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[ "हेटेरोहैब्डाइटिस बैक्टीरियोफोरा एन्टोमपैथोजेनिक नेमाटोड हैं जिन्होंने अत्यधिक विषाक्त कीट रोगजनकों के रूप में कार्य करने के लिए फोटोहैबडस लुमिनेसेंस बैक्टीरिया के साथ एक पारस्परिकता विकसित की है।", "सूत्रकृमि मिट्टी में आंतों के प्रतीकों के लिए एक सुरक्षित बंदरगाह प्रदान करता है और सहजीवी बैक्टीरिया को कीट के रक्त में वितरित करता है।", "यह सहजीवी विषाक्तता और विषाक्त पदार्थ, सूत्रकृमि प्रजनन के लिए आवश्यक चयापचय और कीट शव का प्रतिजैविक संरक्षण प्रदान करता है।", "21, 250 अनुमानित प्रोटीन कोडिंग जीन में से लगभग आधे की पहचान 77 एमबीपी उच्च गुणवत्ता वाले ड्राफ्ट एच में की गई है।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम अनुक्रम अज्ञात कार्य के नए प्रोटीन थे जिनमें सिनोरहैबडाइटिस एलिगन्स या किसी अन्य अनुक्रमित जीव में समरूपता की कमी थी।", "इसी तरह, अनुमानित 603 स्रावित प्रोटीनों में से 317 19 अनुमानित पेप्टिडेस, 9 पेप्टिडेस अवरोधक और 7 सी-प्रकार के लेक्टिन के अलावा अज्ञात कार्य के साथ नए हैं जो कीट मेजबान या जीवाणु सहजीवी के साथ बातचीत में कार्य कर सकते हैं।", "134 प्रोटीनों में मरीनर ट्रांसपोसेज डोमेन थे, जिनमें से सी में कोई नहीं है।", "एलिगन्स, एच में मरीनर ट्रांसपोसन के आक्रमण और विस्तार का सुझाव देते हैं।", "बैक्टीरियोफोरा।", "लगभग सभी चयापचय श्रेणियों में जीन और जीनोम ऑर्थोलॉजी के कम क्योटो विश्वकोश का पता 9 अन्य अनुक्रमित सूत्रकृमि जीनोम की तुलना में जीनोम में लगाया गया था, जो इन कार्यों के लिए सहजीवी या कीट मेजबान पर निर्भरता को दर्शाता है।", "एच।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम अनुक्रम नेमाटोड परजीवीवाद और पारस्परिकता के मौलिक ज्ञान को प्राप्त करने के लिए आनुवंशिकी, जीनोमिक्स और विकासवादी अध्ययनों को बहुत सुविधाजनक बनाएगा।", "यह एच की उपयोगिता को भी बढ़ाता है।", "कशेरुकी परजीवी सूत्रकृमि और सी के बीच एक सेतु प्रजाति के रूप में बैक्टीरियोफोरा।", "एलिगन्स मॉडल।", "उद्धरणः बाई एक्स, एडम्स बीजे, सिचे टा, क्लिफ्टन एस, गौगलर आर, किम के-एस, आदि।", "(2013) एक प्रेमी और एक लड़ाकूः एक कीट-रोगजनक नेमाटोड हेटेरोहैब्डाइटिस बैक्टीरियोफोरा का जीनोम अनुक्रम।", "प्लोस वन 8 (7): ई69618.", "org/10.1371 जर्नल।", "pone.0069618", "संपादकः क्लोटिल्डे के।", "एस.", "कार्लो, न्यू इंग्लैंड बायोलैब्स, संयुक्त राज्य अमेरिका", "प्राप्तः 7 अप्रैल, 2013; स्वीकार किया गयाः 12 जून, 2013; प्रकाशितः 18 जुलाई, 2013", "कॉपीराइटः 2013 बाई और अन्य।", "यह एक खुला-पहुँच लेख है जो क्रिएटिव कॉमन्स एट्रिब्यूशन लाइसेंस की शर्तों के तहत वितरित किया गया है, जो किसी भी माध्यम में अप्रतिबंधित उपयोग, वितरण और प्रजनन की अनुमति देता है, बशर्ते कि मूल लेखक और स्रोत को श्रेय दिया जाए।", "वित्त पोषणः इस परियोजना को संयुक्त राज्य अमेरिका के कृषि विभाग (डब्ल्यू. डब्ल्यू. डब्ल्यू.) के अनुदान द्वारा समर्थित किया गया था।", "यू. एस. डी. ए.", "सरकार) और राष्ट्रीय विज्ञान फाउंडेशन (डब्ल्यू. डब्ल्यू.", "एन. एस. एफ.", "सरकार) #2006-35600-16665. p अनुदान के तहत सूक्ष्मजीव जीनोम अनुक्रम कार्यक्रम।", "डब्ल्यू.", "एस.", "हावर्ड हग मेडिकल इंस्टीट्यूट (डब्ल्यू. डब्ल्यू. डब्ल्यू.) के साथ एक जांचकर्ता है।", "हम्मी।", "org) 047-101 के संदर्भ संख्या के साथ। अध्ययन डिजाइन, डेटा संग्रह और विश्लेषण, प्रकाशित करने के निर्णय या पांडुलिपि तैयार करने में वित्तदाताओं की कोई भूमिका नहीं थी।", "प्रतिस्पर्धी हितः लेखकों ने घोषणा की है कि कोई प्रतिस्पर्धी हित मौजूद नहीं हैं।", "सूत्रकृमि ग्रह पर सबसे प्रचुर मात्रा में बहुकोशिकीय जानवर हैं, और सभी जीवन को प्रभावित करने के लिए उल्लेखनीय रूप से विविध जीवन शैली का प्रदर्शन करते हैं।", "जबकि कुछ सूत्रकृमि परजीवी मनुष्यों और कृषि को नुकसान पहुँचाते हैं, कीट-रोगजनक (i.", "ई.", "कीट-परजीवी सूत्रकृमि (ई. पी. एन.) कीट कीटों को नियंत्रित करने में फायदेमंद होते हैं।", "दो ई. पी. एन. परिवारों, हेटेरोरहैबडिटिडे और स्टीनर्नमेटिडिडे ने क्रमशः कीट रोगजनक फोटोरहैबडस और ज़ेनोरहैबडस बैक्टीरिया के साथ स्वतंत्र रूप से आपसी संबंध विकसित किए हैं।", "सूत्रकृमि का एक विशेष चरण, सी के अनुरूप।", "एलिगन्स डॉयर, जिसे संक्रामक किशोर (आई. आई. जी.) कहा जाता है, एक कीट मेजबान की तलाश में अपनी आंत में पारस्परिक बैक्टीरिया को आश्रय देता है।", "एक बार पाए जाने के बाद, सूत्रकृमि कीट के शरीर में प्रवेश करते हैं, हेमोलिम्फ में अज्ञात संकेतों को महसूस करते हैं, और फिर प्रतीकों को पुनर्जीवित करते हैं।", "बैक्टीरिया लघुगणक के रूप में बढ़ते हैं और विषाक्तता कारकों और विषाक्त पदार्थों का उत्पादन करते हैं जो तेजी से कीट मृत्यु दर का कारण बनते हैं।", "बैक्टीरिया कीट ऊतकों को खराब करने के लिए एक्सोएंजाइम का उत्पादन करते हैं और सूत्रकृमि प्रजनन के लिए आवश्यक अज्ञात चयापचय का उत्पादन करते हैं।", "सी के विपरीत।", "एलिगन्स और अन्य बैक्टीरिया-फीडिंग नेमाटोड्स, एच।", "बैक्टीरियोफोरा केवल तभी प्रजनन करता है जब कीटों और पोषक तत्वों से भरपूर मीडिया दोनों में विशिष्ट फोटोर्हाब्डस बैक्टीरिया के साथ जुड़ा होता है।", "इसके अलावा, एच।", "जीवाणुरूपी आंत सी की तुलना में सहजीवी और गैर-सहजीवी एस्चेरिचिया कोलाई ऑप50 आंतों के बैक्टीरिया के लिए अधिक अनुमेय है।", "एलिगन्स।", "बैक्टीरिया शक्तिशाली द्वितीयक चयापचय का उत्पादन करते हैं जो एंटीबायोटिक होते हैं और जो मैला साफ करने वाले आर्थ्रोपोड्स को रोकते हैं, जिससे एक ही संक्रमित कीट से नेमाटोड का प्रसार लगभग 500,000 आई. आई. जी. एस. तक हो जाता है, जो फिर नए कीट मेजबानों की तलाश में फैल जाते हैं।", "हेटेरोहैब्डाइटिस बैक्टीरियोफोरा आरो बेनि म्युचुएलिस्टिक बैक्टीरियम फोटोरहैबडस ल्युमिनेसेंस सिम्बायोसिस आरो परजीवीबादनि मोनसे मडेल सिस्टमखौ रिप्रेजेंट खालामो।", "यद्यपि प्रकृति में पारस्परिक रूप से निर्भर, दोनों जीवों को विकसित किया जा सकता है, हेरफेर किया जा सकता है और संस्कृति में फिर से जोड़ा जा सकता है।", "हेटेरोरहैब्डाइटिस और फोटोरहैबडस में सर्वसमयी विकासवादी वंशावली होती है, जो महत्वपूर्ण सह-विकास का संकेत देती है।", "बैक्टीरिया नेमाटोड कोशिकाओं के अंदर चिपक जाते हैं, बने रहते हैं, आक्रमण करते हैं और बढ़ते हैं, मां के शरीर में विकासशील आई. आई. जी. एस. तक पहुंच प्राप्त करने के लिए आहार पथ का उल्लंघन करते हैं।", "आई. आई. जी. एस. उन बैक्टीरिया का चयन करते हैं जो ग्रसनी-आंतों की वाल्व कोशिकाओं का पालन करते हैं, संभवतः इन कोशिकाओं पर आक्रमण करते हैं और आंतों के लुमेन में बिना जुड़े बढ़ने के लिए बाहर निकलते हैं।", "यह संभावना है कि नेमाटोड रिसेप्टर्स विकासात्मक चरणों में विशिष्ट कोशिकाओं पर उजागर होते हैं जहां बैक्टीरिया चिपक जाते हैं।", "उदाहरण के लिए, बैक्टीरिया का एक चरण संस्करण उप-जनसंख्या मातृ आंत में आसंजन और आई. आई. जी. एस. में संचरण के लिए आवश्यक मातृ आसंजन (पागल) फिम्ब्रिया को व्यक्त करता है।", "इससे भी आश्चर्यजनक रूप से, मातृ सूत्रकृमि एक एम-रूप फेनोटाइपिक संस्करण का चयन करते