separately", "identified", "colorectal", "families", "from", "Newfoundland", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "investigate", "the", "origin", "of", "this", "mutation", "in", "colorectal", "cancer", "families", "from", "England", "(", "n", "=", "4", ")", ",", "Newfoundland", "(", "n", "=", "10", ")", ",", "and", "the", "United", "States", "(", "n", "=", "3", ")", ",", "haplotype", "analysis", "using", "microsatellite", "markers", "linked", "to", "MSH2", "was", "performed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Within", "the", "English", "and", "US", "families", "there", "was", "little", "evidence", "for", "a", "recent", "common", "origin", "of", "the", "MSH2", "splice", "site", "mutation", "in", "most", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "contrast", ",", "a", "common", "haplotype", "was", "identified", "at", "the", "two", "flanking", "markers", "(", "CA5", "and", "D2S288", ")", "in", "eight", "of", "the", "Newfoundland", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "findings", "suggested", "a", "founder", "effect", "within", "Newfoundland", "similar", "to", "that", "reported", "by", "others", "for", "two", "MLH1", "mutations", "in", "Finnish", "HNPCC", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "We", "calculated", "age", "related", "risks", "of", "all", ",", "colorectal", ",", "endometrial", ",", "and", "ovarian", "cancers", "in", "nt943", "+", "3", "A", "-", "-", ">", "T", "MSH2", "mutation", "carriers", "(", "n", "=", "76", ")", "for", "all", "patients", "and", "for", "men", "and", "women", "separately", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "For", "both", "sexes", "combined", ",", "the", "penetrances", "at", "age", "60", "years", "for", "all", "cancers", "and", "for", "colorectal", "cancer", "were", "0", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "86", "and", "0", "." ]

[ 0, 0, 0, 0 ]

[ "57", ",", "respectively", "." ]

[ 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "risk", "of", "colorectal", "cancer", "was", "significantly", "higher", "(", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "in", "males", "than", "females", "(", "0", ".", "63", "v", "0", ".", "30", "and", "0", ".", "84", "v", "0", ".", "44", "at", "ages", "50", "and", "60", "years", ",", "respectively", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "For", "females", "there", "was", "a", "high", "risk", "of", "endometrial", "cancer", "(", "0", ".", "5", "at", "age", "60", "years", ")", "and", "premenopausal", "ovarian", "cancer", "(", "0", ".", "2", "at", "50", "years", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "intersex", "differences", "in", "colorectal", "cancer", "risks", "have", "implications", "for", "screening", "programmes", "and", "for", "attempts", "to", "identify", "colorectal", "cancer", "susceptibility", "modifiers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "Age", "of", "onset", "in", "Huntington", "disease", ":", "sex", "specific", "influence", "of", "apolipoprotein", "E", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Age", "of", "onset", "(", "AO", ")", "of", "Huntington", "disease", "(", "HD", ")", "is", "known", "to", "be", "correlated", "with", "the", "length", "of", "an", "expanded", "CAG", "repeat", "in", "the", "HD", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "Apolipoprotein", "E", "(", "APOE", ")", "genotype", ",", "in", "turn", ",", "is", "known", "to", "influence", "AO", "in", "Alzheimer", "disease", ",", "rendering", "the", "APOE", "gene", "a", "likely", "candidate", "to", "affect", "AO", "in", "other", "neurological", "diseases", "too", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0 ]

