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AlbericDeLajarte commited on
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fe896df
1 Parent(s): 096b0fa

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  # PDB
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- upload_date: 2023-12-05 14:54:35
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- - 137 duplicate sequences with the same structure / dms
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- - 25 duplicate sequences with different structure / dms
 
11
  ---
12
 
13
  # PDB
14
+ upload_date: 2023-12-06 13:27:53
15
  user: alberic
16
  source: `bpSEQ_files_pdbee` (BPSEQ files format)
17
 
 
19
  - structure (Read from source.)
20
 
21
  Filtering report:
22
+ Over a total of 443 datapoints, there are:
23
+ - 334 valid datapoints
24
  - 0 invalid datapoints (ex: sequence with non-regular characters)
25
  - 0 datapoints with the same reference
26
+ - 50 duplicate sequences with the same structure / dms
27
+ - 59 duplicate sequences with different structure / dms
data.json CHANGED
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info.json CHANGED
@@ -1,9 +1,9 @@
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  "name": "PDB",
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9
  }
 
1
  {
2
  "name": "PDB",
3
+ "upload_date": "2023-12-06 13:27:53",
4
  "user": "alberic",
5
  "source": "`bpSEQ_files_pdbee` (BPSEQ files format)",
6
  "structure": "source",
7
  "about structure": "Read from source.",
8
+ "filtering_report": "Over a total of 443 datapoints, there are:\n - 334 valid datapoints\n - 0 invalid datapoints (ex: sequence with non-regular characters)\n - 0 datapoints with the same reference\n - 50 duplicate sequences with the same structure / dms\n - 59 duplicate sequences with different structure / dms"
9
  }
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1
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+ 7 A 0
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1
+ 1 g 41
2
+ 2 G 40
3
+ 3 C 39
4
+ 4 C 38
5
+ 5 G 0
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+ 6 A 0
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8
+ 8 G 0
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+ 9 G 0
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+ 11 A 0
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+ 22 U 0
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+ 26 C 16
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+ 34 A 0
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40
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+ 41 C 1
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1
+ 1 g 17
2
+ 2 G 16
3
+ 3 G 15
4
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+ 6 C 0
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8
+ 8 C 0
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+ 9 A 0
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+ 10 A 0
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+ 13 C 5
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+ 32 G 18
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+ 34 C 0
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+ 35 A 0
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1
+ 1 g 38
2
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3
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4
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5
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+ 9 C 27
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+ 10 C 26
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13
+ 13 A 0
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+ 17 C 22
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+ 19 A 0