हैं जो कीट रोगजनक पी रूप की तुलना में रसीला और धीरे-धीरे बढ़ता है।", "अधिकांश क्षणिकों के बीच पश्च आंत में बनी एम-रूप कोशिकाओं की कल्पना ने इस खोज को सक्षम बनाया कि पी रूप एक छोटी कोशिका आकृति विज्ञान (i.", "ई.", "̃ 1/7 वोल्यूम) m रूप का।", "सूत्रकृमियों की प्रकाशिक पारदर्शिता और क्षणिक और स्थायी बैक्टीरिया की विभेदक लेबलिंग ने फेनोटाइपिक संस्करण के पारस्परिक कार्य को आसानी से नजरअंदाज कर दिया।", "इसके अलावा, सहजीवी की आनुवंशिक ट्रैक्टेबिलिटी और स्क्रीनिंग की आसानी से पी और एम फॉर्म स्विचिंग के लिए आवश्यक उत्परिवर्तनीय लोकस और प्रतिलेखन कारकों का पता चला।", "यह अज्ञात है कि सूत्रकृमि एम रूप क्यों प्राप्त करते हैं, जो पूरी तरह से विकसित आई. आई. जी. एस. में आनुवंशिक रूप से पी रूप में वापस बदल जाते हैं और कीट संक्रमण के लिए इन सूत्रकृमि को हाथ में लेते हैं।", "आई. आई. जी. एस. और बैक्टीरिया सहयोगात्मक रूप से सहन करते हैं, अक्सर अपने मेजबान की खोज में कई हफ्तों से महीनों तक बिना खाए रहते हैं।", "सेलुलर अम्लीकरण और दमित गतिशीलता के माध्यम से उनके चयापचय को कम करने से बैक्टीरिया को आई. आई. जी. की आंत में बने रहने में मदद मिल सकती है।", "कीट मेजबानों के बीच बैक्टीरिया को वेक्टर करने के अलावा, आई. आई. जी. एस. कीट मेजबानों के प्रतिरक्षा दमन में योगदान कर सकते हैं।", "इस प्रकार, एच।", "बैक्टीरियोफोरा बैक्टीरियल पारस्परिकता के लिए परिष्कृत अनुकूलन विकसित किया है जो इसे एक कीटाणुजनित के रूप में कार्य करने में सक्षम बनाता है।", "जीनोम अनुक्रमों पर हाल के आंकड़ों की उपलब्धता ने इस मॉडल प्रणाली के विकास के लिए आवश्यक नींव रखी है।", "एच का पूर्ण जीनोम।", "बैक्टीरियोफोरा स्ट्रेन टी. टी.01 सिम्बियंट, फोटोरहैबडस लुमिनेसेंस सबस्प।", "लॉमोंडी टी. टी.01,2003 में रिलीज़ हुई थी।", "एच का प्रतिलेखीय डेटा।", "बैक्टीरियोफोरा टी. टी.01 और जी. पी. एस. 11 हाल ही में उपलब्ध हुए हैं।", "एथिल मीथेन सल्फोनेट (ई. एम. एस.) का उपयोग करके उत्परिवर्तन द्वारा आगे आनुवंशिकी सफल रही, और आर. एन. आई. का उपयोग करके जीन को शांत करके, एच. में रिवर्स आनुवंशिकी का प्रदर्शन किया गया है।", "बैक्टीरियोफोरा।", "इसके अलावा, आनुवंशिक विविधता मूल्यांकन, आनुवंशिक चयन-, संकरण, घटाने वाले प्रवर्धन, प्रतिलेखन प्रोफाइलिंग, प्रोटिओमिक्स और डीएनए परिवर्तन के लिए तकनीकें प्राप्त की गई हैं।", "एच का परिवर्तन।", "सी के साथ बैक्टीरियोफोरा जर्मलाइन।", "एलिगन्स हीट शॉक प्रमोटर को प्रतिलेखन रूप से बीटा-गैलेक्टोसिडेस और एम. ई. सी.-4 (मैकेनोसेंसिटिव) प्रमोटर को प्रतिलेखन रूप से जी. एफ. पी. में संयोजित किया गया है, जो एच. के कार्यात्मक विश्लेषण का सुझाव देता है।", "बैक्टीरियोफोरा जीन संभव है।", "विकासवादी रूप से, हेटेरोरहैब्डाइटिस रबडिटिना के बीच एक संक्रमणकालीन वर्गीकरण है।", "यह अपने सूक्ष्मभक्षी पूर्वजों के साथ साझा किए गए पैतृक लक्षणों को प्रदर्शित करता है जैसे कि सी।", "एलिगन्स, लेकिन परजीवीवाद भी विकसित हुआ है और हुकवर्म और लंगवर्म जैसे अनिवार्य स्तनधारी परजीवियों के साथ सबसे हाल के सामान्य वंश को साझा करता है।", "इस जातिजन्य स्थिति को देखते हुए, हेटेरोरहैब्डाइटिस उन विकासवादी परिवर्तनों की खोज के लिए एक प्रकार के \"ब्रिज\" वर्गीकरण के रूप में काम कर सकता है जो मुक्त-जीवित सूक्ष्मजीव स्तनधारियों के परजीवीवाद को बाध्य करने के रास्ते से गुजरे हैं (चित्र 1ए)।", "हालांकि यह आंकड़ा व्यापक होने का इरादा नहीं है, यह कशेरुकी जीवों के परजीवीवाद को बाध्य करने के लिए अकशेरुकी जीवों के साथ संकाय और बाध्य संघों के माध्यम से मुक्त-जीवित सूक्ष्मजीवों से सामान्य विकासवादी प्रवृत्ति को दर्शाता हैः पैनाग्रेलस मुक्त-जीवित सूक्ष्मजीवियों के एक बड़े समूह का प्रतिनिधित्व करता है, जिसने बाद में विकासवादी वंशावली की एक श्रृंखला को जन्म दिया जो अकशेरुकी जीवों के गैर-परजीवी सहयोगी हैं, इसके बाद हेटेरोहैब्डाइटिस और इसकी बहन टैक्सोन, स्ट्रॉन्गिलोइडिया (नेकेटर, डिक्टिलोकॉलस और ऑस्लेरस द्वारा दर्शाया गया)।", "इस परिदृश्य के अनुसार, विकासवादी इतिहास के एक पारसिमोनियस पुनर्निर्माण में मुक्त-जीवित सूक्ष्मभक्षी जीव होते हैं जो कई सूक्ष्मभक्षी वर्ग को जन्म देते हैं जो अकशेरुकी जीवों के संकलक या अवसरवादी सहयोगी होते हैं।", "हालाँकि, इस तरह की क्षमतापूर्ण और अवसरवादी स्थितियों ने एक वंश को जन्म दिया जो बाध्यकारी परजीवीवाद विकसित हुआ।", "हेटेरोहैब्डाइटिस में सूक्ष्मजीव (चित्र 1बी) और एक अकशेरुकी मेजबान के साथ संबंध बनाए रखा गया था।", "इसके विपरीत, बाध्य परजीवीवाद के विकास के दौरान स्ट्रॉन्गिलोइडिया ने सूक्ष्मजीवों को खो दिया है।", "हालांकि, कीट-रोगजनक सहजीवन को परजीवीवाद में एक नवाचार के रूप में भी देखा जा सकता है जहां एक कीट रोगजनक के साथ सूत्रकृमि का संबंध कीट संक्रमण के विषाक्तता और स्वास्थ्य को बढ़ाता है।", "डिक्ट्योकॉलस और ऑस्लेरस (फेफड़ों के कीड़े; क्रमशः ट्राइकोस्ट्रोंगिलिडे, मेटास्ट्रोंगिलिडे) वाले वंश का प्रत्यक्ष जीवन चक्र होता है, जिसे उनके स्तनधारी मेजबानों द्वारा लार्वा के रूप में ग्रहण किया जाता है।", "नेकेटर (हुकवर्म; एनसिलोस्टोमैटिडे) अपने मेजबान को संक्रमित करने के लिए ऊतक में प्रवेश करता है।", "अधिकांश फेफड़ों के कीड़ों को अकशेरुकी (मोलस्क) मध्यवर्ती मेजबान की आवश्यकता होती है।", "इस आधार पर, इस अध्ययन का उद्देश्य हेटेरोहैब्डाइटिस की पारस्परिक और परजीवी जीवन शैली में आगे की अंतर्दृष्टि की सुविधा के लिए एक उच्च गुणवत्ता वाले जीनोम अनुक्रम को प्राप्त करना था।", "एच का विश्लेषण।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम अनुक्रम अद्वितीय विशेषताओं को प्रकट करता है जो इसके जीव विज्ञान के पारस्परिक (प्रेमी) और परजीवी (लड़ाकू) पहलुओं के विकास के अनुरूप हैं।", "ए.", "पेड़ के तल पर मुक्त-जीवित सूक्ष्मभक्षी पैनाग्रेलस (पैनग्रोलाइमोइडिया) है।", "हरे रंग में वंश सूक्ष्मभक्षी सूत्रकृमि के बड़े, विविध वंशों के अर्ध-सूत्र हैं जिनके सदस्य अपने जीवन चक्र के किसी बिंदु पर अकशेरुकियों के साथ जुड़ते हैं, आमतौर पर फोरेसी और/या नेक्रोमेनी के माध्यम से।", "हेटेरोरहैब्डाइटिस एक संक्रमणकालीन वर्गीकरण है, जो पैतृक सूक्ष्मभक्षी लक्षणों को प्रदर्शित करता है, लेकिन यह बाध्यकारी पैथेनोजेनसिस भी विकसित हुआ है और अनिवार्य स्तनधारी परजीवी (स्ट्रॉन्गिलोइडिया; लाल रंग में वंश) के साथ सबसे हाल के सामान्य वंश को साझा करता है।", "इसके बाद संशोधित किया गया-।", "वर्गीकरण होड्डा, 2011 की श्रेणी परिकल्पना और नामकरण का अनुसरण करता है।", "बी.", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा नेमाटोड कीट रोगजनक पी के साथ एक पारस्परिकता विकसित की है।", "लुमिनेसेंस बैक्टीरिया (हरा) जहाँ प्रत्येक साथी भारी कीटाणुजनन प्राप्त करने के लिए सहयोग करता है।", "ग्रसनी से बाहर एक संक्रामक किशोर पुनर्जनन आंतों के प्रतीक (दाएँ) दिखाए गए हैं।", "सूत्रकृमि के सिर की गति प्रतिदीप्ति और विभेदक हस्तक्षेप माइक्रोग्राफ छवि ओवरले के मामूली गलत संरेखण का कारण बनती है।", "परिणाम और चर्चा", "कुल 6,845,656 अनुक्रमण कुल 2,410,251 पढ़ता है, 025 आधार जोड़े h से प्राप्त किए गए थे।