[ "We", "therefore", "determined", "APOE", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", "in", "the", "HD", "gene", "for", "138", "HD", "patients", "who", "were", "previously", "analysed", "with", "respect", "to", "CAG", "repeat", "length", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Genotyping", "for", "APOE", "was", "performed", "blind", "to", "clinical", "information", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", "to", "highlighting", "the", "effect", "of", "the", "normal", "repeat", "length", "upon", "AO", "in", "maternally", "inherited", "HD", "and", "in", "male", "patients", ",", "we", "show", "that", "the", "APOE", "epsilon2epsilon3", "genotype", "is", "associated", "with", "significantly", "earlier", "AO", "in", "males", "than", "in", "females", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Such", "a", "sex", "difference", "in", "AO", "was", "not", "apparent", "for", "any", "of", "the", "other", "APOE", "genotypes", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Our", "findings", "suggest", "that", "subtle", "differences", "in", "the", "course", "of", "the", "neurodegeneration", "in", "HD", "may", "allow", "interacting", "genes", "to", "exert", "gender", "specific", "effects", "upon", "AO", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Familial", "deficiency", "of", "the", "seventh", "component", "of", "complement", "associated", "with", "recurrent", "bacteremic", "infections", "due", "to", "Neisseria", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "serum", "of", "a", "29", "-", "year", "old", "woman", "with", "a", "recent", "episode", "of", "disseminated", "gonococcal", "infection", "and", "a", "history", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "was", "found", "to", "lack", "serum", "hemolytic", "complement", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "seventh", "component", "of", "complement", "(", "C7", ")", "was", "not", "detected", "by", "functional", "or", "immunochemical", "assays", ",", "whereas", "other", "components", "were", "normal", "by", "hemolytic", "and", "immunochemical", "assessment", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Her", "fresh", "serum", "lacked", "complement", "-", "mediated", "bactericidal", "activity", "against", "Neisseria", "gonorrhoeae", ",", "but", "the", "addition", "of", "fresh", "normal", "serum", "or", "purified", "C7", "restored", "bactericidal", "activity", "as", "well", "as", "hemolytic", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "absence", "of", "functional", "C7", "activity", "could", "not", "be", "accounted", "for", "on", "the", "basis", "of", "an", "inhibitor", "." ]

[ 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Opsonization", "and", "generation", "of", "chemotactic", "activity", "functioned", "normally", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Complete", "absence", "of", "C7", "was", "also", "found", "in", "one", "sibling", "who", "had", "the", "clinical", "syndrome", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "and", "in", "this", "siblings", "clinically", "well", "eight", "-", "year", "-", "old", "son", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "HLA", "histocompatibility", "typing", "of", "the", "family", "members", "did", "not", "demonstrate", "evidence", "for", "genetic", "linkage", "of", "C7", "deficiency", "with", "the", "major", "histocompatibility", "loci", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "report", "represents", "the", "first", "cases", "of", "C7", "deficiency", "associated", "with", "infectious", "complications", "and", "suggests", "that", "bactericidal", "activity", "may", "be", "important", "in", "host", "defense", "against", "bacteremic", "neisseria", "infections", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0 ]

[ "Increased", "incidence", "of", "cancer", "in", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "OBJECTIVE", "Previous", "reports", "have", "suggested", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", "among", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", "(", "CHH", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0 ]

[ "This", "study", "was", "carried", "out", "to", "further", "evaluate", "this", "risk", "among", "patients", "with", "CHH", "and", "their", "first", "-", "degree", "relatives", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "STUDY", "DESIGN", "One", "hundred", "twenty", "-", "two", "patients", "with", "CHH", "were", "identified", "through", "2", "countrywide", "epidemiologic", "surveys", "in", "1974", "and", "in", "1986", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Their", "parents", "and", "nonaffected", "siblings", "were", "identified", "through", "the", "Population", "Register", "Center", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "cohort", "underwent", "follow", "-", "up", "for", "cancer", "incidence", "through", "the", "Finnish", "Cancer", "Registry", "to", "the", "end", "of", "1995", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "RESULTS", "A", "statistically", "significant", "excess", "risk", "of", "cancer", "was", "seen", "among", "the", "patients", "with", "CHH", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "6", ".", "9", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "2", ".", "3", "to", "16", ")", ",", "which", "was", "mainly", "attributable", "to", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "90", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "18", "to", "264", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "a", "significant", "excess", "risk", "of", "basal", "cell", "carcinoma", "was", "seen", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "35", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "7", ".", "2", "to", "102", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "cancer", "incidence", "among", "the", "siblings", "or", "the", "parents", "did", "not", "differ", "from", "the", "average", "cancer", "incidence", "in", "the", "Finnish", "population", "." ]