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+ 20 G 0
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+ 21 A 0
22
+ 22 G 17
23
+ 23 A 16
24
+ 24 C 15
25
+ 25 C 14
26
+ 26 G 10
27
+ 27 G 9
28
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30
+ 30 A 0
31
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32
+ 32 A 0
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+ 33 U 6
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+ 34 C 5
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+ 35 A 4
36
+ 36 C 3
37
+ 37 C 2
38
+ 38 C 1
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1
+ 1 g 12
2
+ 2 G 11
3
+ 3 U 10
4
+ 4 G 9
5
+ 5 U 0
6
+ 6 G 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 C 4
10
+ 10 A 3
11
+ 11 C 2
12
+ 12 C 1
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1
+ 1 g 29
2
+ 2 G 28
3
+ 3 C 27
4
+ 4 A 26
5
+ 5 G 25
6
+ 6 A 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 C 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 G 23
11
+ 11 A 22
12
+ 12 G 21
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+ 13 C 20
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+ 14 C 0
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+ 25 C 5
26
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27
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+ 28 C 2
29
+ 29 C 1
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1
+ 1 g 29
2
+ 2 G 28
3
+ 3 A 27
4
+ 4 G 26
5
+ 5 U 25
6
+ 6 G 24
7
+ 7 C 0
8
+ 8 U 23
9
+ 9 U 22
10
+ 10 C 21
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+ 29 C 1
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1
+ 1 g 19
2
+ 2 G 18
3
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4
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8
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9
+ 9 C 0
10
+ 10 U 0
11
+ 11 C 0
12
+ 12 G 0
13
+ 13 C 0
14
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+ 17 G 3
18
+ 18 C 2
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+ 19 C 1
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1
+ 1 g 16
2
+ 2 G 15
3
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4
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6
+ 6 C 11
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+ 7 A 0
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+ 8 G 0
9
+ 9 A 0
10
+ 10 A 0
11
+ 11 G 6
12
+ 12 G 5
13
+ 13 U 4
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+ 14 C 3
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+ 15 C 2
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+ 16 C 1
17
+ 17 G 0
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1
+ 1 g 14
2
+ 2 C 13
3
+ 3 U 12
4
+ 4 C 11
5
+ 5 C 10
6
+ 6 A 0
7
+ 7 G 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 G 5
11
+ 11 G 4
12
+ 12 A 3
13
+ 13 G 2
14
+ 14 C 1
15
+ 15 G 0
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@@ -0,0 +1,38 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 38
2
+ 2 G 37
3
+ 3 U 36
4
+ 4 G 35
5
+ 5 C 34
6
+ 6 A 0
7
+ 7 G 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 A 0
10
+ 10 A 0
11
+ 11 C 0
12
+ 12 A 0
13
+ 13 G 24
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+ 14 C 23
15
+ 15 G 22
16
+ 16 C 21
17
+ 17 U 0
18
+ 18 U 0
19
+ 19 C 0
20
+ 20 G 0
21
+ 21 G 16
22
+ 22 C 15
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+ 29 A 0
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+ 30 U 0
31
+ 31 U 0
32
+ 32 A 0
33
+ 33 C 0
34
+ 34 G 5
35
+ 35 C 4
36
+ 36 A 3
37
+ 37 C 2
38
+ 38 C 1
source/bpSEQ_files_pdbee/1BGZ-2D.bpseq ADDED
@@ -0,0 +1,23 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 23
2
+ 2 G 22
3
+ 3 G 21
4
+ 4 A 20
5
+ 5 U 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 C 19
8