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "गुणवत्ता छंटाई और संयोजन के बाद, कुल 1,263 मचानों से युक्त एक प्रारूप जीनोम प्राप्त किया गया था जिसमें कुल 77,007,652 bp था।", "मचान का आकार 327 से लेकर 2,228,510 bp तक था जिसमें 166 मचान 100 kb से बड़े थे।", "एकत्रित जीनोम का एन50 मान 312,328 बी. पी. है।", "समग्र जी. सी. सामग्री 32.2% है, जो मुक्त-जीवित सूत्रकृमि सी के समान है।", "एलिगन्स, पादप-परजीवी सूत्रकृमि एम।", "हाप्ला, और मानव-परजीवी सूत्रकृमि बी।", "मलायी (तालिका 1)।", "सी के लिए अनुकूलित मापदंडों का उपयोग करके प्रोटीन-कोडिंग जीन की भविष्यवाणी की गई थी।", "एबी इनिशियो जीन भविष्यवाणी कार्यक्रमों में एलिगेंस।", "कुल मिलाकर, 21,250 प्रोटीन-कोडिंग जीन की भविष्यवाणी की गई थी (तालिका एस1)।", "अनुमानित प्रोटीन जीन, 11,207 में से अधिकांश में सी के लिए कोई महत्वपूर्ण समरूपता नहीं थी।", "एलिगन्स (वर्मबेस डब्ल्यूएस220 छोड़ता है), जबकि 10,043 घंटे।", "बैक्टीरियोफोरा प्रोटीनमे 1ई-5 (तालिका एस2) क ई मान कटऑफक सङ्ग समरूपता छल।", "जिन प्रोटीन-कोडिंग जीन में डब्ल्यू. एस. 220 में कोई समरूपता नहीं है, उनमें से 9,893 में जीनबैंक गैर-कम डेटाबेस में ज्ञात प्रोटीन के साथ कोई महत्वपूर्ण अनुक्रम समानता नहीं थी और इसलिए उन्हें नया माना जाता था।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा आरो हुकवर्म बायदि स्ट्रॉन्गिलिड परजीवीफोरा मोनसे जौगाथायारि महरै बन्द आरो गुबुन थामथि लार्वा स्टेजखौ अनुकूलित खालामदोंमोन, जायखौ सीआव डाउर लार्वा महरै मिथिनाय जायो।", "एलिगन्स, संक्रामक चरण के रूप में।", "कीट-रोगजनक आई. आई. जी. एस. आंतों के प्रतीक को आश्रय देते हैं जो उनके कीट परजीवीवाद को लाभान्वित करते हैं।", "सी।", "एलिगन्स डॉयर तनावपूर्ण स्थितियों में विकसित होता है जैसे कि डॉयर और अन्य एस्केरोसाइड फेरोमोन को महसूस करके भीड़भाड़, इंसुलिन और टी. जी. एफ.-बी. ए. मार्गों और डी. ए. एफ.-12 परमाणु हार्मोन रिसेप्टर के माध्यम से संकेत पारगमन।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा मोनसे एसकेरोसाइड इथेनोलामाइन (सी11 ई. ए.) व्युत्पन्ननि दिहुनदिथि जे उच्च आई. आई. जी. घनत्व आरो अतिरिक्त एसकेरोसाइडफोराव आय. जी. अवस्थाखौ दिदोम राखैत।", "हमने पाया कि एच।", "बैक्टीरियोफोरा में अधिकांश (23 में से 19) इंसुलिन/आई. जी. एफ.-1 संकेत मार्ग जीन होते हैं जो डावर के गठन और सी में दीर्घायु, तनाव प्रतिरोध और जन्मजात प्रतिरक्षा के विनियमन के लिए महत्वपूर्ण होते हैं।", "एलिगन्स (चित्र 2)।", "हमने एक डैफ-12 होमोलॉग भी पाया जो एस्केरोसाइड प्रतिलेखन प्रतिक्रिया में कार्य करने की भविष्यवाणी करता है।", "डायापॉज से आई. जी. के गठन और निकास का अध्ययन, जो ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर जैसे कीटों में आसानी से परीक्षण किया जाता है और आंतों के प्रतीकों के रिलीज द्वारा मूल्यांकन किया जाता है, नई परजीवीरोधी रणनीतियों का कारण बन सकता है।", "बढ़ती आई. आई. जी. दीर्घायु और तनाव प्रतिरोध से कीट नियंत्रण के लिए ई. पी. एन. में सुधार हो सकता है।", "लाल और नीले रंग के फ़ॉन्ट में जीन क्रमशः नकारात्मक नियामक और सकारात्मक नियामक हैं, जो सी में तनाव प्रतिरोध, जीवनकाल और प्रतिरक्षा के हैं।", "एलेगन।", "आर. एन. ए. हस्तक्षेप (आर. एन. ए.) जीन विनियमन के लिए एक मार्ग है और कार्यात्मक जीनोमिक्स में जीन अभिव्यक्ति में हेरफेर करने के लिए शक्तिशाली उपकरण है।", "भिगो कर आर. एन. आई. एच. में प्राप्त किया गया है।", "बैक्टीरियोफोरा।", "हमने सी में प्रणालीगत आर. एन. आई. के लिए आवश्यक साइड-1 और साइड-3 समरूपता का पता लगाया।", "एलिगन्स, लेकिन सी में आवश्यक साइड-2 होमोलॉग नहीं।", "आंत में डी. एस. आर. एन. ए. के ग्रहण के लिए एलिगन्स।", "या तो एक एच. बी. ए.-साइड-2 होमोलॉग को वर्तमान एच. से बाहर छोड़ दिया गया था।", "बैक्टीरियोफोरा असेम्बली या अन्य परिवहन तंत्र का उपयोग किया जाता है।", "हालांकि सी।", "एलिगन्स कुशलता से पर्यावरणीय डीएनए का परिवहन करते हैं, अधिकांश अन्य संबंधित सीनोर्हैब्डाइटिस प्रजातियाँ नहीं करती हैं।", "एच में आर. एन. ए. हस्तक्षेप में शामिल जीन।", "बैक्टीरियोफोरा, बी।", "मलायी, और एम।", "हाप्ला की पहचान सी के साथ अनुक्रम समानता के आधार पर की गई थी।", "एलिगन्स जीन उत्पाद (चित्र 3)।", "चारों सूत्रकृमि प्रजातियों में चार जीन, डी. आर. एस. एच.-1, इगो-1, आर. एस. एस. डी.-3 और एस. एम. एम. जी.-2 की तुलना की गई है।", "सी में।", "एलिगेंस, डी. आर. एस. एच.-1 जीन एक अनुमानित आर. एन. ए. एस. III-प्रकार के रिबोन्यूक्लीज़ को कूटबद्ध करता है जो ड्रोसोफिला में ड्रोशा प्रोटीन के लिए ऑर्थोलॉगस है और मानव जो नाभिक में प्राथमिक मिर्ना प्रतिलेखों (प्रि-मिर्ना) को संसाधित करने में शामिल है।", "इगो-1 जीन अनुमानित आर. एन. ए.-निर्देशित आर. एन. ए. पोलीमरेज़ को कूटबद्ध करता है जो जर्मलाइन आर. एन. आई. के लिए आवश्यक है।", "एस. एम. जी.-2 गैर-इन्द्रिय-मध्यस्थ मृणा क्षय में शामिल है जो समय से पहले रुकने वाले कोडन के साथ यूकेरियोटिक मृना को चुनिंदा और तेजी से कम करता है।", "आर. एस. डी.-3 दोषपूर्ण जीन (वर्मबेस) फैलाने वाले चार आर. एन. ए. में से एक है।", "डी. सी. आर.-1 डाइसर से संबंधित एंडोन्यूक्लीज़ का एक समरूपता एच में पाया गया था।", "जीवाणुरूपी लेकिन डी. सी. आर.-1 से संबंधित प्रोटीन आर. डी. ई.-4 नहीं, जो सी. में आर. एन. आई. के लिए आवश्यक है।", "एलिगन्स।", "चूंकि आर. एन. आई. एच. के लिए सूचित किया गया है।", "बैक्टीरियोफोरा, बी।", "मलायी, और एम।", "अन्यथा, विभिन्न तंत्र संभवतः नियोजित हैं।", "यह जानने के लिए कि 10,000 से अधिक अज्ञात प्रोटीन कैसे काम करते हैं, हमने संरक्षित क्षेत्रों के लिए प्रोटीन का विश्लेषण किया।", "4, 144 अलग-अलग पी. एफ. ए. एम. अभिगमों के साथ कुल 7,957 पी. एफ. ए. एम. डोमेन का अनुमान 1ई-4 के ई-मूल्य कटौती के साथ प्रोग्राम हमर का उपयोग करके लगाया गया था। हमने एच में पी. एफ. ए. एम. डोमेन की तुलना की।", "अन्य सूत्रकृमि के साथ बैक्टीरियोफोरा (चित्र 4; तालिका एस 3)।", "प्रोटीन क्षेत्र की जानकारी के आधार पर, हमने जी. पी. सी. आर. (जी. प्रोटीन युग्मित रिसेप्टर) जीन परिवार के 82 सदस्यों और एन. एच. आर. (न्यूक्लियर हार्मोन रिसेप्टर) जीन परिवार के 24 सदस्यों की पहचान की।", "डोमेन समृद्धि सूचकांक विश्लेषण (विधियाँ देखें) ने एच में 56 डोमेन का खुलासा किया।", "बैक्टीरियोफोरा जाय गुबुन नेमाटोडनिफ्राय गोबां गुबुन जायो।", "एक महत्वपूर्ण रूप से अलग समृद्धि क्षेत्र सूचकांक मरीनर ट्रांसपोसेज (pf01359.11) है, जिसमें 138 की पहचान एच में की गई है।", "सी में 65 की तुलना में बैक्टीरियोफोरा प्रोटीन।", "जपोनिका, एम में एक-एक।", "इनकॉग्निटा और एम।", "हाप्ला, लेकिन सी में कोई नहीं।", "एलिगन्स और ब्रुगिया मलायी।", "समुद्री परिवहन को एक शुद्ध रूप में विट्रो में स्थानांतरण में मध्यस्थता करने के लिए पर्याप्त दिखाया गया है।", "मरीनर ट्रांसपोसेज डोमेन का संवर्धन 1,314 अनुमानित मरीनर डीएनए रूपांकनों के साथ सहमत है जो 23 प्रकारों से संबंधित हैं (तालिका 2; तालिका एस 4)।", "इसके विपरीत, समान मापदंडों के साथ एक खोज ने 844 नौसैनिक डी. एन. ए. रूपांकनों को वापस किया जो सी में 43 प्रकारों से संबंधित हैं।", "एलिगन्स जीनोम (तालिका 2; तालिका एस 5)।", "अधिक आश्चर्यजनक रूप से, सी में विशेष रूप से 28 प्रकार के मरीनर डी. एन. ए. रूपांकनों मौजूद हैं।", "एलिगन्स जीनोम और 8 प्रकार विशेष रूप से एच में मौजूद हैं।