[ 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "CONCLUSIONS", "This", "study", "confirms", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", ",", "especially", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", ",", "probably", "attributable", "to", "defective", "immunity", ",", "among", "patients", "with", "CHH", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "Genotype", "and", "phenotype", "in", "patients", "with", "dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "deficiency", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0 ]

[ "Dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "(", "DPD", ")", "deficiency", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disease", "characterised", "by", "thymine", "-", "uraciluria", "in", "homozygous", "deficient", "patients", "and", "has", "been", "associated", "with", "a", "variable", "clinical", "phenotype", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "order", "to", "understand", "the", "genetic", "and", "phenotypic", "basis", "for", "DPD", "deficiency", ",", "we", "have", "reviewed", "17", "families", "presenting", "22", "patients", "with", "complete", "deficiency", "of", "DPD", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0 ]

[ "In", "this", "group", "of", "patients", ",", "7", "different", "mutations", "have", "been", "identified", ",", "including", "2", "deletions", "[", "295", "-", "298delTCAT", ",", "1897delC", "]", ",", "1", "splice", "-", "site", "mutation", "[", "IVS14", "+", "1G", ">", "A", ")", "]", "and", "4", "missense", "mutations", "(", "85T", ">", "C", ",", "703C", ">", "T", ",", "2658G", ">", "A", ",", "2983G", ">", "T", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Analysis", "of", "the", "prevalence", "of", "the", "various", "mutations", "among", "DPD", "patients", "has", "shown", "that", "the", "G", "-", "-", ">", "A", "point", "mutation", "in", "the", "invariant", "splice", "donor", "site", "is", "by", "far", "the", "most", "common", "(", "52", "%", ")", ",", "whereas", "the", "other", "six", "mutations", "are", "less", "frequently", "observed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "large", "phenotypic", "variability", "has", "been", "observed", ",", "with", "convulsive", "disorders", ",", "motor", "retardation", "and", "mental", "retardation", "being", "the", "most", "abundant", "manifestations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "clear", "correlation", "between", "the", "genotype", "and", "phenotype", "has", "not", "been", "established", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "An", "altered", "beta", "-", "alanine", ",", "uracil", "and", "thymine", "homeostasis", "might", "underlie", "the", "various", "clinical", "abnormalities", "encountered", "in", "patients", "with", "DPD", "deficiency", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]

[ "Fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "2", "(", "FHF2", ")", ":", "gene", "structure", ",", "expression", "and", "mapping", "to", "the", "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "region", "in", "Xq26", "delineated", "by", "a", "duplication", "breakpoint", "in", "a", "BFLS", "-", "like", "patient", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "(", "BFLS", ")", "is", "a", "syndromal", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", ",", "which", "maps", "by", "linkage", "to", "the", "q26", "region", "of", "the", "human", "X", "chromosome", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "identified", "a", "male", "patient", "with", "BFLS", "-", "like", "features", "and", "a", "duplication", ",", "46", ",", "Y", ",", "dup", "(", "X", ")", "(", "q26q28", ")", ",", "inherited", "from", "his", "phenotypically", "normal", "mother", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Fluorescence", "in", "situ", "hybridisation", "using", "yeast", "artificial", "chromosome", "clones", "from", "Xq26", "localised", "the", "duplication", "breakpoint", "to", "an", "approximately", "400", "-", "kb", "interval", "in", "the", "Xq26", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "region", "between", "DXS155", "and", "DXS294", "/", "DXS730", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Database", "searches", "and", "analysis", "of", "available", "genomic", "DNA", "sequence", "from", "the", "region", "revealed", "the", "presence", "of", "the", "fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "gene", ",", "FHF2", ",", "within", "the", "duplication", "breakpoint", "interval", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "gene", "structure", "of", "FHF2", "was", "determined", "and", "two", "new", "exons", "were", "identified", ",", "including", "a", "new", "5", "end", "exon", ",", "1B", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "FHF2", "is", "a", "large", "gene", "extending", "over", "approximately", "200", "kb", "in", "Xq26", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "and", "is", "composed", "of", "at", "least", "seven", "exons", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "It", "shows", "tissue", "-", "specific", "alternative", "splicing", "and", "alternative", "transcription", "starts", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Northern", "blot", "hybridisation", "showed", "highest", "expression", "in", "brain", "and", "skeletal", "muscle", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "FHF2", "gene", "localisation", "and", "tissue", "-", "specific", "expression", "pattern", "suggest", "it", "to", "be", "a", "candidate", "gene", "for", "familial", "cases", "of", "the", "BFLS", "syndrome", "and", "other", "syndromal", "and", "non", "-", "specific", "forms", "of", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", "mapping", "to", "the", "region", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Germline", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "mutations", "predispose", "to", "familial", "gastric", "cancer", "and", "colorectal", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 5, 6, 0 ]