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+ 9 G 16
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+ 10 C 15
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12
+ 12 U 0
13
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+ 14 G 0
15
+ 15 G 10
16
+ 16 U 9
17
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18
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1
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1
+ 1 g 2902
2
+ 2 G 2901
3
+ 3 U 2900
4
+ 4 U 2899
5
+ 5 A 2898
6
+ 6 A 2897
7
+ 7 G 2896
8
+ 8 C 2895
9
+ 9 G 0
10
+ 10 A 0
11
+ 11 C 0
12
+ 12 U 0
13
+ 13 A 0
14
+ 14 A 0
15
+ 15 G 0
16
+ 16 C 524
17
+ 17 G 523
18
+ 18 U 522
19
+ 19 A 521
20
+ 20 C 520
21
+ 21 A 519
22
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996
+ 996 A 1159
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+ 997 G 1158
998
+ 998 C 1157
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+ 1000 A 0
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+ 1001 A 0
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+ 1366 A 0
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+ 1384 A 0
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+ 1836 C 1904
1837
+ 1837 C 1903
1838
+ 1838 C 0
1839
+ 1839 G 0
1840
+ 1840 G 1902
1841
+ 1841 U 1901
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+ 1842 G 0
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+ 1843 C 1897
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+ 1844 C 1896
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+ 1845 G 1895
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+ 1846 G 1894
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+ 1847 A 0
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+ 1848 A 0
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+ 1849 G 1893
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+ 1850 G 1892
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+ 1851 U 0
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+ 1852 U 0
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+ 1853 A 0
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+ 1854 A 0
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+ 1855 U 0
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+ 1856 U 0
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+ 1859 U 0
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+ 1860 G 0
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+ 1861 G 1881
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+ 1862 G 0
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+ 1864 U 0
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+ 1865 U 1877
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+ 1866 A 0
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+ 1871 A 0
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+ 1872 A 0
1873
+ 1873 G 1868
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+ 1881 C 1861
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+ 1883 U 0
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+ 1890 A 0
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+ 1895 C 1845
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+ 1900 A 0
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+ 2002 G 1658
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1
+ 1 u 119
2
+ 2 G 118
3
+ 3 C 117
4
+ 4 C 116
5
+ 5 U 115
6
+ 6 G 114
7
+ 7 G 113
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+ 8 C 112
9
+ 9 G 0
10
+ 10 G 110
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+ 27 C 0
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+ 28 C 0
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+ 30 C 0
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+ 44 G 0