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "एच के बीच नाविक डीएनए रूपांकनों की संख्या और प्रकार में अंतर।", "बैक्टीरियोफोरा और सी।", "मरीनर ट्रांसपोसेज डोमेन के संवर्धन के साथ एलिगन्स और एच में अनुमानित स्थानांतरण गतिविधि।", "बैक्टीरियोफोरा संभवतः एक अतीत या वर्तमान में गतिशील जीनोम का प्रमाण है।", "शीर्ष 20 पी. एफ. ए. एम. डोमेन की पहचान एच. में 20 सबसे बड़ी संख्या वाले डोमेन के रूप में की गई थी।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "हमने बहुत कम पाया (9 बनाम।", "133) सी-प्रकार के लेक्टिन डोमेन वाले प्रोटीन सी में मौजूद होते हैं।", "एलिगन्स।", "सी में जन्मजात प्रतिरक्षा में कार्य करने वाले एल. ई. सी.-1, एल. ई. सी.-2, एल. ई. सी.-3, एल. ई. सी.-5, एल. ई. सी.-6 और एल. ई. सी.-12 के समरूपता का पता चला।", "एलिगन्स।", "एच में सी-एलेक्टिन डोमेन प्रोटीन में कमी।", "बैक्टीरियोफोरा पी के साथ पारस्परिक संबंध से संबंधित हो सकता है।", "लुमिनेसेंस बैक्टीरिया।", "मातृ संचरण के लिए आंत में और कीट संक्रमण के लिए आई. आई. जी. एस. में व्यवहार्य सहजीवी बैक्टीरिया की आवश्यकता होती है।", "एच।", "बैक्टीरियोफोरा आंत सहजीवी बैक्टीरिया और गैर-सहजीवी ई के लिए अधिक अनुमेय है।", "सी की तुलना में कोली ऑप 50।", "एलिगन्स।", "सहजीवी द्वारा उत्पादित व्यापक-स्पेक्ट्रम एंटीबायोटिक दवाओं से रोगजनक और सैप्रोफाइटिक सूक्ष्मजीवों के खिलाफ रक्षा में योगदान करने की संभावना है।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा में जन्मजात प्रतिरक्षा प्रभावकों का एक विविध और नया समूह भी हो सकता है जिनका पता समरूपता द्वारा सी तक नहीं लगाया गया था।", "एलिगन्स।", "गैर-कोडिंग आर. एन. ए. (एन. सी. आर. एन. ए.) और नियामक तत्व", "एच में कुल 134 संभावित माइक्रोर्ना (मिर्ना) जीन की पहचान की गई थी।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम 26 अलग-अलग पशु माइक्रोर्ना प्रजातियों का प्रतिनिधित्व करता है (तालिका एस6)।", "अन्य एन. सी. आर. एन. ए. में स्प्लिसियोसोम के यू1, यू2, यू3, यू4, यू5 और यू6 छोटे परमाणु आर. एन. ए. (एस. एन. आर. एन. ए.) घटक शामिल हैं, एस. एल. 1. ट्रांस-स्प्लिसिंग में शामिल है (कोई नहीं अगर 1ई-10 कटऑफ का उपयोग किया जाता है), रिबोन्यूक्लियाज़ पी (आर. एन. एस. ए. ए. ई. पी.), और यूकेरियोटिक-प्रकार के संकेत पहचान कण आर.", "एच में पाए गए गैर-कोडिंग आरएनए की संख्या।", "सी में मौजूद होने के लिए ज्ञात बैक्टीरियोफोरा की तुलना में काफी कम है।", "एलिगन्स (तालिका एस6)।", "उदाहरण के लिए, वर्तमान असेंबली में लेट-7 अनुपस्थित है, हालांकि इसकी उपस्थिति और लौकिक अभिव्यक्ति को संभवतः एक अपूर्ण जीनोम असेंबली के कारण, द्वैपाक्षिक समरूपता वाले जानवरों के बीच संरक्षित माना जाता था।", "एन. सी. आर. एन. ए. की प्रतिलेखन, अनुवाद और अन्य जैविक प्रक्रियाओं को विनियमित करने में महत्वपूर्ण भूमिका है।", "एच में कुल 254 स्थानांतरण आरएनए (टीआरए) जीन और 1 टीआरएएनए स्यूडोजीन की भविष्यवाणी की गई थी।", "सभी 20 मानक अमीनो एसिड के लिए ट्रैनस्कैन-से द्वारा बैक्टीरियोफोरा जीनोम (तालिका एस7 देखें), लेकिन ट्रैन-सेलिनोसिस्टीन जीन के लिए नहीं।", "एच में पाए गए टी. आर. एन. ए. जीन की संख्या।", "बैक्टीरियोफोरा 659 टी. आर. एन. ए. जीन और सी. में कम से कम 29 टी. आर. एन. ए. स्यूडोजीन की तुलना में नाटकीय रूप से कम है।", "एलिगन्स।", "हालाँकि, त्रना की संख्या मानव और पादप परजीवी सूत्रकृमि में पहचाने जाने वाले के करीब है।", "मानव परजीवी बी में 233 टी. आर. एन. ए. जीन और 26 टी. आर. एन. ए. पेसुडोजीन पाए जाते हैं।", "मलायी और 467 ट्रैन जीन, 120 ट्रैन सूडोजेन और 28 अन्य ट्रैन जीन पादप परजीवी एम में।", "अज्ञात।", "सूक्ष्म उपग्रह, जिन्हें सरल अनुक्रम पुनरावृत्ति (एस. एस. आर. एस.) के रूप में भी जाना जाता है, 2-6 बी. पी. के एक साथ दोहराने वाले अनुक्रम हैं जो अपनी उच्च उत्परिवर्तन दर के कारण निकटता से संबंधित प्रजातियों के बीच संबंधों को हल करने के लिए सूचनात्मक आनुवंशिक मार्कर के रूप में काम करते हैं।", "वर्तमान प्रारूप एच के 506 सन्निहित क्षेत्रों में कुल 3,794 सूक्ष्म उपग्रह स्थान की भविष्यवाणी की गई थी।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम (तालिका एस8)।", "इनमें से 849 कोडिंग क्षेत्रों में स्थित थे।", "इससे पहले, हमने एच के लिए 8 बहुरूपी सूक्ष्म उपग्रह मार्कर विकसित किए थे।", "बैक्टीरियोफोरा जाय मोनसे पूर्वोत्तर ओहियोनि सुबुंथिखौ गुबुन सुबुंनिफ्राय आलादा खालामो।", "ये सूक्ष्म उपग्रह मार्कर एच की जाति-भौगोलिक, जनसांख्यिकीय और आनुवंशिक संरचना को निर्धारित करने के लिए उपयोगी उपकरणों के रूप में काम कर सकते हैं।", "बैक्टीरियोफोरा आबादी।", "एच के बीच विचलन समय का अनुमान।", "बैक्टीरियोफोरा और सी।", "एलिगन्स", "एच के बीच विचलन समय।", "बैक्टीरियोफोरा और सी।", "एलिगन्स का अनुमान एच के बीच 350 ऑर्थोलॉग के एक समूह के आधार पर लगाया गया था।", "बैक्टीरियोफोरा, सी।", "एलिगन्स, एनोफेलिस गैम्बिया और होमो सेपियन्स।", "सूत्रकृमि और कीटों के बीच 800-1000 मिया के विचलन समय के आधार पर, h के बीच अनुमानित विचलन समय।", "बैक्टीरियोफोरा और सी।", "एलिगन्स लगभग 86-331 मिया है।", "इसके विपरीत, सी।", "एलिगन्स और सी।", "ब्रिग्से विखंडन तिथि का अनुमान 78-113 मिया के रूप में लगाया गया था।", "ऊपरी और निचली सीमाओं के बीच बड़ी (रूढ़िवादी) विसंगति शायद विरल वर्गीकरणात्मक नमूने (एन = 4) के साथ-साथ अन्य विश्लेषणात्मक पूर्वाग्रहों से सबसे अधिक प्रभावित होती है।", "स्राव का लक्षण वर्णन", "एच.", "जीवाणुओं से स्रावित प्रोटीन कीटों के साथ परजीवी अंतःक्रिया, सहजीवी बैक्टीरिया के साथ पारस्परिक अंतःक्रिया, रोगजनकों के प्रति प्रतिरक्षा और विकास और प्रजनन में संभावित रूप से महत्वपूर्ण हैं।", "हमने अनुमानित संकेत पेप्टाइड्स के साथ 753 प्रोटीन का पता लगाया, जिनमें से 150 के झिल्ली स्थानीय होने की भी भविष्यवाणी की गई थी।", "603 संभावित स्रावित प्रोटीन (कुल अनुमानित प्रोटीन का 2.8%) बी के अंश के समान हैं।", "मलायी स्राव प्रोटीन (2.3%), लेकिन मुक्त-जीवित सूत्रकृमि से कम होते हैं।", "एलिगन्स (10.1%), c.", "ब्रिग्से (9.4%), सी।", "ब्रेनेरी (8.9%), सी।", "जापोनिका (6.2%), और सी।", "रेमानेई (8.8%), और कीट-संबंधित पी।", "पैसिफिकस (7.4%) जब एक ही विधि और मानदंड के साथ भविष्यवाणी की जाती है।", "यह पादप-परजीवी सूत्रकृमि एम का लगभग आधा भी है।", "हाप्ला (5.2%) और मी।", "अज्ञात (5.2%)।", "परजीवी एच में अनुमानित स्रावित प्रोटीन की कम संख्या।", "बैक्टीरियोफोरा और बी।", "मलायी इन प्रोटीनों के लिए पारस्परिक बैक्टीरिया पर उनकी निर्भरता के कारण हो सकता है।", "603 घंटे के बीच।", "बैक्टीरियोफोरा स्रावित प्रोटीन, 164 में