[ "Inherited", "mutations", "in", "the", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "were", "described", "recently", "in", "three", "Maori", "kindreds", "with", "familial", "gastric", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0 ]

[ "Familial", "gastric", "cancer", "is", "genetically", "heterogeneous", "and", "it", "is", "not", "clear", "what", "proportion", "of", "gastric", "cancer", "susceptibility", "in", "non", "-", "Maori", "populations", "is", "due", "to", "germline", "CDH1", "mutations", "." ]

[ 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Therefore", ",", "we", "screened", "eight", "familial", "gastric", "cancer", "kindreds", "of", "British", "and", "Irish", "origin", "for", "germline", "CDH1", "mutations", ",", "by", "SSCP", "analysis", "of", "all", "16", "exons", "and", "flanking", "sequences", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Each", "family", "contained", "(", "i", ")", "two", "cases", "of", "gastric", "cancer", "in", "first", "degree", "relatives", "with", "one", "affected", "before", "age", "50", "years", ";", "or", "(", "ii", ")", "three", "or", "more", "cases", "of", "gastric", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]

[ "Novel", "germline", "CDH1", "mutations", "(", "a", "nonsense", "and", "a", "splice", "site", ")", "were", "detected", "in", "two", "families", "(", "25", "%", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Both", "mutations", "were", "predicted", "to", "truncate", "the", "E", "-", "cadherin", "protein", "in", "the", "signal", "peptide", "domain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "one", "family", "there", "was", "evidence", "of", "non", "-", "penetrance", "and", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancer", ";", "thus", ",", "in", "addition", "to", "six", "cases", "of", "gastric", "cancer", ",", "a", "CDH1", "mutation", "carrier", "developed", "colorectal", "cancer", "at", "age", "30", "years", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "confirmed", "that", "germline", "mutations", "in", "the", "CDH1", "gene", "cause", "familial", "gastric", "cancer", "in", "non", "-", "Maori", "populations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "However", ",", "only", "a", "minority", "of", "familial", "gastric", "cancers", "can", "be", "accounted", "for", "by", "CDH1", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Loss", "of", "E", "-", "cadherin", "function", "has", "been", "implicated", "in", "the", "pathogenesis", "of", "sporadic", "colorectal", "and", "other", "cancers", ",", "and", "our", "findings", "provide", "evidence", "that", "germline", "CDH1", "mutations", "predispose", "to", "early", "onset", "colorectal", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]

[ "Thus", ",", "CDH1", "should", "be", "investigated", "as", "a", "cause", "of", "inherited", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "A", "zinc", "finger", "truncation", "of", "murine", "WT1", "results", "in", "the", "characteristic", "urogenital", "abnormalities", "of", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "Wilms", "tumor", "-", "suppressor", "gene", ",", "WT1", ",", "plays", "a", "key", "role", "in", "urogenital", "development", ",", "and", "WT1", "dysfunction", "is", "implicated", "in", "both", "neoplastic", "(", "Wilms", "tumor", ",", "mesothelioma", ",", "leukemias", ",", "and", "breast", "cancer", ")", "and", "nonneoplastic", "(", "glomerulosclerosis", ")", "disease", "." ]