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+ 45 A 0
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+ 46 A 0
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48
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49
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+ 50 A 32
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+ 58 A 0
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+ 59 A 0
60
+ 60 C 23
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62
+ 62 C 21
63
+ 63 C 20
64
+ 64 G 19
65
+ 65 U 0
66
+ 66 A 0
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+ 68 C 16
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+ 69 G 0
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+ 70 C 106
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+ 71 C 105
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+ 75 G 0
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+ 76 G 0
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+ 78 A 0
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+ 80 U 96
81
+ 81 G 95
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+ 82 U 94
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1
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2
+ 2 G 42
3
+ 3 C 41
4
+ 4 G 40
5
+ 5 U 39
6
+ 6 U 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 C 0
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+ 10 C 0
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+ 11 A 0
12
+ 12 G 35
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+ 18 G 0
19
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+ 24 A 0
25
+ 25 A 0
26
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28
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29
+ 29 A 0
30
+ 30 G 0
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+ 31 C 0
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+ 32 A 0
33
+ 33 G 14
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+ 35 C 12
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+ 36 A 0
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+ 37 A 0
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39
+ 39 G 5
40
+ 40 C 4
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43
+ 43 C 1
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1
+ 1 g 43
2
+ 2 G 42
3
+ 3 C 41
4
+ 4 G 40
5
+ 5 U 39
6
+ 6 U 38
7
+ 7 U 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 C 0
10
+ 10 C 0
11
+ 11 A 0
12
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+ 18 G 0
19
+ 19 U 28
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+ 43 C 1
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1
+ 1 g 21
2
+ 2 G 20
3
+ 3 G 19
4
+ 4 a 18
5
+ 5 U 17
6
+ 6 C 16
7
+ 7 a 0
8
+ 8 C 15
9
+ 9 C 14
10
+ 10 a 0
11
+ 11 U 0
12
+ 12 U 0
13
+ 13 a 0
14
+ 14 G 9
15
+ 15 G 8
16
+ 16 G 6
17
+ 17 a 5
18
+ 18 U 4
19
+ 19 C 3
20
+ 20 U 2
21
+ 21 C 1
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@@ -0,0 +1,21 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 21
2
+ 2 G 20
3
+ 3 G 19
4
+ 4 A 18
5
+ 5 U 17
6
+ 6 C 16
7
+ 7 A 0
8
+ 8 C 15
9
+ 9 C 14
10
+ 10 A 0
11
+ 11 U 0
12
+ 12 U 0
13
+ 13 A 0
14
+ 14 G 9
15
+ 15 G 8
16
+ 16 G 6
17
+ 17 A 5
18
+ 18 U 4
19
+ 19 C 3
20
+ 20 U 2
21
+ 21 C 1
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1
+ 1 g 24
2
+ 2 U 23
3
+ 3 G 22
4
+ 4 C 21
5
+ 5 G 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 G 17
9
+ 9 A 16
10
+ 10 C 15
11
+ 11 G 0
12
+ 12 A 0
13
+ 13 A 0
14
+ 14 A 0
15
+ 15 G 10
16
+ 16 U 9
17
+ 17 C 8
18
+ 18 C 0
19
+ 19 G 0
20
+ 20 A 0
21
+ 21 G 4
22
+ 22 C 3
23
+ 23 G 2
24
+ 24 C 1
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1
+ 1 g 19
2
+ 2 C 18
3
+ 3 G 17
4
+ 4 G 16
5
+ 5 C 15
6
+ 6 C 14
7
+ 7 A 0
8
+ 8 G 34
9
+ 9 C 33
10
+ 10 U 32
11