स्विसप्रोट डेटाबेस (तालिका एस9) में प्रोटीन के साथ महत्वपूर्ण समानता (1ई-5 का ई मूल्य कटऑफ) थी।", "शेष 439 स्रावित प्रोटीनों में से 122 की जीनबैंक गैर-कम होने वाले डेटाबेस में प्रोटीनों के साथ महत्वपूर्ण समानता थी।", "शेष 317 स्रावित प्रोटीन अज्ञात कार्य के नए प्रोटीन थे।", "पेप्टिडेस और पेप्टिडेस अवरोधकों वाले मेरोप्स डेटाबेस की खोज से एच में 1 सिस्टीन, 9 सेरीन और 9 मेटालो-पेप्टिडेस और 9 पेप्टिडेस अवरोधकों की उपस्थिति का पता चला।", "बैक्टीरियोफोरा स्रावित प्रोटीन (तालिका 3)।", "स्रावित पेप्टिडेस परजीवियों के लाभ के लिए मेजबान ऊतकों को खराब करने में ज्ञात भूमिका निभाते हैं।", "ई. पी. एन. के बारे में बताया गया है कि वे कीट की आंत में प्रवेश करने में सहायता के लिए प्रोटिओलिटिक एंजाइम छोड़ते हैं ताकि वे हीमोकोल तक पहुँच सकें।", "हीमोकोएल में सूत्रकृमि के प्रवेश के बाद, आई. आई. जी. स्रावित पेप्टाइड्स और पेप्टाइड अवरोधक कीट सेरीन प्रोटीनेज कैस्केड को निरस्त्र करने के लिए कार्य कर सकते हैं जिसके परिणामस्वरूप प्रो-फेनोलॉक्सिडेस सक्रियण और मेलेनीकरण, प्राथमिक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया होती है।", "हालाँकि, मेजबान हीमोकोल में सूत्रकृमि के बाद के विकास के दौरान, सहजीवी पेप्टिडेस/प्रोटीज का स्राव करता है, जो इस तरह के कार्यों में योगदान कर सकता है।", "वास्तव में, ई. पी. एन. के पारस्परिक बैक्टीरिया भी कीट प्रतिरक्षा प्रणाली को दबाने के लिए स्वतंत्र रूप से कार्य करते हैं।", "इसलिए, दोनों भागीदार कीट प्रतिरक्षा प्रणाली का मुकाबला करने में सहक्रियात्मक रूप से कार्य करते हैं।", "एक पेप्टिडेस (ओं) सहजीवी-उत्पादित क्रिस्टलीय समावेश प्रोटीन (सिपा और सि. आइ. पि. बी.) का उपयोग करने में भी कार्य कर सकता है जो आवश्यक एमिनो एसिड सामग्री में उच्च होते हैं और सूत्रकृमि प्रजनन के लिए आवश्यक होते हैं।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा में सी के लिए समरूपता भी होती है।", "एलिगेंस लाइसोजाइम जीन लाइस-1, लाइस-3-8 और लाइस-10 जो जीवाणु कोशिका लाइसिस और जन्मजात प्रतिरक्षा में कार्य करते हैं।", "इस प्रकार, हालांकि समानता सामान्य कार्य का सुझाव देती है, यह निर्धारित किया जाना बाकी है कि अंतर-प्रजातियों की बातचीत में सबसे स्रावित प्रोटीन की क्या भूमिका है।", "जीन ऑन्टोलॉजी संवर्धन", "एच की अनुमानित जीन ऑन्टोलॉजी।", "बैक्टीरियोफोरा प्रोटीन की तुलना अन्य नौ अनुक्रमित नेमाटोड जीनोम (तालिका एस10) के प्रोटीन से की गई थी।", "एक उल्लेखनीय अंतर डी. एन. ए. चयापचय प्रक्रिया (जाओः 0006259), डी. एन. ए. पुनर्संयोजन (जाओः 0006310), डी. एन. ए.-मध्यस्थ स्थानान्तरण (जाओः 0006313), डी. एन. ए. एकीकरण (जाओः 0015074), स्थानांतरण (जाओः 0032196) और एच. में स्थानान्तरण गतिविधि (जाओः 0004803) का महत्वपूर्ण संवर्धन है।", "सी के अपवाद के साथ, अन्य सूत्रकृमि की तुलना में बैक्टीरियोफोरा।", "जापानिया।", "ये अवलोकन एच में मरीनर ट्रांसपोसेज डोमेन के संवर्धन के साथ सहमत हैं।", "ऊपर चर्चा की गई बैक्टीरियोफोरा।", "चयापचय मार्ग की तुलना", "केग (जीन और जीनोम का क्योटो विश्वकोश) मार्गों की भविष्यवाणी एच के लिए की गई थी।", "बैक्टीरियोफोरा आरो गुबुन 9 नेमाटोड प्रजातिफोर जायनि थाखाय जीनोम अनुक्रमक आबुं जानकारी उपलब्ध छैक आरो मोनफ्रोम पाथवेआव जीनफोरनि अनजिमा सार सारि सारि सारि एस11आव होनाय जादों. मेटाबॉलिक पाथवेआव जीन आरो केग ऑर्थोलॉजी (के. ओ.) नि तुलना बेथाबोला जादों दि एच. आव संवर्धन एबा कमी।", "अन्य चुनिंदा सूत्रकृमि जीनोम की तुलना में बैक्टीरियोफोरा जीनोम (तालिका 4)।", "एच.", "मुक्त-जीवित सूत्रकृमि सी की तुलना में बैक्टीरियोफोरा में कम कोस होता है।", "लगभग सभी चयापचय श्रेणियों में एलिगेंस, जो पिछले अवलोकनों के साथ संगत है कि परजीवी सूत्रकृमि ह्रासकारी जीनोम विकास से गुजरते प्रतीत होते हैं।", "हालांकि, एच।", "ग्लाइकेन जैव संश्लेषण और चयापचय (तालिका एस12) के को समूहों में बैक्टीरियोफोरा में काफी अधिक प्रोटीन (कुल 48) होते हैं।", "ग्लाइकोन आम तौर पर प्रोटीन से जुड़े पाए जाते हैं जैसे कि कोशिकाओं की बाहरी सतह पर ग्लाइकोप्रोटीन और प्रोटीओग्लाइकन में पाए जाते हैं और उचित प्रोटीन तह और कोशिका-कोशिका अंतःक्रिया में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।", "एंजाइम स्तर पर, एच।", "बैक्टीरियोफोरा में सी के साथ 17 (23 में से) एंजाइम समान होते हैं।", "एलिगन्स (कुल 19 एंजाइम)।", "दिलचस्प बात यह है कि सी।", "एलिगन्स, बी।", "मलायी और एम।", "हैपला में [हेपरन सल्फेट] का केवल एक आइसोफॉर्म (आइसोफॉर्म 1) होता है-ग्लुकोसामाइन 3-सल्फोट्रांसफेरेज (3-ओस्ट), जबकि एच।", "बैक्टीरियोफोरा तीन आइसोफॉर्म हैं, आइसोफॉर्म 1,2 और 3. एंजाइम 3-ओस्ट ग्लाइकेन संरचना के जैव संश्लेषण में शामिल है और विभिन्न आइसोफॉर्मों में संशोधित ग्लूकोसामाइन अवशेष के आसपास सैकराइड संरचनाओं के आधार पर अलग-अलग सब्सट्रेट विशिष्टताएँ प्रदर्शित की गई हैं।", "अन्य एच के साथ 3-ओस्ट एंजाइम के दो अतिरिक्त आइसोफॉर्म की उपस्थिति।", "ग्लाइकेन जैव संश्लेषण और चयापचय में शामिल बैक्टीरियोफोरा-विशिष्ट एंजाइमों से पता चलता है कि एच।", "बैक्टीरियोफोरा विभिन्न वातावरणों में पनपने के लिए अच्छी तरह से विकसित है जहाँ इसके जीवन चक्र के दौरान विभिन्न चयापचय सब्सट्रेट उपलब्ध हैं।", "एच के बीच ऑर्थोलॉगस अनुक्रम।", "बैक्टीरियोफोरा, सी।", "एलिगन्स, सी।", "ब्रिग्से, सी।", "जापोनिका, सी।", "रेमानेई, सी।", "ब्रेनेरी, ब्रुगिया मलायी, मेलोइडोगाइन हाप्ला, एम।", "जीनोम से अनुमानित प्रोटीन अनुक्रमों पर ऑर्थोमल कार्यक्रम का उपयोग करके इनकॉग्निटा और प्रिस्टियोंकस पैसिफिकस की पहचान की गई थी।", "कुल मिलाकर, हमने इन प्रजातियों में से 183 ऑर्थोलॉग की पहचान की (तालिका एस 13)।", "सी की जीन ऑन्टोलॉजी जानकारी के आधार पर।", "ऑर्थोलॉग सेट में एलिगेंस जीन, इनमें से अधिकांश ऑर्थोलॉग सी में आवश्यक हैं।", "प्रजनन (ऑर्थोलॉग की संख्याः 50), वृद्धि (36), वृद्धि का विनियमन (47), जैविक प्रक्रिया का विनियमन (61), और लार्वा विकास (45) जैसी जैविक प्रक्रियाओं के लिए एलिगन्स और एनोटेटेड।", "बुर्सफेलेंकस जाइलोफिलस, ट्राइकिनेला स्पाइरलिस और एस्केरिस सुम सहित अन्य सूत्रकृमि के जीनोम अनुक्रम विश्लेषण में शामिल नहीं हैं क्योंकि इन सूत्रकृमि द्वारा दर्शाए गए पोषण संबंधी श्रेणियों को पहले से ही वर्तमान अध्ययन में शामिल किया गया है।", "एच.", "तेजी से विकसित हो रहे प्रोटीन क्षेत्रों की तुलना के लिए बैक्टीरियोफोरा उपयोगी है।", "कुछ प्रोटीन जो मानव से सी तक संरक्षित होते हैं।", "एलिगन्स के पास ऐसे क्षेत्र हैं जो बड़ी विकासवादी दूरी की तुलना से विश्लेषण करने के लिए बहुत तेजी से विकसित हो रहे हैं।", "एक उदाहरण ई. जी. एफ.-रिसेप्टर की कार्बोक्सिल टर्मिनल टेल है, जिसे सूत्रकृमि में लेट-23 कहा जाता है।", "एलिगन्स-ब्रिग्से-जापोनिका की तीन प्रजातियों की तुलना में एक सी-टर्मिनस होता है जो जानकारीपूर्ण होने के लिए बहुत संरक्षित है (65 प्रतिशत समान होने के कारण), लेकिन एच का जोड़।", "4-तरफा तुलना में बैक्टीरियोफोरा टायरोसिन और पी. डी. जे.