[ 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 5, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 5, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "The", "analysis", "of", "diseases", "linked", "specifically", "with", "WT1", "mutations", ",", "such", "as", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "(", "DDS", ")", ",", "can", "provide", "valuable", "insight", "concerning", "the", "role", "of", "WT1", "in", "development", "and", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "DDS", "is", "a", "rare", "childhood", "disease", "characterized", "by", "a", "nephropathy", "involving", "mesangial", "sclerosis", ",", "XY", "pseudohermaphroditism", ",", "and", "/", "or", "Wilms", "tumor", "(", "WT", ")", "." ]

[ 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 6, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0 ]

[ "DDS", "patients", "are", "constitutionally", "heterozygous", "for", "exonic", "point", "mutations", "in", "WT1", ",", "which", "include", "mutations", "predicted", "to", "truncate", "the", "protein", "within", "the", "C", "-", "terminal", "zinc", "finger", "(", "ZF", ")", "region", "." ]

[ 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "report", "that", "heterozygosity", "for", "a", "targeted", "murine", "Wt1", "allele", ",", "Wt1", "(", "tmT396", ")", ",", "which", "truncates", "ZF3", "at", "codon", "396", ",", "induces", "mesangial", "sclerosis", "characteristic", "of", "DDS", "in", "adult", "heterozygous", "and", "chimeric", "mice", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Male", "genital", "defects", "also", "were", "evident", "and", "there", "was", "a", "single", "case", "of", "Wilms", "tumor", "in", "which", "the", "transcript", "of", "the", "nontargeted", "allele", "showed", "an", "exon", "9", "skipping", "event", ",", "implying", "a", "causal", "link", "between", "Wt1", "dysfunction", "and", "Wilms", "tumorigenesis", "in", "mice", "." ]

[ 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "However", ",", "the", "mutant", "WT1", "(", "tmT396", ")", "protein", "accounted", "for", "only", "5", "%", "of", "WT1", "in", "both", "heterozygous", "embryonic", "stem", "cells", "and", "the", "WT", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "This", "has", "implications", "regarding", "the", "mechanism", "by", "which", "the", "mutant", "allele", "exerts", "its", "effect", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mechanism", "of", "increased", "iron", "absorption", "in", "murine", "model", "of", "hereditary", "hemochromatosis", ":", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "iron", "transporter", "DMT1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Hereditary", "hemochromatosis", "(", "HH", ")", "is", "a", "common", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "tissue", "iron", "deposition", "secondary", "to", "excessive", "dietary", "iron", "absorption", "." ]

[ 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "recently", "reported", "that", "HFE", ",", "the", "protein", "defective", "in", "HH", ",", "was", "physically", "associated", "with", "the", "transferrin", "receptor", "(", "TfR", ")", "in", "duodenal", "crypt", "cells", "and", "proposed", "that", "mutations", "in", "HFE", "attenuate", "the", "uptake", "of", "transferrin", "-", "bound", "iron", "from", "plasma", "by", "duodenal", "crypt", "cells", ",", "leading", "to", "up", "-", "regulation", "of", "transporters", "for", "dietary", "iron", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "tested", "the", "hypothesis", "that", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "have", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "divalent", "metal", "transporter", "(", "DMT1", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "By", "4", "weeks", "of", "age", ",", "the", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "demonstrated", "iron", "loading", "when", "compared", "with", "HFE", "+", "/", "+", "littermates", ",", "with", "elevated", "transferrin", "saturations", "(", "68", ".", "4", "%", "vs", ".", "49", ".", "8", "%", ")", "and", "elevated", "liver", "iron", "concentrations", "(", "985", "micrograms", "vs", ".", "381", "micrograms", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "By", "using", "Northern", "blot", "analyses", ",", "we", "quantitated", "duodenal", "expression", "of", "both", "classes", "of", "DMT1", "transcripts", "one", "containing", "an", "iron", "responsive", "element", "(", "IRE", ")", ",", "called", "DMT1", "(", "IRE", ")", ",", "and", "one", "containing", "no", "IRE", ",", "called", "DMT1", "(", "non", "-", "IRE", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]