+ 11 C 31
12
+ 12 C 30
13
+ 13 A 29
14
+ 14 G 6
15
+ 15 G 5
16
+ 16 C 4
17
+ 17 C 3
18
+ 18 G 2
19
+ 19 C 1
20
+ 20 C 0
21
+ 21 A 0
22
+ 22 A 0
23
+ 23 A 0
24
+ 24 C 0
25
+ 25 A 0
26
+ 26 A 0
27
+ 27 U 0
28
+ 28 A 0
29
+ 29 U 13
30
+ 30 G 12
31
+ 31 G 11
32
+ 32 A 10
33
+ 33 G 9
34
+ 34 C 8
35
+ 35 A 0
36
+ 36 C 0
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1
+ 1 g 29
2
+ 2 G 28
3
+ 3 U 27
4
+ 4 G 26
5
+ 5 G 0
6
+ 6 G 0
7
+ 7 C 22
8
+ 8 G 21
9
+ 9 C 20
10
+ 10 A 19
11
+ 11 G 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 C 11
19
+ 19 U 10
20
+ 20 G 9
21
+ 21 C 8
22
+ 22 G 7
23
+ 23 G 0
24
+ 24 U 0
25
+ 25 A 0
26
+ 26 C 4
27
+ 27 A 3
28
+ 28 C 2
29
+ 29 C 1
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1
+ 1 g 30
2
+ 2 G 29
3
+ 3 U 28
4
+ 4 G 27
5
+ 5 G 0
6
+ 6 G 0
7
+ 7 C 23
8
+ 8 G 22
9
+ 9 C 20
10
+ 10 A 19
11
+ 11 G 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 C 11
19
+ 19 U 10
20
+ 20 G 9
21
+ 21 A 0
22
+ 22 C 8
23
+ 23 G 7
24
+ 24 G 0
25
+ 25 U 0
26
+ 26 A 0
27
+ 27 C 4
28
+ 28 A 3
29
+ 29 C 2
30
+ 30 C 1
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1
+ 1 g 29
2
+ 2 G 28
3
+ 3 U 27
4
+ 4 G 26
5
+ 5 G 0
6
+ 6 G 0
7
+ 7 C 22
8
+ 8 G 21
9
+ 9 C 20
10
+ 10 A 19
11
+ 11 G 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 C 11
19
+ 19 U 10
20
+ 20 G 9
21
+ 21 C 8
22
+ 22 G 7
23
+ 23 G 0
24
+ 24 U 0
25
+ 25 A 0
26
+ 26 C 4
27
+ 27 A 3
28
+ 28 C 2
29
+ 29 C 1
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1
+ 1 g 13
2
+ 2 G 12
3
+ 3 U 11
4
+ 4 G 10
5
+ 5 C 9
6
+ 6 A 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 G 5
10
+ 10 C 4
11
+ 11 A 3
12
+ 12 C 2
13
+ 13 C 1
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1
+ 1 G 19
2
+ 2 G 18
3
+ 3 C 17
4
+ 4 G 16
5
+ 5 A 0
6
+ 6 C 13
7
+ 7 U 12
8
+ 8 G 0
9
+ 9 G 0
10
+ 10 U 0
11
+ 11 G 0
12
+ 12 A 7
13
+ 13 G 6
14
+ 14 U 0
15
+ 15 A 0
16
+ 16 C 4
17
+ 17 G 3
18
+ 18 C 2
19
+ 19 C 1
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1
+ 1 g 27
2
+ 2 G 26
3
+ 3 A 25
4
+ 4 A 24
5
+ 5 G 23
6
+ 6 U 0
7
+ 7 C 22
8
+ 8 C 21
9
+ 9 G 20
10
+ 10 G 19
11
+ 11 U 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 A 11
19
+ 19 C 10
20
+ 20 C 9
21
+ 21 G 8
22
+ 22 G 7
23
+ 23 C 5
24
+ 24 U 4
25
+ 25 U 3
26
+ 26 C 2
27
+ 27 C 1
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@@ -0,0 +1,27 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 27
2
+ 2 G 26
3
+ 3 A 25
4
+ 4 A 24
5
+ 5 G 23
6
+ 6 U 22
7
+ 7 U 0
8
+ 8 C 21
9
+ 9 G 20
10
+ 10 G 19
11
+ 11 U 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 A 11
19
+ 19 C 10
20
+ 20 C 9
21
+ 21 G 8
22
+ 22 G 6
23
+ 23 C 5
24
+ 24 U 4
25
+ 25 U 3
26
+ 26 C 2
27
+ 27 C 1
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@@ -0,0 +1,27 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 27
2
+ 2 G 26
3
+ 3 A 25
4
+ 4 A 24
5
+ 5 G 23
6
+ 6 U 0
7
+ 7 C 22
8
+ 8 C 21
9
+ 9 G 20
10
+ 10 G 19
11
+ 11 U 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 A 11
19
+ 19 C 10
20
+ 20 C 9
21
+ 21 G 8
22
+ 22 G 7
23
+ 23 C 5
24
+ 24 U 4
25
+ 25 U 3
26
+ 26 C 2
27
+ 27 C 1
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@@ -0,0 +1,27 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 27
2
+ 2 G 26
3
+ 3 A 25
4
+ 4 A 24
5
+ 5 G 23
6
+ 6 U 22
7
+ 7 U 0
8
+ 8 C 21
9
+ 9 G 20
10
+ 10 G 19
11
+ 11 U 18
12
+ 12 C 17
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 C 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 12
18
+ 18 A 11
19
+ 19 C 10
20
+ 20 C 9
21
+ 21 G 8
22
+ 22 G 6
23
+ 23 C 5
24
+ 24 U 4
25
+ 25 U 3
26
+ 26 C 2
27
+ 27 C 1
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1
+ 1 g 0
2
+ 2 G 28
3
+ 3 C 27
4
+ 4 C 26
5
+ 5 G 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 G 0
8
+ 8 U 0
9
+ 9 A 0
10