-बाइंडिंग डोमेन पर प्रकाश डालता है जो लेट-23 में कार्यात्मक दिखाया गया है, जिसमें चार प्रजातियों में केवल 26 प्रतिशत की पहचान की गई है (चित्र 5)।", "सीनोर्हैबडाइटिस एलिगन्स, ब्रिग्से और जपोनिका की ईजीएफ-रिसेप्टर (लेट-23) कार्बोक्सिल पूंछ का एच के साथ कई संरेखण।", "बैक्टीरियोफोरा।", "तीन-तरफा, तीन सीनोर्हैब्डाइटिस प्रोटीन का संरेखण; एच. बी. ए.-लेट-23 के साथ तीन सीनोर्हैब्डाइटिस प्रोटीन का संरेखण।", ", कमजोर समानता।", "लाल और हरा रंग प्रोटीन के उन हिस्सों को उजागर करते हैं जो क्रमशः संकेत और स्थानीयकरण में महत्वपूर्ण साबित हुए हैं।", "संख्याएँ अनुमानित प्रोटीन की लंबाई का प्रतिनिधित्व करती हैं।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा मोनसे एन्टोमपैथोजेनिक नेमाटोड, जाय मोनसे कीट परजीवीनि महरै खामानि मावनायनि थाखाय सहजीवी बैक्टीरियाजों गावजों-आपस सोमोन्दो गोनां।", "उच्च गुणवत्ता वाला जीनोम अनुक्रम का मसौदा आंतों के पारस्परिकता और कीट परजीवीवाद की सूत्रकृमि मौलिक प्रक्रियाओं को समझने के लिए हमारे ज्ञान और आनुवंशिक संचरण क्षमता में क्रांति लाता है।", "एच.", "सी की तुलना में बैक्टीरियोफोरा सहजीवन के लिए प्रसिद्ध है।", "एलिगन्स और इस प्रकार पशु-बैक्टीरिया आंत सहजीवन के एक सरल और सुलभ मॉडल का प्रतिनिधित्व करते हैं।", "आर. एन. आई. जीन साइलेंसिंग पद्धति के साथ जीनोम अनुक्रम सहजीवन के साथ-साथ कीट परजीवीवाद में संकेत मार्गों और प्रतिलेखन कारकों के कार्यों की जांच करने के लिए एक शक्तिशाली विपरीत आनुवंशिक दृष्टिकोण प्रदान करता है।", "एच।", "अन्य एच से कुछ अनुक्रमों के साथ बैक्टीरियोफोरा जीनोम अनुक्रम।", "बैक्टीरियोफोरा उपभेद (उदा.", "जी.", "जी. पी. एस. 11) एकल न्यूक्लियोटाइड बहुरूपता (एस. एन. पी. एस.) की पहचान करने की अनुमति देता है जिसका उपयोग मानचित्रण में किया जा सकता है।", "उदाहरण के लिए, सूत्रकृमि उत्परिवर्तन को स्नैप्स के लिए मैप किया जा सकता है और जीनोम अनुक्रमण और उनके कार्य को आर. एन. आई. द्वारा मान्य करके पहचाना जा सकता है।", "इसके अलावा, एच।", "बैक्टीरियोफोरा सिस-और अनुवादित नियामक तत्वों की पहचान की जा सकती है और ट्रांसजीन की अभिव्यक्ति को सुविधाजनक बनाने के लिए उनका उपयोग किया जा सकता है।", "इन दृष्टिकोणों का उपयोग यह जानने के लिए किया जा सकता है कि सूत्रकृमि सहजीवी बैक्टीरिया के साथ कैसे जुड़ता है, प्रजनन के लिए सहजीवी बैक्टीरिया पर इन सूत्रकृमि की निर्भरता का आधार क्या है और सूत्रकृमि परजीवी के रूप में कैसे कार्य करते हैं?", "इसलिए, एच।", "बैक्टीरियोफोरा टी. टी.01 जीनोम कीट-रोगजनक सूत्रकृमि पर बुनियादी और अनुप्रयुक्त अनुसंधान दोनों की सुविधा प्रदान करता है।", "सामग्री और विधियाँ", "एक इनब्रेड लाइन, m31e, 13 बार स्व-निषेचित, h की।", "बैक्टीरियोफोरा टी. टी.01 नस्ल मूल रूप से त्रिनिदाद और टोबैगो से अलग किया गया था और कृपया डॉ.", "एन बर्नेल (नुई-मैनूथ, आयरलैंड) को क्रायोप्रेज़र्व्ड स्टॉक से पिघलाया गया था।", "अक्षीय आई. आई. जी. एस. को सूत्रकृमि को तनाव पी पर संवर्धित करके प्राप्त किया गया था।", "टेम्परेटा टीआरएन16 जो आईआईजीएस का उपनिवेश नहीं करते हैं।", "उच्च आणविक भार वाले डी. एन. ए. को पहले और दूसरे लार्वा चरणों से शुद्ध किया गया था, जो पहले 18 घंटे के लिए 28 डिग्री सेल्सियस पर ना + कोल (4 ग्राम पोषक तत्व अगर, 1 ग्राम सोडियम पायरुवेट, 10 ग्राम अगरोज प्रति लीटर के साथ 2 मिली 5 मिलीग्राम/मिली कोलेस्ट्रॉल ऑटोक्लेविंग के बाद जोड़ा गया) पर उगाए गए टी. आर. एन. 16 के लॉन से काटा गया था।", "कुशल अंडे देने के लिए औसतन 100 मिमी के लॉन में 275 आई. आई. जी. एस. जोड़े गए।", "सूत्रकृमि को 10 मिली रिंगर के साथ 82-86 एच के बाद लॉन से धोया गया था जिसमें 0.00% ट्राइटन x100 था. बैक्टीरिया को 10 माइक्रोन छिद्र नायलॉन फिल्टर पर धो कर हटा दिया गया था और 30 माइक्रोन फिल्टर पर प्रतिधारण द्वारा हर्माफ्रोडाइट को हटा दिया गया था।", "अंडों को 1 प्रतिशत वाणिज्यिक ब्लीच (क्लोरॉक्स®) के साथ सतह पर निर्जंतुक किया गया था, रिंगर के घोल में 3 गुना धोया गया था और 100 माइक्रोग्राम/मिली कार्बेनिसिलिन, 50 माइक्रोग्राम/मिली स्ट्रेप्टोमाइसिन, 30 माइक्रोग्राम/मिली कैनामाइसिन और रात भर 10 माइक्रोग्राम/मिली जेंटामाइसिन वाले रिंगर के घोल में अंडे को निकलने दिया गया था।", "स्टेनोट्रोफोमोनास माल्टोफिलिया का एक संदूषक, जो संभवतः एक दूषित रिंगर के घोल से उत्पन्न होता है, अनजाने में सूत्रकृमि के साथ अनुक्रमित किया गया था।", "लगभग 3 × 106 एल1 सूत्रकृमि को 1,000 संस्कृतियों से काटा गया था।", "आर. एन. ए. का अलगाव", "सूत्रकृमि मृणा को मिश्रित (एल1-एल4), वयस्क और आई. आई. जी. चरणों से अलग किया गया था, जो टी. आर. एन. 16 पर उगाए गए थे. सूत्रकृमि को रिंगर के घोल के साथ कल्चर से प्राप्त किया गया था और बैक्टीरिया को 15 मिली. शंक्वाकार ट्यूब में 15 × रिंगर के घोल के साथ 3 धोने और 2,000 आर. पी. एम. पर 5 मिनट के लिए अपकेंद्रण द्वारा हटा दिया गया था।", "सूत्रकृमियों को तरल नाइट्रोजन में जमाया गया था, फिर ट्राइज़ोल अभिकर्मक (जीवन प्रौद्योगिकियां) को 65 डिग्री सेल्सियस पर जोड़ा गया और ऊष्मायन किया गया।", "प्रति निर्माता के निर्देशों के अनुसार आर. एन. ए. को शुद्ध करने से पहले, आई. आई. जी. एस. को तरल नाइट्रोजन में 3 × और 65 डिग्री सेल्सियस पर फ्रीज-पिघलाया जाता था।", "पॉलीएडेनाइलित आर. एन. ए. को ओलिगो (डी. टी.) सेलूलोज कॉलम, माइक्रोपोल (ए) प्यूरिस्ट किट (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके शुद्ध किया गया था।", "सी. डी. एन. ए. पुस्तकालय निर्माण और अनुक्रमण", "एम. आर. एन. ए. की अखंडता को जैव विश्लेषक 2100 (फुर्तीली प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके और नैनोड्रॉप (थर्मो साइंटिफिक) के माध्यम से निर्धारित उपज का उपयोग करके मान्य किया गया था।", "पुस्तकालय निर्माण के लिए दो अलग-अलग तरीकों का उपयोग किया गया थाः", "क्लोनमाइनर सी. डी. एन. ए. पुस्तकालय निर्माण किट (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग निर्माता के विनिर्देशों के अनुसार गैर-रेडियोलेबल सी. डी. एन. ए. उत्पन्न करने के लिए किया गया था।", "एक बायोटिन-एटबी2-ओलिगो (डीटी) प्राइमर को एमआरएनए में संकरित किया गया था।", "पहले स्ट्रैंड सी. डी. एन. ए. को सुपरस्क्रिप्ट II रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस के माध्यम से संश्लेषित किया गया था।", "डी. एन. ए. पोलीमरेज़ I का उपयोग सी. डी. एन. ए. के दूसरे स्ट्रैंड को उत्पन्न करने के लिए किया गया था।", "ए. टी. बी. 1 एडाप्टरों को सी. डी. एन. ए. के 5 'छोर पर लगाया गया था।", "अवशिष्ट एडाप्टरों को हटाने के लिए सी. डी. एन. ए. को स्तंभ अंशन द्वारा शुद्ध किया गया था।", "साइट-विशिष्ट पुनर्संयोजन के माध्यम से, ए. टी. बी.-पार्श्व सी. डी. एन. ए. को सीधे पी. डी. एन. आर.