+ 10 G 21
11
+ 11 U 20
12
+ 12 G 19
13
+ 13 U 0
14
+ 14 U 0
15
+ 15 G 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 G 0
18
+ 18 U 0
19
+ 19 C 12
20
+ 20 G 11
21
+ 21 C 10
22
+ 22 G 0
23
+ 23 A 0
24
+ 24 A 0
25
+ 25 A 0
26
+ 26 G 4
27
+ 27 G 3
28
+ 28 C 2
29
+ 29 C 0
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1
+ 1 g 14
2
+ 2 G 13
3
+ 3 C 12
4
+ 4 C 11
5
+ 5 U 10
6
+ 6 G 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 U 0
9
+ 9 A 0
10
+ 10 G 5
11
+ 11 G 4
12
+ 12 G 3
13
+ 13 U 2
14
+ 14 C 1
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1
+ 1 g 22
2
+ 2 G 21
3
+ 3 C 20
4
+ 4 G 19
5
+ 5 A 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 G 16
8
+ 8 U 15
9
+ 9 C 14
10
+ 10 G 0
11
+ 11 A 0
12
+ 12 A 0
13
+ 13 A 0
14
+ 14 G 9
15
+ 15 A 8
16
+ 16 U 7
17
+ 17 G 0
18
+ 18 G 0
19
+ 19 C 4
20
+ 20 G 3
21
+ 21 C 2
22
+ 22 C 1
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1
+ 1 g 17
2
+ 2 C 16
3
+ 3 A 15
4
+ 4 G 14
5
+ 5 A 13
6
+ 6 C 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 U 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 U 0
11
+ 11 a 0
12
+ 12 A 0
13
+ 13 U 5
14
+ 14 C 4
15
+ 15 U 3
16
+ 16 G 2
17
+ 17 C 1
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1
+ 1 g 14
2
+ 2 G 13
3
+ 3 C 12
4
+ 4 G 0
5
+ 5 G 0
6
+ 6 U 0
7
+ 7 G 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 A 0
10
+ 10 A 0
11
+ 11 U 0
12
+ 12 G 3
13
+ 13 C 2
14
+ 14 C 1
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1
+ 1 u 17
2
+ 2 C 16
3
+ 3 A 15
4
+ 4 G 14
5
+ 5 A 0
6
+ 6 C 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 u 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 U 0
11
+ 11 a 0
12
+ 12 A 0
13
+ 13 u 0
14
+ 14 C 4
15
+ 15 U 3
16
+ 16 G 2
17
+ 17 A 1
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1
+ 1 g 27
2
+ 2 C 26
3
+ 3 C 25
4
+ 4 G 0
5
+ 5 A 0
6
+ 6 G 0
7
+ 7 U 0
8
+ 8 A 0
9
+ 9 G 20
10
+ 10 U 19
11
+ 11 G 18
12
+ 12 U 0
13
+ 13 U 0
14
+ 14 G 0
15
+ 15 G 0
16
+ 16 G 0
17
+ 17 U 0
18
+ 18 C 11
19
+ 19 G 10
20
+ 20 C 9
21
+ 21 G 0
22
+ 22 A 0
23
+ 23 A 0
24
+ 24 A 0
25
+ 25 G 3
26
+ 26 G 2
27
+ 27 C 1
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@@ -0,0 +1,27 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 27
2
+ 2 G 26
3
+ 3 C 25
4
+ 4 G 24
5
+ 5 U 0
6
+ 6 C 22
7
+ 7 G 0
8
+ 8 C 19
9
+ 9 A 18
10
+ 10 C 17
11
+ 11 C 16
12
+ 12 U 0
13
+ 13 U 0
14
+ 14 C 0
15
+ 15 G 0
16
+ 16 G 11
17
+ 17 G 10
18
+ 18 U 9
19
+ 19 G 8
20
+ 20 A 0
21
+ 21 A 0
22
+ 22 G 6
23
+ 23 U 0
24
+ 24 C 4
25
+ 25 G 3
26
+ 26 C 2
27
+ 27 C 1
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@@ -0,0 +1,20 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 20
2
+ 2 G 19
3
+ 3 G 18
4
+ 4 A 17
5
+ 5 U 16
6
+ 6 A 15
7
+ 7 A 14
8
+ 8 C 13
9
+ 9 U 0
10
+ 10 U 0
11
+ 11 C 0
12
+ 12 G 0
13
+ 13 G 8
14
+ 14 U 7
15
+ 15 U 6
16
+ 16 G 5
17
+ 17 U 4
18
+ 18 C 3
19
+ 19 C 2
20
+ 20 C 1
source/bpSEQ_files_pdbee/1HS1-2D.bpseq ADDED
@@ -0,0 +1,13 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 12
2
+ 2 C 11
3
+ 3 G 10
4
+ 4 U 0
5
+ 5 U 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 C 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 C 3
11
+ 11 G 2
12
+ 12 C 1
13
+ 13 A 0
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@@ -0,0 +1,13 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 12
2
+ 2 C 11
3
+ 3 G 10
4
+ 4 U 0
5
+ 5 U 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 G 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 C 3
11
+ 11 G 2
12
+ 12 C 1
13
+ 13 A 0
source/bpSEQ_files_pdbee/1HS3-2D.bpseq ADDED
@@ -0,0 +1,13 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ 1 g 12
2
+ 2 C 11
3
+ 3 G 10
4
+ 4 U 0
5
+ 5 U 0
6
+ 6 A 0
7
+ 7 A 0
8
+ 8 U 0
9
+ 9 U 0
10
+ 10 C 3
11
+ 11 G 2
12
+ 12 C 1
13
+ 13 A 0