-222 वेक्टर (जीवन प्रौद्योगिकियां) में प्रतिरूपित किया गया था।", "विद्युत-मैक्स डी. एच. 10बी कोशिकाओं (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके बंधनों को परिवर्तित किया गया था।", "परिवर्तित कोशिकाएँ 50 माइक्रोग्राम/मिली कैनामाइसिन वाली एल. बी. प्लेटों पर फैली हुई थीं।", "एम. आर. एन. ए. का उपयोग सी. डी. एन. ए. पुस्तकालय निर्माण के लिए टेम्पलेट के रूप में आरोप एच. एफ. रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस किट (फुर्तीली प्रौद्योगिकियां) और स्मार्ट प्राइमर (जीवन प्रौद्योगिकियां) का उपयोग करके किया गया था।", "पी. सी. आर. चक्र अनुकूलन स्मार्ट प्राइमर और क्लोनटेक लाभ-एच. एफ. 2 पॉलीमरेज़ मिश्रण (क्लोनटेक/टकारा बायो) का उपयोग करके पूर्ण लंबाई के सी. डी. एन. ए. उत्पादों को न्यूनतम रूप से बढ़ाने के लिए थ्रेसहोल्ड चक्र संख्या निर्धारित करने के लिए किया गया था।", "ट्रिमर किट (एव्रोजन) का उपयोग करके पुस्तकालय सामान्यीकरण पूरा किया गया था।", "पी. सी. आर. चक्र अनुकूलन को सामान्यीकृत सी. डी. एन. ए. के साथ किया गया था ताकि पहले उल्लिखित स्मार्ट प्राइमर और क्लोनटेक लाभ-एच. एफ. 2 पोलीमरेज़ मिश्रण का उपयोग करके सीमा चक्र संख्या निर्धारित की जा सके।", "अंत में, 5 'और 3' एडाप्टर का छेदन एम. एम. ई. आई. का उपयोग करके प्रतिबंध एक्सोन्यूक्लीज़ पाचन द्वारा किया गया था।", "एंप्योर पैरामैग्नेटिक बीड्स (एगेनकोर्ट, बेकमैन कुल्टर जीनोमिक्स) का उपयोग करके एक्साइज्ड एडाप्टर को हटा दिया गया था।", "अबी3730 और रोचे/454 प्लेटफार्मों पर अनुक्रमण के लिए दो प्रकार के पुस्तकालय तैयार किए गए थे।", "एबीआई3730 प्लेटफॉर्म पर अनुक्रमण के लिए बनाए गए पुस्तकालयों के लिए, अंतिम सीडीएनए उत्पाद को नेबुलाइज किया गया था, एंड रिपेयर (ल्यूसिन्जेन) किया गया था, और आकार का चयन 0.8% सीकेम अगरोज टे जेल से किया गया था।", "अंश को कियाकिक जेल निष्कर्षण (कियागेन) प्रोटोकॉल में निर्माता के निर्देशों के अनुसार शुद्ध किया गया था और पी. एस. एम. आर. टी. एच. सी.-केन वेक्टर सिस्टम (ल्यूसिजेन) में संलग्न किया गया था।", "ई का उपयोग करके बंधनों को परिवर्तित किया गया था।", "कोलाई कोशिकाएँ (ल्यूसिन्जेन)।", "परिवर्तित कोशिकाओं को 50 माइक्रोग्राम/मिली कैनामाइसिन वाली एल. बी. प्लेटों पर फैलाया गया था।", "निर्माता के प्रोटोकॉल में उल्लिखित सी. डी. एन. ए. के साथ जी. एस. डी. एन. ए. पुस्तकालय तैयारी किट (रोचे) का उपयोग करके एक 454 खंड पुस्तकालय का निर्माण किया गया था।", "सी. डी. एन. ए. के पाँच माइक्रोग्राम को नेब्युलाइजेशन के माध्यम से विखंडित किया गया था।", "खण्डित सी. डी. एन. ए. का आकार एक एम्प्योर बीड (एगेनकोर्ट, बेकमैन कुल्टर जीनोमिक्स) सफाई के साथ चुना गया था, जिसमें 300 बी. पी. से कम के टुकड़ों को हटाया गया था।", "सी. डी. एन. ए. को अंत में पॉलिश किया गया था और टाइटेनियम जनरल लाइब्रेरी किट (रोच) से अभिकर्मकों का उपयोग करके 454 टाइटेनियम लाइब्रेरी एडाप्टरों में लिगेट किया गया था।", "लाइब्रेरी एडाप्टर डाइमर और 400 बी. पी. से कम लंबाई के सी. डी. एन. ए. टुकड़ों को हटाने के लिए एक एम्प्योर (एगेनकोर्ट) बीड क्लीनअप किया गया था।", "454 पुस्तकालय को स्ट्रेपाविडिन मोतियों (-रोचे) और सोडियम हाइड्रॉक्साइड के साथ एकल फंसे हुए के साथ स्थिर किया गया था।", "एकल फंसे हुए पुस्तकालय की मात्रा क्यूबिट फ्लोरोमीटर (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके एक मात्रा-यह एकल फंसे हुए डीएनए परख द्वारा निर्धारित की गई थी और जैव विश्लेषक 2100 (फुर्तीली प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके प्रामाणिकता को मान्य किया गया था।", "प्रतिरूपण प्रवर्धन किट (रोचे) का उपयोग करके पुस्तकालय के टुकड़ों को डी. एन. ए. कैप्चर मोतियों पर स्थिर किया गया था।", "डी. एन. ए. टेम्पलेट को बढ़ाने के लिए कब्जा किए गए डी. एन. ए. पुस्तकालय को पायसीकृत किया गया और पी. सी. आर. के अधीन किया गया।", "पायस रासायनिक रूप से टूट गया था और डी. एन. ए. वाले मोतियों को बरामद किया गया था, धोया गया था और मोती पुनर्प्राप्ति अभिकर्मकों (रोचे) का उपयोग करके समृद्ध किया गया था।", "डी. एन. ए. पुस्तकालय के मोतियों को एक पिकोटिटरप्लेट उपकरण पर लोड किया गया था और जी. एस. एफ. एल. एक्स. टाइटेनियम अनुक्रमण किट एक्स. एल. आर. 70 (रोचे) का उपयोग करके जीनोम अनुक्रमण उपकरण पर अनुक्रमित किया गया था।", "जीनोमिक पुस्तकालय निर्माण और अनुक्रमण", "उच्च आणविक वजन वाले जीनोमिक डीएनए को एरिक श्वार्ट्ज द्वारा प्रदान किए गए एक प्रोटोकॉल का उपयोग करके अलग किया गया था, जो एंड्रयू फायर की प्रयोगशाला पर आधारित था और आर से थोड़ा संशोधन किया गया था।", "वाटरस्टन प्रयोगशाला और के।", "क्याँके।", "जीनोमिक डी. एन. ए. की अखंडता को एच. की तीव्रता की तुलना करके सत्यापित किया गया था।", "ईथिडियम ब्रोमाइड से दागदार 1.8% अगरोज जेल पर ज्ञात सांद्रता के लैम्ब्डा मानकों के क्रमिक डाइलूशन के लिए बैक्टीरियोफोरा।", "उपज का निर्धारण एक क्यूबिट फ्लोरोमीटर (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके एक उच्च संवेदनशीलता मात्रा-डबल स्ट्रैंडेड डीएनए परख द्वारा किया गया था।", "निर्माता के प्रोटोकॉल में उल्लिखित 5 माइक्रोग्राम जीनोमिक डीएनए के साथ 454 टाइटेनियम टुकड़े की लाइब्रेरी का निर्माण किया गया था।", "जीनोमिक डीएनए को नेब्युलाइजेशन के माध्यम से विखंडित किया गया था और 500-800 bp के आकार चयन के लिए 1 × tae बफर में एथिडियम ब्रोमाइड के साथ 0.8% जी. टी. जी. सीकेम अगरोज जेल (लोन्जा) पर चलाया गया था।", "विखंडित डी. एन. ए. को कियाकिक जेल निष्कर्षण किट (कियागेन) का उपयोग करके अगरोज जेल से अलग किया गया था।", "चयनित आकार के डी. एन. ए. को अंत में पॉलिश किया गया था और टाइटेनियम जनरल लाइब्रेरी किट (रोच) से अभिकर्मकों का उपयोग करके 454 टाइटेनियम लाइब्रेरी एडाप्टरों में जोड़ा गया था।", "लाइब्रेरी एडाप्टर डाइमर और 400 बी. पी. से कम लंबाई के डी. एन. ए. टुकड़ों को हटाने के लिए एक एम्प्योर (एगेनकोर्ट) बीड क्लीनअप किया गया था।", "454 पुस्तकालय को स्ट्रेपाविडिन मोतियों (रोचे) और सोडियम हाइड्रॉक्साइड के साथ एकल फंसे हुए के साथ स्थिर किया गया था।", "एकल फंसे हुए पुस्तकालय की मात्रा एक क्विट फ्लोरोमीटर (जीवन प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके एक मात्रा-यह एकल फंसे हुए डीएनए परख द्वारा निर्धारित की गई थी और जैव विश्लेषक 2100 (फुर्तीली प्रौद्योगिकियों) का उपयोग करके प्रामाणिकता को मान्य किया गया था।", "प्रतिरूपण प्रवर्धन किट का उपयोग करके पुस्तकालय के टुकड़ों को डी. एन. ए. कैप्चर मोतियों पर स्थिर किया गया था।", "डी. एन. ए. टेम्पलेट को बढ़ाने के लिए कब्जा किए गए डी. एन. ए. पुस्तकालय को पायसीकृत किया गया और पी. सी. आर. के अधीन किया गया।", "पायस रासायनिक रूप से टूट गया था और डी. एन. ए. वाले मोतियों को बरामद किया गया था, धोया गया था और मोती पुनर्प्राप्ति अभिकर्मकों का उपयोग करके समृद्ध किया गया था।", "डी. एन. ए. पुस्तकालय के मोतियों को एक पिकोटिटरप्लेट उपकरण पर लोड किया गया था और जी. एस. एफ. एल. एक्स. टाइटेनियम अनुक्रमण किट एक्स. एल. आर. 70 (रोचे) का उपयोग करके जीनोम अनुक्रमण उपकरण पर अनुक्रमित किया गया था।", "टुकड़ों से जीनोम अनुक्रम, प्लास्मिड पुस्तकालयों से 3 के. बी. सम्मिलित और जीवाणु कृत्रिम क्लोन पुस्तकालयों की अंतिम अनुक्रमण अनुमानित 26 गुना अनुक्रम कवरेज पर उत्पन्न की गई थी।", "सेलेरा असेंबलर v का उपयोग करके सभी अनुक्रमित पाठों को डी नोवो असेंबली में पढ़ने का प्रयास किया गया था।", "0. संयोजन संख्या एकएम0000000000 के तहत जेनबैंक जीनोम डेटाबेस को असेंबली प्रस्तुत की गई थी।", "मचान को रिपीटमास्कर संस्करण 3.3 का उपयोग करके दोहराने के लिए मुखौटा लगाया गया था।", "स्थानांतरण आर. एन. ए. कोडिंग जीन की भविष्यवाणी ट्रैनस्कैन-से का उपयोग करके की गई थी।", "माइक्रोर्ना, अन्य गैर-कोडिंग आर. एन. ए. और नियामक तत्वों की पहचान करने के लिए, आर. एफ. ए. एम. सहप्रसरण मॉडल को जीनोम के आकार के साथ समायोजित करने के बाद 1ई-8 के ई-मूल्य कटऑफ के साथ, नरक कार्यक्रम का उपयोग करके खोजा गया था।", "प्रोटीन-कोडिंग जीन की भविष्यवाणी स्नैप, ऑगस्टस-, ग्लिमरहम और जीनमार्क के जीन भविष्यवाणी कार्यक्रमों के साथ की गई थी।", "परिणाम अन्य साक्ष्यों के साथ एकीकृत किए गए थे, जिसमें सिम4 के साथ सी. डी. एन. ए. अनुक्रमण द्वारा उत्पन्न ई. एस. टी. एस. के मानचित्रण परिणाम और रैखिक संयोजन विकल्प के साथ जिगसॉ कार्यक्रम द्वारा जेनबैंक गैर-रिडंडेंट (एन. आर.) डेटाबेस और वर्मबेस डब्ल्यू. एस. 220 रिलीज में प्रोटीन के साथ अनुक्रम समानता शामिल है।", "इन-फ्रेम स्टॉप कोडन वाले जीन मॉडल को गलत माना जाता था और इसलिए उन्हें हटा दिया जाता था।", "अनुमानित प्रोटीन-कोडिंग जीन में प्रोटीन डोमेन की भविष्यवाणी 1ई-4 की ई मूल्य सीमा के साथ हम्मर प्रोग्राम का उपयोग करके पी. एफ. ए. एम. की खोज करके की गई थी. तुलना के लिए, अन्य सूत्रकृमि में पी. एफ. ए. एम. डोमेन की भविष्यवाणी करने के लिए समान भविष्यवाणी मापदंडों का उपयोग किया गया था।", "प्रत्येक सूत्रकृमि में प्रत्येक क्षेत्र के लिए एक क्षेत्र समृद्धि सूचकांक की गणना उस क्षेत्र की संख्या को उस सूत्रकृमि प्रजाति में प्रोटीन अनुक्रमों की कुल संख्या के साथ विभाजित करके की गई थी।", "कार्यक्रम टी सांख्यिकी का उपयोग सूत्रकृमि के बीच क्षेत्र समृद्धि सूचकांकों की तुलना करने के लिए किया गया था।", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा प्रोटीन अनुक्रमों को ब्लास्ट2गो कार्यक्रम द्वारा जीन ऑन्टोलॉजी शब्द दिए गए थे जो 1ई-10 के ई मूल्य कटऑफ के साथ स्विसप्रोट डेटाबेस के खिलाफ ब्लास्टप परिणामों के आधार पर थे।", "बैक्टीरियोफोरा, सी।", "एलिगन्स, सी।", "ब्रिग्से, सी।", "जापोनिका, सी।", "रेमानेई, सी।", "ब्रेनेरी, ब्रुगिया मलायी, मेलोइडोगाइन हाप्ला, एम।", "जीनोम से अनुमानित प्रोटीन अनुक्रमों पर ऑर्थोमल कार्यक्रम का उपयोग करके इनकॉग्निटा और प्रिस्टियोंकस पैसिफिकस की पहचान की गई थी।", "एच.", "मेरोप डेटाबेस रिलीज 9.5 में अनुक्रमों की अनुक्रम समानता खोज के आधार पर बैक्टीरियोफोरा प्रोटीज/पेप्टिडेस की भविष्यवाणी की गई थी।", "एच के बीच विचलन समय का अनुमान।", "बैक्टीरियोफोरा और सी।", "एलिगन्स", "हमने एच के लिए सामान्य 350 ऑर्थोलॉग का एक सेट प्राप्त किया।", "बैक्टीरियोफोरा, सी।", "ऑर्थोमकिल के पूर्वानुमान परिणामों के आधार पर एलिगन्स, एनोफेलिस गैम्बिया (वेक्टरबेस से agamp3.4 रिलीज), और होमो सेपियन्स (एनसेम्बल रिलीज 55)।", "प्रत्येक ऑर्थोलॉग सेट के लिए, प्रोटीन अनुक्रमों को क्लस्टल डब्ल्यू 2 का उपयोग करके संरेखित किया गया था, जिसके बाद उनके मूल प्रतिलेख अनुक्रमों में विपरीत अनुवाद किया गया था जो प्रोटीन अनुक्रमों के समान संबंधित डेटाबेस से प्राप्त किए गए थे।", "फाइलिप प्रारूप में परिवर्तन के बाद, संरेखण का उपयोग फाइलिप (फाइलोजेनी अनुमान पैकेज;) में डीनाडिस्ट कार्यक्रम का उपयोग करके वर्गीकरण के बीच आनुवंशिक दूरी का अनुमान लगाने के लिए किया गया था।", "इसके बाद एक जातिजन्य वृक्ष का निर्माण किया गया था जिसमें बाह्य समूह वर्गीकरण के रूप में मानव के साथ जाति-पड़ोसी-जुड़ने वाले एल्गोरिदम का उपयोग किया गया था।", "अनुक्रम संरेखण और जड़ों वाले पड़ोसी-जुड़ने वाले पेड़ का उपयोग पामल में एमसीएमक्ट्री कार्यक्रम (अधिकतम संभावना द्वारा जातिजन्य विश्लेषण) का उपयोग करके विचलन समय का अनुमान लगाने के लिए किया गया था।", "हमने सूत्रकृमि और कीड़ों के विचलन समय के रूप में 800-1000 मिया (मिलियन साल पहले) का उपयोग किया था।", "जीन ऑन्टोलॉजी संवर्धन और चयापचय मार्ग की तुलना", "एच.", "बैक्टीरियोफोरा प्रोटीन अनुक्रमों को ब्लास्ट2गो प्रोग्राम द्वारा 1ई-10 के ई-मूल्य कटऑफ के साथ स्विसप्रोट डेटाबेस के खिलाफ ब्लास्टप परिणामों के आधार पर जीन ऑन्टोलॉजी (गो) शब्द दिए गए थे. तुलना में, अन्य 9 सूत्रकृमि जीनोम के प्रोटीनों का विश्लेषण समान कार्यक्रमों और डेटाबेस का उपयोग करके किया गया था।", "जोड़ी के अनुसार एच का उपयोग करके संवर्धन करें।", "संदर्भ के रूप में बैक्टीरियोफोरा अनुक्रम गपशप कार्यक्रम का उपयोग करके किया गया था।", "चयापचय मार्गों में केग (जीन और जीनोम का क्योटो विश्वकोश) ऑन्टोलॉजी (को) को चार सूत्रकृमि प्रजातियों की तुलना के लिए ब्लास्ट2गो कार्यक्रम का उपयोग करके सौंपा गया था।", "हेटेरोहैब्डाइटिस बैक्टीरियोफोरा जीनोम में अनुमानित जीन मॉडल।", "अवधारणात्मक रूप से अनुवादित एच की अनुक्रम समानता।", "सी के लिए बैक्टीरियोहोरा प्रोटीन।", "कृमि-आधार में एलिगेंस प्रोटीन डब्ल्यू220 छोड़ता है।", "इस अध्ययन में 10 सूत्रकृमि प्रजातियों के प्रोटीन में भविष्यवाणी किए गए पी. एफ. ए. एम. क्षेत्रों की तुलना।", "एच में नाविक डी. एन. ए. रूपांकनों का अनुमान लगाया गया।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "सी में अनुमानित नाविक डी. एन. ए. रूपांकनों।", "तालिका एस4 में परिणाम उत्पन्न करने के लिए उपयोग किए जाने वाले समान मापदंडों का उपयोग करके एलिगेंस जीनोम।", "एच में गैर-प्रोटीन-कोडिंग आरएनए का अनुमान लगाया गया।", "बैक्टीरियोहोरा जीनोम।", "एच में अनुमानित टी. आर. एन. ए. जीन।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "एच में अनुमानित माइक्रोसैटेलाइट स्थान।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "एच में अनुमानित स्राव।", "बैक्टीरियोफोरा जीनोम।", "इस अध्ययन में शामिल 10 नेमटोड प्रजातियों में जीन को सौंपे गए जीन ऑन्टोलॉजी शब्दों की तुलना।", "इस अध्ययन में शामिल 10 सूत्रकृमि प्रजातियों में अनुमानित जीन और जीनोम (केग) मार्गों के क्योटो विश्वकोश की तुलना।", "इस अध्ययन में शामिल 10 सूत्रकृमि प्रजातियों में केग ऑन्टोलॉजी में चयापचय मार्गों की तुलना।", "हम समर्थन के लिए ई. पी. एन. और ई. पी. बी. अंतर्राष्ट्रीय जीनोम अनुक्रम संघ के सदस्यों और वाशिंगटन विश्वविद्यालय स्कूल ऑफ मेडिसिन के जीनोम संस्थान, सेंट.", "जीनोम के अनुक्रमण के लिए लुई, मो, यू. एस. ए.", "प्रयोगों की कल्पना और डिजाइनः पी. एस. जी. टेक एस. सी. बी. जे. ए. पी. डब्ल्यू. एस. आर. जी. जे. एस. आर. के. डब्ल्यू. एक्स. बी.", "प्रयोगों का प्रदर्शन कियाः xb kk tac psg sc js।", "डेटा का विश्लेषण कियाः xb bja pws।", "योगदान अभिकर्मकों/सामग्रियों/विश्लेषण उपकरणोंः xb psg rkw js sc tac।", "पेपर लिखाः एक्सबी पीएसजी टाक बीजेए पीडब्ल्यूएस आरजी जेएस एससी आरकेडब्ल्यू।", "बोंगर्स टी, फेरिस एच (1999) पर्यावरण निगरानी में एक जैव संकेतक के रूप में सूत्रकृमि सामुदायिक संरचना।", "पारिस्थितिकी और विकास 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